1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
CCAGAAAGACAAACGTTTCAGCGGCTCTGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcgcacattggaataatttttgccttcatatttgtttcatttttagattatcttgattaatgtctcatttcttaaccaacgttcatctgacaatag
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S40_297V6.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162236408|gb|FC412775.1|FC412775
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCTTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18353843|gb|BJ185898.1|BJ185898
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162265770|gb|FC443176.1|FC443176
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162208146|gb|FC384588.1|FC384588
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208382464|gb|DC927998.1|DC927998
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18345258|gb|BJ177300.1|BJ177300
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37835160|gb|BJ593172.1|BJ593172
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208399927|gb|DC904981.1|DC904981
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162211761|gb|FC387425.1|FC387425
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37846164|gb|BJ604172.1|BJ604172
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCNTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18353686|gb|BJ185741.1|BJ185741
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18366048|gb|BJ198126.1|BJ198126
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162207625|gb|FC384078.1|FC384078
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18326967|gb|BJ158968.1|BJ158968
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208356336|gb|DC914254.1|DC914254
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162277750|gb|FC453589.1|FC453589
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37835317|gb|BJ593329.1|BJ593329
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18364826|gb|BJ196899.1|BJ196899
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162265771|gb|FC443177.1|FC443177
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|15261368|gb|BI436678.1|BI436678
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162206162|gb|FC383155.1|FC383155
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162246407|gb|FC419943.1|FC419943
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162219934|gb|FC396749.1|FC396749
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162219933|gb|FC396748.1|FC396748
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208347658|gb|DC912875.1|DC912875
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|67695799|gb|BJ956032.1|BJ956032
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162208145|gb|FC384587.1|FC384587
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37842024|gb|BJ600032.1|BJ600032
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCNTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208400389|gb|DC925027.1|DC925027
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162248093|gb|FC420098.1|FC420098
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208354514|gb|DC926649.1|DC926649
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162211762|gb|FC387426.1|FC387426
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37851150|gb|BJ609158.1|BJ609158
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18367268|gb|BJ199350.1|BJ199350
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162277749|gb|FC453588.1|FC453588
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37845410|gb|BJ603418.1|BJ603418
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208350513|gb|DC926466.1|DC926466
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162236409|gb|FC412776.1|FC412776
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162246408|gb|FC419944.1|FC419944
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18346490|gb|BJ178533.1|BJ178533
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162268991|gb|FC445483.1|FC445483
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|18362029|gb|BJ194096.1|BJ194096
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162186775|gb|FC362811.1|FC362811
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162258972|gb|FC435915.1|FC435915
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162207624|gb|FC384077.1|FC384077
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|67572426|gb|BJ945250.1|BJ945250
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162268992|gb|FC445484.1|FC445484
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37847731|gb|BJ605739.1|BJ605739
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|22492606|gb|BU052529.1|BU052529
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162234144|gb|FC410553.1|FC410553
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|208378252|gb|DC918873.1|DC918873
genomic: GCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|37841468|gb|BJ599476.1|BJ599476
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|7648077|gb|AW739060.1|AW739060
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATGEST: gi|162186776|gb|FC362812.1|FC362812
genomic: GAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
EST: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAG GCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
genomic: GTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcg ... ctgacaatagGCAAACAAAATCGGTATGGAATACATGGATGTTGAGAGCTTGAAGAAGATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCAGAAAGACAAACGTTTCAGCGGCTCTGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcgcacattggaataatttttgccttcatatttgtttcatttttagattatcttgattaatgtctcatttcttaaccaacgttcatctgacaatag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG