Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTTTGTCTCCGCCATCCATCTGGCAGTCGGCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgagaatgcgcgattttgacgtggaacctgtaaaaaagcagagtggaggtcacgtgaagttgtagtcgatgatgagtcgaatgtgggtgtaatg...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S450_17V6.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208358491|gb|DC930623.1|DC930623
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208345967|gb|DC901824.1|DC901824
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162277952|gb|FC454083.1|FC454083
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208390500|gb|DC933757.1|DC933757
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100396781|gb|BY953824.1|BY953824
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162169285|gb|FC345447.1|FC345447
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100374422|gb|BY985785.1|BY985785
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATT
EST: gi|67572470|gb|BJ945294.1|BJ945294
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
EST: gi|208355694|gb|DC910516.1|DC910516
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGAAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100400356|gb|BY954436.1|BY954436
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208356551|gb|DC938662.1|DC938662
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162229169|gb|FC404528.1|FC404528
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208374697|gb|DC932008.1|DC932008
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208389476|gb|DC929415.1|DC929415
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACNAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208386760|gb|DC937152.1|DC937152
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100367003|gb|BY948319.1|BY948319
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208400281|gb|DC908942.1|DC908942
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208383392|gb|DC907567.1|DC907567
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100400153|gb|BY990805.1|BY990805
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162191919|gb|FC366924.1|FC366924
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100439465|gb|BY961946.1|BY961946
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100390320|gb|BY952728.1|BY952728
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208390354|gb|DC933399.1|DC933399
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67578419|gb|BJ950586.1|BJ950586
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67508638|gb|BJ941500.1|BJ941500
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208398210|gb|DC908439.1|DC908439
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162274710|gb|FC450789.1|FC450789
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208376338|gb|DC902691.1|DC902691
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208348079|gb|DC905402.1|DC905402
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162186329|gb|FC361637.1|FC361637
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100362777|gb|BY947523.1|BY947523
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTTGACA-GGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATT-GACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
EST: gi|67508624|gb|BJ941486.1|BJ941486
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATG
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATG
EST: gi|162175159|gb|FC352007.1|FC352007
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208394221|gb|DC933889.1|DC933889
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162267304|gb|FC442092.1|FC442092
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208389813|gb|DC938347.1|DC938347
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100369159|gb|BY985044.1|BY985044
EST:     CGTTGTTTACTGTCTGATTTTCGTGGATGT-GGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGAT
genomic: CGTTGTTTACTGTCTGATTT-CGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGAT
EST: gi|100398083|gb|BY954079.1|BY954079
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67709418|gb|BJ965234.1|BJ965234
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
EST: gi|100356432|gb|BY946362.1|BY946362
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100404947|gb|BY991361.1|BY991361
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208372981|gb|DC940612.1|DC940612
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67719428|gb|BJ969687.1|BJ969687
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTACTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67717051|gb|BJ967310.1|BJ967310
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGA
EST: gi|162169456|gb|FC345812.1|FC345812
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100444368|gb|BY982397.1|BY982397
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACNAGGAGCTATTTATGATNGT-GATTCCGGTGTCTA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGAT-GTTGATTCCGGTGTCTA
EST: gi|100405022|gb|BY991400.1|BY991400
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67720056|gb|BJ970315.1|BJ970315
EST:     GCGATGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162169468|gb|FC345824.1|FC345824
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100446134|gb|CJ970433.1|CJ970433
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67718835|gb|BJ969094.1|BJ969094
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67572473|gb|BJ945297.1|BJ945297
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100407336|gb|BY991651.1|BY991651
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100439311|gb|BY980200.1|BY980200
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTAT
EST: gi|67719922|gb|BJ970181.1|BJ970181
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100439167|gb|BY980127.1|BY980127
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATG
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATG
EST: gi|162189900|gb|FC365590.1|FC365590
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208376285|gb|DC902666.1|DC902666
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208344888|gb|DC908999.1|DC908999
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162251482|gb|FC427721.1|FC427721
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162274117|gb|FC450189.1|FC450189
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208360240|gb|DC942998.1|DC942998
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162192484|gb|FC368620.1|FC368620
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67717623|gb|BJ967882.1|BJ967882
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208382095|gb|DC914784.1|DC914784
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGNGATATCNGAAGCGAGCG                         CCTATGGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATNCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208383308|gb|DC928280.1|DC928280
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTA-TGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100362480|gb|BY947378.1|BY947378
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162212382|gb|FC388110.1|FC388110
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208354225|gb|DC957431.1|DC957431
EST:     GGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162183319|gb|FC359234.1|FC359234
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100446750|gb|CJ971049.1|CJ971049
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208384477|gb|DC911563.1|DC911563
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100354769|gb|BY983556.1|BY983556
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208390016|gb|DC938071.1|DC938071
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208392410|gb|DC904256.1|DC904256
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67717222|gb|BJ967481.1|BJ967481
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
EST: gi|100415630|gb|BY992928.1|BY992928
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100359820|gb|BY947142.1|BY947142
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACA-GGNAGCTATTTATGATNGT-GAT-CCNGGTGTCTATCTGT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGG-AGCTATTTATGAT-GTTGATTCC-GGTGTCTATCTGT
EST: gi|67716526|gb|BJ966786.1|BJ966786
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGT
EST: gi|162174747|gb|FC352163.1|FC352163
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67719396|gb|BJ969655.1|BJ969655
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208380118|gb|DC927397.1|DC927397
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100398065|gb|BY954070.1|BY954070
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100391144|gb|BY953154.1|BY953154
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATGGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67508096|gb|BJ940967.1|BJ940967
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208346251|gb|DC909543.1|DC909543
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208374800|gb|DC932055.1|DC932055
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100359673|gb|BY947095.1|BY947095
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACA-GGNAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGG-AGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
EST: gi|100384492|gb|BY987351.1|BY987351
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208380344|gb|DC907669.1|DC907669
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100418206|gb|BY993385.1|BY993385
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208376721|gb|DC914530.1|DC914530
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67569439|gb|BJ942263.1|BJ942263
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100396499|gb|BY990155.1|BY990155
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208346220|gb|DC909526.1|DC909526
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGAAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|162223786|gb|FC400040.1|FC400040
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|67717559|gb|BJ967818.1|BJ967818
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208369679|gb|DC936385.1|DC936385
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208361414|gb|DC930397.1|DC930397
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208366749|gb|DC931406.1|DC931406
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208360584|gb|DC930856.1|DC930856
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|208355633|gb|DC906599.1|DC906599
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100355853|gb|BY946071.1|BY946071
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTNGACA-GGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATT-GACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCA
EST: gi|208385217|gb|DC911421.1|DC911421
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATNCCGGTGTCTATCTGTCAT
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCAT
EST: gi|100363030|gb|BY984322.1|BY984322
EST:     GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCG                         CCTATTGACAAGGAGCTATTTATG
genomic: GCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 32 (downstream exon)
Score: 57

CTTTGTCTCCGCCATCCATCTGGCAGTCGGCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgag ... gtgggtgcagCCTATTGACAAGGAGCTATTTATGATGTTGATTCCGGTGTCTATCTGTCATGCCCTGGGTCACGTGATGACGAACGTGTCATTCGCTGCAGTTGCAGTGT




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CTTTGTCTCCGCCATCCATCTGGCAGTCGGCGTTGTTTACTGTCTGATTTCGTGGATGTTGGGATATCCGAAGCGAGCGgtgagttgagaatgcgcgattttgacgtggaacctgtaaaaaagcagagtggaggtcacgtgaagttgtagtcgatgatgagtcgaatgtgggtgtaatg

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaaagca