Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|169059886|gb|FE467248.1|FE467248EST: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAG CAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
genomic: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAGgtaatgctca ... agttccacagCAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
EST:
gi|169056530|gb|FE464938.1|FE464938EST: CCTTTTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAG CAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
genomic: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAGgtaatgctca ... agttccacagCAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
EST:
gi|169047842|gb|FE455933.1|FE455933EST: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAG CAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
genomic: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAGgtaatgctca ... agttccacagCAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
EST:
gi|169056529|gb|FE464937.1|FE464937EST: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAG CAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
genomic: CCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAGgtaatgctca ... agttccacagCAATGGTGGTTTCGGAAGGGATGGATGCTATGCATGATCCGCGATATTTGG
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
TGCTTCAGCATAGTGATGGCATTTGTTCGAGTTTCTTGCATCCTTCTGCTGCCATTGATGCTGCTTGCAATTGCCAATGCTGCTGAAGAAGgtaatgctcaaaagttttgtttgcttaaaatttcaactaattcacaagttccacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG