Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGGgttagttattgctcttctttgttctatatttgcagagcactttaagtaccaaacttgcctttattcaactgtcaatttataactattacag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv13s0074g00450.t01
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110386925|gb|EC951560.1|EC951560
EST:     GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGG                         ATGGATATACGAGAACNTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG
genomic: GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGGgttagttatt ... actattacagATGGATATACGAGAACCTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG
EST: gi|110693473|gb|EE069745.1|EE069745
EST:     GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGG                         ATGGATATACGAGAACCTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG
genomic: GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGGgttagttatt ... actattacagATGGATATACGAGAACCTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG
EST: gi|110419355|gb|EC985574.1|EC985574
EST:     GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGG                         ATGGATATACGAGAACCTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG
genomic: GTATGAACTTCCAGATTCACACCCTCTGTTAAAAGGGgttagttatt ... actattacagATGGATATACGAGAACCTGATGATCCAAGCCCATACCTTCTTGCTATATGG