Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttgtttctgtgccctcctagttttctttccaatggctggttcaggattcccaggactgattagaaacttcaatccttgcataacgtaggctag...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S201_115V6.3
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|100444237|gb|BY982266.1|BY982266
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
EST: gi|208385376|gb|DC956616.1|DC956616
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100394994|gb|BY990023.1|BY990023
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100386571|gb|BY951367.1|BY951367
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208362544|gb|DC939496.1|DC939496
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCNTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208359307|gb|DC939088.1|DC939088
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGTGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100433848|gb|BY978865.1|BY978865
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGG
EST: gi|100409354|gb|BY991970.1|BY991970
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100372528|gb|BY985642.1|BY985642
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTA
EST: gi|100385586|gb|BY969923.1|BY969923
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTT
EST: gi|208367023|gb|DC935893.1|DC935893
EST:     NTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAA-TTGGAGAA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAA
EST: gi|208348227|gb|DC905483.1|DC905483
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67717141|gb|BJ967400.1|BJ967400
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTG
EST: gi|100421066|gb|BY993595.1|BY993595
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|37835612|gb|BJ593624.1|BJ593624
EST:     ACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: ACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67709717|gb|BJ965533.1|BJ965533
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCN                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGTGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208376455|gb|DC902752.1|DC902752
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100449043|gb|CJ973342.1|CJ973342
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAAAAAGTTGCTGCG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCG
EST: gi|208393949|gb|DC928729.1|DC928729
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|37821752|gb|BJ579818.1|BJ579818
EST:     CTTGGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
genomic: CTTGGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCG-CCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
EST: gi|100444382|gb|BY982411.1|BY982411
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTTAGTTGGAGAATGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGA
EST: gi|37825580|gb|BJ583646.1|BJ583646
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208397894|gb|DC916649.1|DC916649
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208392590|gb|DC938555.1|DC938555
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100380058|gb|BY968825.1|BY968825
EST:     GTGTGGTCACTGCNAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
EST: gi|100396712|gb|BY953789.1|BY953789
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100361556|gb|BY984065.1|BY984065
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGA
EST: gi|100418332|gb|BY957368.1|BY957368
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGT-GCTGCGG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGG
EST: gi|100446227|gb|CJ970526.1|CJ970526
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100373135|gb|BY949226.1|BY949226
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208349304|gb|DC910377.1|DC910377
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100425967|gb|BY977210.1|BY977210
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTTAGTTG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTG
EST: gi|67717225|gb|BJ967484.1|BJ967484
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTG
EST: gi|100379602|gb|BY949851.1|BY949851
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGNAGAAATGATGT-GTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAA-TGATGTTGTGGT
EST: gi|100447867|gb|CJ972166.1|CJ972166
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67568840|gb|BJ941664.1|BJ941664
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67716820|gb|BJ967079.1|BJ967079
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208386375|gb|DC937042.1|DC937042
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208366873|gb|DC940187.1|DC940187
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208356961|gb|DC930019.1|DC930019
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208390976|gb|DC929295.1|DC929295
EST:     GTGTGNTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGANAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGANAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208385667|gb|DC952828.1|DC952828
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208387048|gb|DC941220.1|DC941220
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67571852|gb|BJ944676.1|BJ944676
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTA
EST: gi|100445267|gb|BY982896.1|BY982896
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCT
EST: gi|100386231|gb|BY987898.1|BY987898
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         N
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttag-
EST: gi|100386231|gb|BY987898.1|BY987898
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         N
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttag-
EST: gi|100366008|gb|BY967249.1|BY967249
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGANGAAAGT-GCTGCGGCTTTTAAGTTG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGA-GAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTG
EST: gi|100365426|gb|BY966590.1|BY966590
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
EST: gi|208351532|gb|DC905709.1|DC905709
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208387745|gb|DC937310.1|DC937310
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208380848|gb|DC923330.1|DC923330
EST:     GTGT-GTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100351861|gb|BY964587.1|BY964587
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
EST: gi|100354849|gb|BY983596.1|BY983596
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGANGAA-GTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGA-GAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
EST: gi|100388545|gb|BY952147.1|BY952147
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208366054|gb|DC935843.1|DC935843
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208349993|gb|DC910228.1|DC910228
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67572565|gb|BJ945389.1|BJ945389
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208355269|gb|DC929758.1|DC929758
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGNTGCTGCGGCTTTTAANTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208356156|gb|DC957316.1|DC957316
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208357088|gb|DC930062.1|DC930062
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208369542|gb|DC936318.1|DC936318
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100406815|gb|BY955734.1|BY955734
EST:     GGGGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GGTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTTAAGTTGGA
genomic: GTG-TGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTT-AAGTTGGA
EST: gi|100434490|gb|BY960747.1|BY960747
EST:     GGTGTGGTCCCTGCCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTAATAAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
genomic: G-TGTGGTCACTGC-AAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTA-TGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
EST: gi|37853039|gb|BJ611047.1|BJ611047
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100445197|gb|BY964496.1|BY964496
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAA
EST: gi|100371857|gb|BY967586.1|BY967586
EST:     GTGTGGGCACTGCAAGAGTCTCGCCGCT                         GTTTATGAGAAAATTGCTGCGGCTTTTAAGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTT
EST: gi|208378694|gb|DC914668.1|DC914668
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGNA-AATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208399761|gb|DC904633.1|DC904633
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTANNTTGGAGAATGATGTTGTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
EST: gi|208393538|gb|DC949700.1|DC949700
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGNTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100432044|gb|BY978637.1|BY978637
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGA
EST: gi|67571949|gb|BJ944773.1|BJ944773
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100416031|gb|BY957044.1|BY957044
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGT-GCTGCGGCTTTTAAGTTG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTG
EST: gi|100402940|gb|BY973428.1|BY973428
EST:     GGTGTG-TCACTGCAAGAGTCTCGGCCCT                         GTTTATGAGAAAAGT-GCTGCGGCTTTTAA
genomic: G-TGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAA-GTTGCTGCGGCTTTTAA
EST: gi|100398767|gb|BY990505.1|BY990505
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100397478|gb|BY990247.1|BY990247
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100400332|gb|BY954424.1|BY954424
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100442438|gb|BY963132.1|BY963132
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGGAAGTTGCTGCGGCTTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTT
EST: gi|100376700|gb|BY949422.1|BY949422
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAAATGATGT-GTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAA-TGATGTTGTGGT
EST: gi|208386779|gb|DC937171.1|DC937171
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100441395|gb|BY962684.1|BY962684
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAG
EST: gi|100408982|gb|BY991838.1|BY991838
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100434615|gb|BY960802.1|BY960802
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|67573201|gb|BJ946025.1|BJ946025
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100390572|gb|BY971327.1|BY971327
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGT-GCTGCGGCTTTTAAGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGT
EST: gi|100445724|gb|CJ970023.1|CJ970023
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100388876|gb|BY988752.1|BY988752
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCCGCTTTTA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTA
EST: gi|208381758|gb|DC928421.1|DC928421
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208357537|gb|DC934059.1|DC934059
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGANAAAGTTGCTGCGNCTTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTT
EST: gi|37840656|gb|BJ598664.1|BJ598664
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208354258|gb|DC957450.1|DC957450
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100442598|gb|BY963292.1|BY963292
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCNGCCC-T                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTC-GCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGT
EST: gi|100446770|gb|CJ971069.1|CJ971069
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100377567|gb|BY986302.1|BY986302
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGGAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGA
EST: gi|162269629|gb|FC445575.1|FC445575
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|162277081|gb|FC453803.1|FC453803
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100409274|gb|BY991931.1|BY991931
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT                         GTT-ATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-Tgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
EST: gi|208344639|gb|DC912585.1|DC912585
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100358571|gb|BY983973.1|BY983973
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGC
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGC
EST: gi|100422254|gb|BY957933.1|BY957933
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAA
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCT-GCGGCTTTTAAGTTGGAGAA
EST: gi|100387202|gb|BY970346.1|BY970346
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTT
EST: gi|208386615|gb|DC932677.1|DC932677
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100396984|gb|BY953926.1|BY953926
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTGGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100358321|gb|BY983846.1|BY983846
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGC
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGC
EST: gi|100379160|gb|BY986605.1|BY986605
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGG
EST: gi|208384507|gb|DC914979.1|DC914979
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTTGTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTT-GTGGT
EST: gi|208356761|gb|DC906423.1|DC906423
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100412814|gb|BY992449.1|BY992449
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|208344908|gb|DC909019.1|DC909019
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100418546|gb|BY957472.1|BY957472
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGGCCCT                         T
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttag-
EST: gi|100418546|gb|BY957472.1|BY957472
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGGCCCT                         T
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttag-
EST: gi|100421709|gb|BY976274.1|BY976274
EST:     GGGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
EST: gi|100399058|gb|BY954178.1|BY954178
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTT
EST: gi|100375661|gb|BY948939.1|BY948939
EST:     GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT                         GTT-ATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTNNAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-Tgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGT
EST: gi|100444464|gb|BY964162.1|BY964162
EST:     GTGTGGTCACTGCCAGAGTCTCGCCCCT                         GTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG
genomic: GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 33 (upstream exon), 24 (downstream exon)
Score: 3

GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttg ... ttacgtttagGTTTATGAGAAAGTTGCTGCGGCTTTTAAGTTGGAGAATGATGTTGTGGTTGCCAACGTTAATGCCGATGCTCACAGGGCTCTTGGTTCAAG




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTgtaagctttgtttctgtgccctcctagttttctttccaatggctggttcaggattcccaggactgattagaaacttcaatccttgcataacgtaggctag

- - - - -  GCAAGA