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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATGCTGCTAAACAAAGTGCCCTTTCCGTTGCCAACCCCATCAATTTTCAACAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatgatatcttatgattgatctgtaacctattgtttgcacaagctcacatttgtttctggggacataatacag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g57180.2
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86837770|gb|CI343236.1|CI343236
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|11442907|gb|BF430806.1|BF430806
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|4714677|gb|AU055794.1|AU055794
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86422921|gb|CI060494.1|CI060494
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88452296|gb|CI555373.1|CI555373
EST:     ATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: ATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88253333|gb|CI351959.1|CI351959
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88253028|gb|CI351654.1|CI351654
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|8527634|gb|AU092449.1|AU092449
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCCCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86483944|gb|CI126577.1|CI126577
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88200155|gb|CI200005.1|CI200005
EST:     GTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTGTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: GTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88246401|gb|CI246250.1|CI246250
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86863274|gb|CI344948.1|CI344948
EST:     CAAAGATCAGATTAAGGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86496928|gb|CI139561.1|CI139561
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|29673109|gb|CB669384.1|CB669384
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88411377|gb|CI518901.1|CI518901
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88227607|gb|CI227087.1|CI227087
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86832565|gb|CI339305.1|CI339305
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86423690|gb|CI062451.1|CI062451
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88906036|gb|CI089622.1|CI089622
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88428106|gb|CI557000.1|CI557000
EST:     CCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86861707|gb|CI329507.1|CI329507
EST:     CAAAGATCATATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88222421|gb|CI222377.1|CI222377
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88985739|gb|CI033068.1|CI033068
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88831558|gb|CI369240.1|CI369240
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86831290|gb|CI297559.1|CI297559
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88246883|gb|CI244660.1|CI244660
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88266859|gb|CI368635.1|CI368635
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|4714310|gb|AU058277.1|AU058277
EST:     ATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: ATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86599963|gb|CI258303.1|CI258303
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86435376|gb|CI106609.1|CI106609
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|11564837|gb|AU165473.1|AU165473
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86546884|gb|CI187090.1|CI187090
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88834503|gb|CI077786.1|CI077786
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88843107|gb|CI372007.1|CI372007
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88971172|gb|CI387157.1|CI387157
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGTTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|2310874|gb|C27029.1|C27029
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCCCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|29671359|gb|CB667634.1|CB667634
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86435209|gb|CI106442.1|CI106442
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88250225|gb|CI348455.1|CI348455
EST:     ATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: ATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86837459|gb|CI345692.1|CI345692
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTGTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86508531|gb|CI151164.1|CI151164
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|89187584|gb|CI115030.1|CI115030
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|86895469|gb|CI331314.1|CI331314
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88834840|gb|CI370143.1|CI370143
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88842752|gb|CI371652.1|CI371652
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|8856604|gb|AU093922.1|AU093922
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88226483|gb|CI226399.1|CI226399
EST:     AATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: AATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
EST: gi|88730417|gb|CI754030.1|CI754030
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCANAAATTGAAGGGT
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGT
EST: gi|86835493|gb|CI347950.1|CI347950
EST:     CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATG                         CTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC
genomic: CAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatga ... cataatacagCTCTCACCTTTTCGGACCTCGGAATCGTGCCTCACAAATTGAAGGGTTACC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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ATGCTGCTAAACAAAGTGCCCTTTCCGTTGCCAACCCCATCAATTTTCAACAAAGATCAGATTAATGCATTTTCTGTAGACACCCTAGTGTCTGATAATGgtaagcatgatatcttatgattgatctgtaacctattgtttgcacaagctcacatttgtttctggggacataatacag

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