1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
GAGTTCATGATCCTTCCTACTGGGGCCGCTTCATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattctttcatcttcattttaaaccttttccccatcttacgtcattgaaaattaattaattttatctgtacag
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os10g08550.3 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58689303|gb|CK077990.1|CK077990
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: GTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58675782|gb|CK064469.1|CK064469
genomic: GTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|117224917|gb|CT845976.1|CT845976
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29688336|gb|CB684611.1|CB684611
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58687518|gb|CK076205.1|CK076205
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGAEST: gi|319908690|gb|HS977818.1|HS977818
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGA
EST: GTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33676058|gb|CF304297.1|CF304297
genomic: GTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33675547|gb|CF303786.1|CF303786
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGEST: gi|29656140|gb|CB652415.1|CB652415
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATG
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCACGATGCCCACCAATGTTGGTGATGAEST: gi|29678862|gb|CB675137.1|CB675137
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCC-ACCAATGTTGGTGATGA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58597291|gb|CK007819.1|CK007819
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|319908492|gb|HS977620.1|HS977620
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: GTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33674962|gb|CF303201.1|CF303201
genomic: GTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|427989|gb|D24135.1|D24135
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29644081|gb|CB649088.1|CB649088
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29665470|gb|CB661745.1|CB661745
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29679887|gb|CB676162.1|CB676162
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|396941266|gb|HO188475.1|HO188475
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|428358|gb|D24506.1|D24506
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|23513780|gb|BU673306.1|BU673306
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAAACTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29619828|gb|CB624840.1|CB624840
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29657924|gb|CB654199.1|CB654199
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29668022|gb|CB664297.1|CB664297
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: ATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGEST: gi|58588647|gb|CF986955.1|CF986955
genomic: ATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACC-TGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATG
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58606067|gb|CK034100.1|CK034100
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58662698|gb|CK051384.1|CK051384
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33676198|gb|CF304437.1|CF304437
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|30228895|gb|CB966786.1|CB966786
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29668592|gb|CB664867.1|CB664867
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29626887|gb|CB631898.1|CB631898
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: AAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29681677|gb|CB677952.1|CB677952
genomic: AAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|319908681|gb|HS977809.1|HS977809
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|30229421|gb|CB967312.1|CB967312
genomic: CCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|2312016|gb|C28171.1|C28171
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58673278|gb|CK061964.1|CK061964
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58683046|gb|CK071733.1|CK071733
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33676308|gb|CF304547.1|CF304547
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58681144|gb|CK069831.1|CK069831
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATEST: gi|29659230|gb|CB655505.1|CB655505
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGAT
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|14192326|gb|AU184537.1|AU184537
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29682743|gb|CB679018.1|CB679018
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29677116|gb|CB673391.1|CB673391
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATEST: gi|29679137|gb|CB675412.1|CB675412
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGAT
EST: CATTCAAAGAGGCCATGAACATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|27554031|gb|CA997931.1|CA997931
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29668244|gb|CB664519.1|CB664519
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58603616|gb|CK014144.1|CK014144
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAAACTGAAG TCTGTTATCCAGAAGAAGEST: gi|29678678|gb|CB674953.1|CB674953
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAG
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29623734|gb|CB628745.1|CB628745
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|218504551|gb|FG952364.1|FG952364
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTAGAAGTGTACCACACCCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|33676730|gb|CF304969.1|CF304969
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29639493|gb|CB644502.1|CB644502
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|88401721|gb|CI591048.1|CI591048
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: AGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|218483031|gb|FG953128.1|FG953128
genomic: AGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29629934|gb|CB634943.1|CB634943
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29667979|gb|CB664254.1|CB664254
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58666297|gb|CK054983.1|CK054983
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: ATTCAACGGAGG-CATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29656696|gb|CB652971.1|CB652971
genomic: ATTCAA-GGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58662604|gb|CK051290.1|CK051290
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29664966|gb|CB661241.1|CB661241
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58673211|gb|CK061897.1|CK061897
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAACGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCCAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATEST: gi|29659075|gb|CB655350.1|CB655350
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGAT
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|58663601|gb|CK052287.1|CK052287
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|29684326|gb|CB680601.1|CB680601
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAEST: gi|319908667|gb|HS977795.1|HS977795
genomic: CATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
EST: CCACAACCTGAAG TCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
genomic: CCACAACCTGAAGgtaattcttt ... atctgtacagTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAGTTCATGATCCTTCCTACTGGGGCCGCTTCATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGgtaattctttcatcttcattttaaaccttttccccatcttacgtcattgaaaattaattaattttatctgtacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG