Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGATGCTATGTATGCATCGTCACAGGATACTGTGAGGGAGGGGACATgtacgcatttgttttgttcataacaaacacttcgagttcttatgattcgcctcttgtatgtttcgcag

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ20817
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: EFJ20817 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 4
lower sequence: PP1S22_216V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4
GGATGCTATGTATGCATCGTCACAGGATACTGTGAGGGAGGGGACATgta--cgcatttgttttgttcataacaa-----acacttcgagttcttatg--------attcgcctcttgtatgtttcgcag-----------------
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||   | |  | || |    ||  ||      |   || ||||  |  ||          | | ||     ||||||| ||                  
GGATGCTATGTATGCATCGTTACAGGTTACTGTGAAGGTGGTGACATgtaagtgaaccttttctacggatgtcagctttcatttttagagtcttagtgtcggaccagcttgactgcatcatgtttcacatggatatgtcggtgtctt