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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAGGAAAAGGCGTATCCAAACCAGAGAAGAGAAAATATTTGTTTTGGCAAATGACTGCTTGACAGGCAATCCTTCTGTTCATGATTTATCATTGACTCAGgtctcaacttcacaatacattgtctattattctaatgtgcctaataaagcttatgaaattctgagcttctggatgtgctatag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv14s0066g00880.t01
intron # 18
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv14s0066g00880.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 18
lower sequence: AT3G27730.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 18
AAGGAAAAGGCGTATCCAAACCAGAGAAGAGAAAATATTTGTTTTGGCAAATGACTGCTTGACAGGCAATCCTTCTGTTCATGATTTATCATTGACTCAGgtc--tcaacttcacaat-acattgtctattattctaatgtg-------cctaataaagcttatgaaattctgagcttctggatgtgctatag
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GCGGAAAAAACGTATCCAAACCAGAGAAGAGAAACTCTTTGTGCTTGCAAATGATTGGTTGACTGGGGATCCTTCAGTCCATGATTTATCCATGACTCAGgtccatcagtattatattcatgactcctatcacttgatcacggttacttcttagctctgcatatgaacatttgaacttttgtctcag------