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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGTTTGAATTCCAAGATCCACCACAATAATCTCATCAACAACATATTAGCCAAGgttagttgcaccctgacgacagagtgagcttattgtctgattgccttttgaattttaggttgaacaattctgtaatttctgcatacacgctcgaccattc...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S81_64V6.2
intron # 14
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: PP1S81_64V6.2 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 14
lower sequence: EFJ34717 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 14
AGTTTGAATTCCAAGATCCACCACAATAATCTCATCAACAACATATTAGCCAAGgttagttgcaccctgacgacagagtgagcttattgtctgattgccttttgaattttaggttgaacaattctgtaatttctgcatacacgctcgaccattc
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TGCCTAGATTCCAAGATTCACCATAACAATCTCATCAACAACATACTTGCGAAGgtctgtttttctgtgatgtc--------cttttcgaagattcacgcatagcgtttttcatag--------------------------------------