1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AGGGACCGAGACAATCGACGTGAGCGACGCGATAGGCTGCAATATCCGAATTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaaccccagcaaaagctatgcttttttgttgaacgtgctactttgacag
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ11043 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTCTGTTACGATGGTEST: gi|169077199|gb|FE485085.1|FE485085
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTCTGTTACGATGGTEST: gi|169020459|gb|FE431706.1|FE431706
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTCTGTTACGATGGTEST: gi|169116479|gb|FE517504.1|FE517504
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGTEST: gi|169088391|gb|FE495437.1|FE495437
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGTEST: gi|169044666|gb|FE452460.1|FE452460
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
EST: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAG GATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
genomic: TTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaacccca ... actttgacagGATGTGAATGAGGAATGGATATCGGACAAGGCTCGGTTTTGTTACGATGGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGGGACCGAGACAATCGACGTGAGCGACGCGATAGGCTGCAATATCCGAATTGAGAGCCGTGGTGCTGAAGTTATGCGTATAGTTCCTCGTCTTAATGAGgtaaaccccagcaaaagctatgcttttttgttgaacgtgctactttgacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG