1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
ACATGAAGGAAAAGAAACTGACAGTAGTTGGGGATGTTGATATAATAATTATGGTGAAACAATTGAGAAAGCTTTGTCACACAGAGTTAGTCACGGTTGGgtcaccagcataagcagtagacaagatgaatgaggagaaagaaaatggagccaacgagtggtgaaattataattcgacttaaagtcaaattagaataggt...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv16s0050g01230.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACATGAAGGAAAAGAAACTGACAGTAGTTGGGGATGTTGATATAATAATTATGGTGAAACAATTGAGAAAGCTTTGTCACACAGAGTTAGTCACGGTTGGgtcaccagcataagcagtagacaagatgaatgaggagaaagaaaatggagccaacgagtggtgaaattataattcgacttaaagtcaaattagaataggt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gacaaga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gaggaga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aagaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggtgaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaagtcaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -agaatagg