1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TGGAGTTTGTGGAACCACGCCACTCCTTGGGGGCTTTCTCGCCGACGCTTACCTTGGCCGATACGCCACCATCGCCATCTTTTCGATCGTCCACCTCCTGgtaagttcaagctaggttctctgatctctcattccctctcttgcaaagatttgatttttctttgtctctagcaactttgctatcaaagcaacctatagtt...
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ23904 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGGAGTTTGTGGAACCACGCCACTCCTTGGGGGCTTTCTCGCCGACGCTTACCTTGGCCGATACGCCACCATCGCCATCTTTTCGATCGTCCACCTCCTGgtaagttcaagctaggttctctgatctctcattccctctcttgcaaagatttgatttttctttgtctctagcaactttgctatcaaagcaacctatagtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gttctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -atctctc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cctctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tttcttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tctctagc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tttgctat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaagcaa