1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
GTTGGCATGGCTTTTGGAATGCTTCTTGCTCGCATTACAATGGGACACTCTGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctgcttcaatttctgatgctggaatttgtacttcttcacaacatatttaaactgaaaattcatggatgaaggtgttaacttgtgaatattact...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv01s0011g00500.t01 |
intron # | 10 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGAEST: gi|71877796|gb|DT026851.1|DT026851
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGAEST: gi|71878342|gb|DT027397.1|DT027397
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGAEST: gi|71878071|gb|DT027126.1|DT027126
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGAEST: gi|71879077|gb|DT028132.1|DT028132
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGAEST: gi|71880088|gb|DT029143.1|DT029143
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
EST: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATG CAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
genomic: TGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctg ... ttggatgcagCAAACTACAGGGCTGTTCGTTGCCTTATATTAACAACATTGAACAGTGAGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTGGCATGGCTTTTGGAATGCTTCTTGCTCGCATTACAATGGGACACTCTGTTGCTATTTGGTTCTCTTTCCTTTCTCTCACCATGTTTCATATGTATGgtaaggtctgcttcaatttctgatgctggaatttgtacttcttcacaacatatttaaactgaaaattcatggatgaaggtgttaacttgtgaatattact
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gaaaatt