1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
ACAATATGGTTCGAAATTTTTGAGTGATGGACAGCCTGGTACTGCCCAAAATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgataccgtacattgtggtgtaaaactttgatctatatacatgcgtgtgtgtatacatacatacatatatatatatatatatatattacccttg...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv15s0048g01890.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|71855306|gb|DT004361.1|DT004361
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|27585704|gb|CB008399.1|CB008399
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161718258|gb|FC066959.1|FC066959
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30256397|gb|CB972240.1|CB972240
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|34543960|gb|CF512192.1|CF512192
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30254158|gb|CB971173.1|CB971173
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26260326|gb|CA811389.1|CA811389
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110701786|gb|EE079758.1|EE079758
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30255822|gb|CB971954.1|CB971954
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110413573|gb|EC979363.1|EC979363
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30326206|gb|CD009468.1|CD009468
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|32267406|gb|CD716369.1|CD716369
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|33408880|gb|CF214507.1|CF214507
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30253808|gb|CB971093.1|CB971093
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: GAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30128631|gb|CB913970.1|CB913970
genomic: GAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30323004|gb|CD006266.1|CD006266
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|18459069|gb|BM437358.1|BM437358
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|32269651|gb|CD718810.1|CD718810
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161716547|gb|FC066220.1|FC066220
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|28961058|gb|CB340537.1|CB340537
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|18458719|gb|BM436997.1|BM436997
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|71879185|gb|DT028240.1|DT028240
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|37190433|gb|CF609782.1|CF609782
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTCGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26257001|gb|CA808064.1|CA808064
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|156735526|gb|EV239647.1|EV239647
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|34544048|gb|CF512280.1|CF512280
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110687531|gb|EE065043.1|EE065043
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161718317|gb|FC067266.1|FC067266
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26257202|gb|CA808265.1|CA808265
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTACTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|71856241|gb|DT005296.1|DT005296
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCCTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|22012360|gb|BQ797394.1|BQ797394
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATG-TGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30256179|gb|CB972022.1|CB972022
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: AAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|32245233|gb|CD711052.1|CD711052
genomic: AAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: CGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGAGTCCTEST: gi|71856891|gb|DT005946.1|DT005946
genomic: CGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|32265320|gb|CD716909.1|CD716909
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161711302|gb|FC059099.1|FC059099
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|71855655|gb|DT004710.1|DT004710
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|294964069|gb|GW837872.1|GW837872
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|29784482|gb|CB345278.2|CB345278
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30131945|gb|CB917284.1|CB917284
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110730254|gb|EE107122.1|EE107122
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|71859218|gb|DT008273.1|DT008273
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26264426|gb|CA815489.1|CA815489
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTAGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110699462|gb|EE076482.1|EE076482
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110694713|gb|EE072070.1|EE072070
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26262332|gb|CA813395.1|CA813395
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|32272185|gb|CD721344.1|CD721344
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|27583486|gb|CB006181.1|CB006181
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|77583842|gb|DV220955.1|DV220955
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30129202|gb|CB914541.1|CB914541
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161720374|gb|FC069835.1|FC069835
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110404214|gb|EC968923.1|EC968923
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: GCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110702542|gb|EE081378.1|EE081378
genomic: GCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|28960193|gb|CB340097.1|CB340097
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110376382|gb|EC941443.1|EC941443
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30132633|gb|CB917972.1|CB917972
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|161721235|gb|FC070741.1|FC070741
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACTAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110360721|gb|EC924050.1|EC924050
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|110370992|gb|EC934673.1|EC934673
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|30133319|gb|CB918658.1|CB918658
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCTEST: gi|26265906|gb|CA816969.1|CA816969
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
EST: CGGAAAGTTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCCAGCTCCTCAAGGGACTCCEST: gi|30321490|gb|CD004752.1|CD004752
genomic: CGGAAAG-TTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGT-CCAGCTCCTCAAGGGACTCC
EST: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAG TTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
genomic: ATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgat ... ctgattgcagTTTGTCAATGACCTACATGCTCTTATTAGTCCAGCTCCTCAAGGGACTCCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACAATATGGTTCGAAATTTTTGAGTGATGGACAGCCTGGTACTGCCCAAAATGTTGACAAATCAACCAGCTTGGCACGGAAAGTTTTCCGTCTTTTTAAGgttgggtgataccgtacattgtggtgtaaaactttgatctatatacatgcgtgtgtgtatacatacatacatatatatatatatatatatattacccttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gtaaaac