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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTTTGGAGCCGTTCTTCAGCGCCGCGGCATCGCAGTTCGTTCTGGGACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatcccgggcctgagtatgttgatgtttcgaggcaggtgggactgtgcaatggagtagctgaagcacagatgatgagcggatgggtccagttgtttgaggggggtggttatgtggtggtagatgtcgatggtaatgatgacttggtggggatgcacatgggcag

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S450_17V6.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|67720361|gb|BJ970620.1|BJ970620
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208390893|gb|DC945910.1|DC945910
EST:     CCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162277952|gb|FC454083.1|FC454083
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208396756|gb|DC924340.1|DC924340
EST:     ACAGTCGATCTNTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208358550|gb|DC946511.1|DC946511
EST:     CTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162169285|gb|FC345447.1|FC345447
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162173323|gb|FC349494.1|FC349494
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67692528|gb|BJ952761.1|BJ952761
EST:     GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162229168|gb|FC404527.1|FC404527
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208381819|gb|DC923385.1|DC923385
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208358597|gb|DC946558.1|DC946558
EST:     CCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67692432|gb|BJ952665.1|BJ952665
EST:     GTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162191919|gb|FC366924.1|FC366924
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGA
EST: gi|208396147|gb|DC924613.1|DC924613
EST:     TCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: TCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|37827608|gb|BJ585620.1|BJ585620
EST:     CCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208357779|gb|DC918583.1|DC918583
EST:     TGACACCTATNGTGNTCG                         GNNTNTCGATGGCGTCGATGACGNAGCTGTCNTTCANCTNGAAGGGTTTCA
genomic: TGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208394888|gb|DC915653.1|DC915653
EST:     GTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67725570|gb|BJ975829.1|BJ975829
EST:     CAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTNCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTC
genomic: CAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCT-CGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTC
EST: gi|162174746|gb|FC352162.1|FC352162
EST:     GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208399191|gb|DC916560.1|DC916560
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162186304|gb|FC361612.1|FC361612
EST:     CGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208381850|gb|DC923402.1|DC923402
EST:     CTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67725520|gb|BJ975779.1|BJ975779
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162274709|gb|FC450788.1|FC450788
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162175159|gb|FC352007.1|FC352007
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67695845|gb|BJ956078.1|BJ956078
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67725043|gb|BJ975302.1|BJ975302
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162223785|gb|FC400039.1|FC400039
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67728301|gb|BJ978560.1|BJ978560
EST:     CCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162267304|gb|FC442092.1|FC442092
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGA
EST: gi|162207917|gb|FC383623.1|FC383623
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67725041|gb|BJ975300.1|BJ975300
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208394479|gb|DC928531.1|DC928531
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67725326|gb|BJ975585.1|BJ975585
EST:     TCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: TCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162169468|gb|FC345824.1|FC345824
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCAATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67702824|gb|BJ963057.1|BJ963057
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCAATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67724738|gb|BJ974997.1|BJ974997
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67724961|gb|BJ975220.1|BJ975220
EST:     GTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67726075|gb|BJ976334.1|BJ976334
EST:     TCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: TCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67728314|gb|BJ978573.1|BJ978573
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67727194|gb|BJ977453.1|BJ977453
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67728180|gb|BJ978439.1|BJ978439
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|208371179|gb|DC955985.1|DC955985
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162186303|gb|FC361611.1|FC361611
EST:     CGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGANGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67720268|gb|BJ970527.1|BJ970527
EST:     CTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162274117|gb|FC450189.1|FC450189
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162192483|gb|FC368619.1|FC368619
EST:     GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: GCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|162192484|gb|FC368620.1|FC368620
EST:     ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCG
genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCG
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genomic: CCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
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EST:     CCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
genomic: CCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
EST: gi|67720660|gb|BJ970919.1|BJ970919
EST:     CTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
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genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
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EST:     CTATCGTGCTCG                         GTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA
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genomic: ACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCA

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 28 (downstream exon)
Score: 21

CTTTGGAGCCGTTCTTCAGCGCCGCGGCATCGCAGTTCGTTCTGGGACAGTCGATCTCTCTGCCCCTGTGGTTGTCCCTGACACCTATCGTGCTCGgtaagtaatc ... acatgggcagGTGTGTCGATGGCGTCGATGACGGAGCTGTCGTTCAACTGGAAGGGTTTCATCAGCGCGATGACGGCGAATGTGGCGTTCACGTACAGGAACATCTACTC




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