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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATCATACCGGTGACATGGGAGGAGCGATTATGCAACAACATAAAGAGCTCATAATTAATGAGCGTTGCCTTGGCTGTGATCATCCAGATACTGCACACAGgtatgactttttctcttaaaaacctttcttttgattgtgccttgttgttgtctatctttttacag

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ23910
intron # 26
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|169030342|gb|FE440067.1|FE440067
EST:     ATAATTAATGAGCGTTGCCTTGGCTGTGATCATCCAGATACTGCACACAG                         CTATGGCAACATGGCGTTGTTTTATCATGGACTGAACCAGACCGATTCGGC
genomic: ATAATTAATGAGCGTTGCCTTGGCTGTGATCATCCAGATACTGCACACAGgtatgacttt ... ctttttacagCTATGGCAACATGGCGTTGTTTTATCATGGACTGAACCAGACCGATTCGGC
EST: gi|169079811|gb|FE491220.1|FE491220
EST:     ATAATTAATGAGCGTTGCCTTGGCTGTGATCATCCAGATACTGCACACAG                         CTATGGCAACATGGCGTTGTTTTATCATGGACTGAACCAGACCGATTCGGC
genomic: ATAATTAATGAGCGTTGCCTTGGCTGTGATCATCCAGATACTGCACACAGgtatgacttt ... ctttttacagCTATGGCAACATGGCGTTGTTTTATCATGGACTGAACCAGACCGATTCGGC