1 5' 3' | 2 5' 3' |
CTCTTCCCAGCATTGTGGATCCTTCATCGCAACACGAGGGCGCTGTTCGATCAACGCTGGTGGCCACTACTATTTACCTCCCTCTCATGCAAGCGTCCAGgttttcaagatagatggtcctcgcttcatcaagttaaacgaaggaacttggcacgctagtcctctcttcggtgatcgagattcgatggtcttctacaact...
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ26114 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCTTCCCAGCATTGTGGATCCTTCATCGCAACACGAGGGCGCTGTTCGATCAACGCTGGTGGCCACTACTATTTACCTCCCTCTCATGCAAGCGTCCAGgttttcaagatagatggtcctcgcttcatcaagttaaacgaaggaacttggcacgctagtcctctcttcggtgatcgagattcgatggtcttctacaact
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aagataga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctcgctt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaggaac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cctctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gtcttct