Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTACACCTCCTTCAGAAGTTGTGGTACTCGACCCGACGAATTTTGATAAGATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatttttctaaatatcatgatgttgctttgtggggcctcaatctccatcttacagtatagaattgcctagacttgtgaattagttcgatgcaaa...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S201_115V6.3
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|100444237|gb|BY982266.1|BY982266
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208385376|gb|DC956616.1|DC956616
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100394994|gb|BY990023.1|BY990023
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100386571|gb|BY951367.1|BY951367
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208362544|gb|DC939496.1|DC939496
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208359307|gb|DC939088.1|DC939088
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100433848|gb|BY978865.1|BY978865
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTT-Ggtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100409354|gb|BY991970.1|BY991970
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100372528|gb|BY985642.1|BY985642
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100385586|gb|BY969923.1|BY969923
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208367023|gb|DC935893.1|DC935893
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         NTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208348227|gb|DC905483.1|DC905483
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67717141|gb|BJ967400.1|BJ967400
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100421066|gb|BY993595.1|BY993595
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100364442|gb|BY984615.1|BY984615
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAGGATGTCCTTGTGGAATTCTATNGCCC-TTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCTGTT-ATGAG
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTAT-GCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-TGTTTATGAG
EST: gi|67709717|gb|BJ965533.1|BJ965533
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCN
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208376455|gb|DC902752.1|DC902752
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100449043|gb|CJ973342.1|CJ973342
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100411255|gb|BY974546.1|BY974546
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTT
EST: gi|208393949|gb|DC928729.1|DC928729
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100444382|gb|BY982411.1|BY982411
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|37825580|gb|BJ583646.1|BJ583646
EST:     ATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208397894|gb|DC916649.1|DC916649
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGNATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100411431|gb|BY974633.1|BY974633
EST:     CGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGAAT-CTATGCCCCCTTG                         G-GTG-TCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATG
genomic: CGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGG-AATTCTATGCCCC-TTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATG
EST: gi|208392590|gb|DC938555.1|DC938555
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100380058|gb|BY968825.1|BY968825
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCNAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100396712|gb|BY953789.1|BY953789
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100361556|gb|BY984065.1|BY984065
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100418332|gb|BY957368.1|BY957368
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100446227|gb|CJ970526.1|CJ970526
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100373135|gb|BY949226.1|BY949226
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208349304|gb|DC910377.1|DC910377
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100445845|gb|CJ970144.1|CJ970144
EST:     ATCGTTATGGATACTACNAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         NTGTGNTCACTGCAANANTCTCNCCCCTGTTTATGA
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATGA
EST: gi|100425967|gb|BY977210.1|BY977210
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67717225|gb|BJ967484.1|BJ967484
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100379602|gb|BY949851.1|BY949851
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100449690|gb|CJ973886.1|CJ973886
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAAAGTCTCGCCCCTGTTTATGA
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATGA
EST: gi|100447867|gb|CJ972166.1|CJ972166
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67568840|gb|BJ941664.1|BJ941664
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67716820|gb|BJ967079.1|BJ967079
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208386375|gb|DC937042.1|DC937042
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208366873|gb|DC940187.1|DC940187
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208356961|gb|DC930019.1|DC930019
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208390976|gb|DC929295.1|DC929295
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGNTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208385667|gb|DC952828.1|DC952828
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208387048|gb|DC941220.1|DC941220
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67571852|gb|BJ944676.1|BJ944676
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100445267|gb|BY982896.1|BY982896
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100386231|gb|BY987898.1|BY987898
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100366008|gb|BY967249.1|BY967249
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100365426|gb|BY966590.1|BY966590
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208351532|gb|DC905709.1|DC905709
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208387745|gb|DC937310.1|DC937310
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208380848|gb|DC923330.1|DC923330
EST:     TCTATGCCCCTTG                         GTGT-GTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100351861|gb|BY964587.1|BY964587
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTTGAAATCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100354849|gb|BY983596.1|BY983596
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100388545|gb|BY952147.1|BY952147
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208366054|gb|DC935843.1|DC935843
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208349993|gb|DC910228.1|DC910228
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67572565|gb|BJ945389.1|BJ945389
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208355269|gb|DC929758.1|DC929758
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208356156|gb|DC957316.1|DC957316
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208357088|gb|DC930062.1|DC930062
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208369542|gb|DC936318.1|DC936318
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100406815|gb|BY955734.1|BY955734
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCCTG                         GGGGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTG-TGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100434490|gb|BY960747.1|BY960747
EST:     TCGTTATGAATACTACGAAAGAT-TCCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GGTGTGGTCCCTGCCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCC-TTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagG-TGTGGTCACTGC-AAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|37853039|gb|BJ611047.1|BJ611047
EST:     TCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100445197|gb|BY964496.1|BY964496
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100371857|gb|BY967586.1|BY967586
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCCTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGGCACTGCAAGAGTCTCGCCGCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208378694|gb|DC914668.1|DC914668
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100412635|gb|BY974832.1|BY974832
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCT
EST: gi|208399761|gb|DC904633.1|DC904633
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100432044|gb|BY978637.1|BY978637
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|67571949|gb|BJ944773.1|BJ944773
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100429946|gb|BY978169.1|BY978169
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTT-Ggtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100416031|gb|BY957044.1|BY957044
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGNCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100402940|gb|BY973428.1|BY973428
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GGTGTG-TCACTGCAAGAGTCTCGGCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagG-TGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100398767|gb|BY990505.1|BY990505
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100397478|gb|BY990247.1|BY990247
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100400332|gb|BY954424.1|BY954424
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100442438|gb|BY963132.1|BY963132
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTGG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100376700|gb|BY949422.1|BY949422
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208386779|gb|DC937171.1|DC937171
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100447855|gb|CJ972154.1|CJ972154
EST:     ATCGTTATGGATACTACNAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         NTGTGNTCACTGCAANANTCTCGCCCCTGTTTA
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTA
EST: gi|100441395|gb|BY962684.1|BY962684
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100408982|gb|BY991838.1|BY991838
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100434615|gb|BY960802.1|BY960802
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCC-TTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-T
EST: gi|67573201|gb|BJ946025.1|BJ946025
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100390572|gb|BY971327.1|BY971327
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100445724|gb|CJ970023.1|CJ970023
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100388876|gb|BY988752.1|BY988752
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208381758|gb|DC928421.1|DC928421
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208357537|gb|DC934059.1|DC934059
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|37840656|gb|BJ598664.1|BJ598664
EST:     CTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: CTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208354258|gb|DC957450.1|DC957450
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|18342608|gb|BJ174643.1|BJ174643
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTT
EST: gi|100442598|gb|BY963292.1|BY963292
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCNGCCC-T
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTC-GCCCCT
EST: gi|100446770|gb|CJ971069.1|CJ971069
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100377567|gb|BY986302.1|BY986302
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTTGGA-TTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGT-GGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|162269629|gb|FC445575.1|FC445575
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|162277081|gb|FC453803.1|FC453803
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100409274|gb|BY991931.1|BY991931
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-T
EST: gi|208344639|gb|DC912585.1|DC912585
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100358571|gb|BY983973.1|BY983973
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100449431|gb|CJ973730.1|CJ973730
EST:     ATCGTTATGGATACTACNAAAGATGTCCTTGTGGAATNCTATGCCCCNTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCC
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCC
EST: gi|100422254|gb|BY957933.1|BY957933
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATNGCCC-TTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTAT-GCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100387202|gb|BY970346.1|BY970346
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208386615|gb|DC932677.1|DC932677
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100396984|gb|BY953926.1|BY953926
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100358321|gb|BY983846.1|BY983846
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100379160|gb|BY986605.1|BY986605
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208384507|gb|DC914979.1|DC914979
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208356761|gb|DC906423.1|DC906423
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGGTGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100412814|gb|BY992449.1|BY992449
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|208344908|gb|DC909019.1|DC909019
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100370494|gb|BY985437.1|BY985437
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGGATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATGAGA
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCTGTTTATGAGA
EST: gi|100418546|gb|BY957472.1|BY957472
EST:     CGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCCTTGTG-AATTCTATGCCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGGCCCT
genomic: CGTTATGGATACTACGAAAGATGTCC-TTGTGGAATTCTATGCCCC-TTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100421709|gb|BY976274.1|BY976274
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGNAATTCTATGCCCCCTTG                         GGGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCC-TTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100399058|gb|BY954178.1|BY954178
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT
EST: gi|100375661|gb|BY948939.1|BY948939
EST:     ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCCT
genomic: ATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCC-T
EST: gi|100444464|gb|BY964162.1|BY964162
EST:     TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGGTG-AATTCTATGCCCCTTG                         GTGTGGTCACTGCCAGAGTCTCGCCCCT
genomic: TCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTG-TGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 35 (downstream exon)
Score: 18

CTACACCTCCTTCAGAAGTTGTGGTACTCGACCCGACGAATTTTGATAAGATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatt ... cattggacagGTGTGGTCACTGCAAGAGTCTCGCCCCT




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CTACACCTCCTTCAGAAGTTGTGGTACTCGACCCGACGAATTTTGATAAGATCGTTATGGATACTACGAAAGATGTCCTTGTGGAATTCTATGCCCCTTGgtacgacatttttctaaatatcatgatgttgctttgtggggcctcaatctccatcttacagtatagaattgcctagacttgtgaattagttcgatgcaaa

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGATG