Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGAGAAGGCAACCCAAGGAATCTATCCACTTCAGAACACTTTCATCAGGAAAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaattttgatcacgatcacttgagggcgtttgcaacgcccaaatacctcttgagtttaagcactgctttttagaatcatgcatgtgcttctaa...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S179_15V6.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|162265200|gb|FC441287.1|FC441287
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162265201|gb|FC441288.1|FC441288
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162179846|gb|FC355917.1|FC355917
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18334111|gb|BJ166127.1|BJ166127
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162201583|gb|FC378271.1|FC378271
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162238579|gb|FC418968.1|FC418968
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67693923|gb|BJ954156.1|BJ954156
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162269852|gb|FC445382.1|FC445382
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162194938|gb|FC370563.1|FC370563
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37852616|gb|BJ610624.1|BJ610624
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162268273|gb|FC444562.1|FC444562
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208383029|gb|DC927779.1|DC927779
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208392444|gb|DC907921.1|DC907921
EST:     AAGTGAAANTCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGANATNACAGCGAGGAANTTGGTGC
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGC
EST: gi|37848349|gb|BJ606357.1|BJ606357
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162257380|gb|FC433463.1|FC433463
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATC
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATC
EST: gi|37852925|gb|BJ610933.1|BJ610933
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67722771|gb|BJ973030.1|BJ973030
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162241950|gb|FC414435.1|FC414435
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162241951|gb|FC414436.1|FC414436
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCCAGATCGATAGGCC
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCC
EST: gi|162276944|gb|FC453042.1|FC453042
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208360144|gb|DC950173.1|DC950173
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162273088|gb|FC447782.1|FC447782
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162257379|gb|FC433462.1|FC433462
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162179845|gb|FC355916.1|FC355916
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|19781051|gb|BQ039650.1|BQ039650
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162260169|gb|FC436304.1|FC436304
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162204866|gb|FC381496.1|FC381496
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37825369|gb|BJ583435.1|BJ583435
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162243528|gb|FC421779.1|FC421779
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCT
EST: gi|162255190|gb|FC431500.1|FC431500
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162259812|gb|FC436779.1|FC436779
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162261030|gb|FC436917.1|FC436917
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37822931|gb|BJ580997.1|BJ580997
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67693716|gb|BJ953949.1|BJ953949
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37832114|gb|BJ590126.1|BJ590126
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162272288|gb|FC448173.1|FC448173
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162259414|gb|FC436253.1|FC436253
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18338281|gb|BJ170305.1|BJ170305
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37845747|gb|BJ603755.1|BJ603755
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37837512|gb|BJ595520.1|BJ595520
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67725903|gb|BJ976162.1|BJ976162
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162270512|gb|FC447607.1|FC447607
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162270511|gb|FC447606.1|FC447606
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67727472|gb|BJ977731.1|BJ977731
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GCTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162220664|gb|FC396876.1|FC396876
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67720114|gb|BJ970373.1|BJ970373
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37823282|gb|BJ581348.1|BJ581348
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGNCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162204867|gb|FC381497.1|FC381497
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162259415|gb|FC436254.1|FC436254
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCC
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCC
EST: gi|208384075|gb|DC911239.1|DC911239
EST:     AAGTGAAA-TCCTTAAAGCTCCCANGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGAT-ACAGCGAG
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAG
EST: gi|162234737|gb|FC409249.1|FC409249
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162273370|gb|FC449819.1|FC449819
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCT
EST: gi|15727801|gb|BI740470.1|BI740470
EST:     AAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162244738|gb|FC423483.1|FC423483
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208369634|gb|DC936368.1|DC936368
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATNACAGCGAGNAA-TTGGTGCCA
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCA
EST: gi|162276884|gb|FC452566.1|FC452566
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67725681|gb|BJ975940.1|BJ975940
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208349013|gb|DC921701.1|DC921701
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67699970|gb|BJ960203.1|BJ960203
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162269853|gb|FC445383.1|FC445383
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162250918|gb|FC425740.1|FC425740
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCG
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCG
EST: gi|162203241|gb|FC379338.1|FC379338
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162276885|gb|FC452567.1|FC452567
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162250917|gb|FC425739.1|FC425739
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37831733|gb|BJ589745.1|BJ589745
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162273369|gb|FC449818.1|FC449818
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37848394|gb|BJ606402.1|BJ606402
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162238578|gb|FC418967.1|FC418967
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18336171|gb|BJ168193.1|BJ168193
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208393662|gb|DC907813.1|DC907813
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         -TTNCATGGAGATNACAGCGAGGAA
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTT-CATGGAGATTACAGCGAGGAA
EST: gi|37830222|gb|BJ588234.1|BJ588234
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37838873|gb|BJ596881.1|BJ596881
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|22132762|gb|BQ827337.1|BQ827337
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162238191|gb|FC414797.1|FC414797
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37851535|gb|BJ609543.1|BJ609543
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|67722832|gb|BJ973091.1|BJ973091
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162238190|gb|FC414796.1|FC414796
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18337219|gb|BJ169243.1|BJ169243
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162203242|gb|FC379339.1|FC379339
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGT
EST: gi|67694847|gb|BJ955080.1|BJ955080
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|15728268|gb|BI740702.1|BI740702
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18337686|gb|BJ169710.1|BJ169710
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162204819|gb|FC381475.1|FC381475
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18336653|gb|BJ168676.1|BJ168676
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|100379570|gb|BY949835.1|BY949835
EST:     GTGAAAATCCTTAA-GCTCCCNNAGT-CGACCTGATNGA-GCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGC-AAGATCGATAGGCCTGGT
genomic: GTGAAAATCCTTAAAGCTCCCA-AGTTCGACCTGAT-GAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162244737|gb|FC423482.1|FC423482
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|15727675|gb|BI740408.1|BI740408
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208357631|gb|DC914031.1|DC914031
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATNACAGCGAGGAA
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAA
EST: gi|67725692|gb|BJ975951.1|BJ975951
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208352938|gb|DC921808.1|DC921808
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|208400404|gb|DC925042.1|DC925042
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162261133|gb|FC436968.1|FC436968
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162272274|gb|FC448172.1|FC448172
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162223888|gb|FC398894.1|FC398894
EST:     AGTGAAAATCCTTAAAGCTCCNCA-GTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCNAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AGTGAAAATCCTTAAAGCTCC-CAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162268272|gb|FC444561.1|FC444561
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18341089|gb|BJ173122.1|BJ173122
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37837514|gb|BJ595522.1|BJ595522
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37831967|gb|BJ589979.1|BJ589979
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18333776|gb|BJ165792.1|BJ165792
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37837541|gb|BJ595549.1|BJ595549
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162242936|gb|FC417602.1|FC417602
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162237308|gb|FC412429.1|FC412429
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|18332848|gb|BJ164861.1|BJ164861
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162259813|gb|FC436780.1|FC436780
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162273087|gb|FC447781.1|FC447781
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|37825006|gb|BJ583072.1|BJ583072
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|15727893|gb|BI740516.1|BI740516
EST:     AATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATAAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162223887|gb|FC398893.1|FC398893
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162194924|gb|FC370562.1|FC370562
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|162261029|gb|FC436916.1|FC436916
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
EST: gi|19783328|gb|BQ039995.1|BQ039995
EST:     AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAG                         GTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT
genomic: AAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 35 (downstream exon)
Score: 105

TGAGAAGGCAACCCAAGGAATCTATCCACTTCAGAACACTTTCATCAGGAAAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaa ... ggatgggtagGTTCATGGAGATTACAGCGAGGAAGTTGGTGCCAAGATCGATAGGCCTGTTGGAGATGACACCGCGGCTGATGCTCCTGCTGCTGAGGCAGTTCCCGGAG




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TGAGAAGGCAACCCAAGGAATCTATCCACTTCAGAACACTTTCATCAGGAAAGTGAAAATCCTTAAAGCTCCCAAGTTCGACCTGATGAAGCTCATGGAGgtgagtcaaattttgatcacgatcacttgagggcgtttgcaacgcccaaatacctcttgagtttaagcactgctttttagaatcatgcatgtgcttctaa

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CATGGA