1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
ATGTCTTTAAGAAGGCGTACTCCGACCTGGCACCGAGCTTTGGCGATCTTAAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggataatttcctgccgtttatccatctcatgtttgtatatgcag
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ05611 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAGCTTTTGGTGGTGACGTACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCGEST: gi|169048326|gb|FE457314.1|FE457314
genomic: AAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
EST: CCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCGEST: gi|169046492|gb|FE457444.1|FE457444
genomic: CCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
EST: AAGCTTTTGGTGGTGACGTACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCGEST: gi|169065232|gb|FE474056.1|FE474056
genomic: AAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
EST: AAGCTTTTGGTGGTGACGTACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCGEST: gi|169019703|gb|FE428013.1|FE428013
genomic: AAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
EST: AAGCTTTTGGTGGTGACGTACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCGEST: gi|169103053|gb|FE504755.1|FE504755
genomic: AAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
EST: CTTTTGGTGGTGACGTACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGA GCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
genomic: CTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggat ... gtatatgcagGCTGCTCACTGGACTTGAATGTGTGGATGGTGTGGGACTTGACTTGGTTCG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATGTCTTTAAGAAGGCGTACTCCGACCTGGCACCGAGCTTTGGCGATCTTAAGCTTTTGGTGGTGACATACTTTGCGGATCTTCCAGCTCCGGCCTACGAgtaagcggataatttcctgccgtttatccatctcatgtttgtatatgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTC