1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
ATGGAGAAAAGTGCCGTTCTTTTTAGGCCAAAGTTGATCGTTGCGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaattttactgctcaatagtgcatgctgaatcttcaccttctgtaatcagtcaaataattcacttgttatgcaatctgcag
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os03g52840.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|25798315|gb|CA754276.1|CA754276
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|27576793|gb|CA999487.1|CA999487
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29624282|gb|CB629293.1|CB629293
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: GGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCCGAAAG GTT-GTGACAAGCEST: gi|29619822|gb|CB624834.1|CB624834
genomic: GGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAA-Ggtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGC
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTEST: gi|29638078|gb|CB643087.1|CB643087
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29624606|gb|CB629617.1|CB629617
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58689542|gb|CK078229.1|CK078229
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: GGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACCATGACCGCATGCGGCAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGEST: gi|29621132|gb|CB626143.1|CB626143
genomic: GGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGG-AAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAG
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGEST: gi|38472528|gb|CF956660.1|CF956660
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAG
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29641599|gb|CB646606.1|CB646606
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58661735|gb|CK050415.1|CK050415
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|117244508|gb|CT848411.1|CT848411
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCACATATGGCACATATCAGTEST: gi|58589569|gb|CF987877.1|CF987877
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGAGTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGCACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGEST: gi|29614628|gb|CB619641.1|CB619641
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTG-ACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAG
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29670801|gb|CB667076.1|CB667076
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58691585|gb|CK080272.1|CK080272
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|13420583|gb|AU174673.1|AU174673
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29646105|gb|CB651112.1|CB651112
genomic: CGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29618036|gb|CB623048.1|CB623048
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29681406|gb|CB677681.1|CB677681
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|14571290|gb|BI118658.1|BI118658
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29646445|gb|CB651452.1|CB651452
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATEST: gi|29629705|gb|CB634714.1|CB634714
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATAT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|38472219|gb|CF956350.1|CF956350
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29674038|gb|CB670313.1|CB670313
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|33800499|gb|CF326119.1|CF326119
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29678030|gb|CB674305.1|CB674305
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAAGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29681405|gb|CB677680.1|CB677680
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|38471655|gb|CF955786.1|CF955786
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58695121|gb|CK083808.1|CK083808
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29672938|gb|CB669213.1|CB669213
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29622694|gb|CB627705.1|CB627705
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|84117692|gb|CD285458.1|CD285458
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|33381615|gb|CF196958.1|CF196958
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|29630142|gb|CB635151.1|CB635151
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAAGGCA-TACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGEST: gi|29613481|gb|CB618494.1|CB618494
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAA-GGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAG
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCEST: gi|29674139|gb|CB670414.1|CB670414
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGC
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58692794|gb|CK081481.1|CK081481
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|58609394|gb|CK037427.1|CK037427
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|4714773|gb|AU055890.1|AU055890
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|11442623|gb|BF430526.1|BF430526
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGTEST: gi|218505280|gb|FG952910.1|FG952910
genomic: CGGGTGCAAGTGCATATGCGCGTCTTTATGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAGT
EST: TGACTATGACCGCATGCGGAAG GTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATCAAG
genomic: TGACTATGACCGCATGCGGAAGgtgaatttta ... caatctgcagGTTTGTGACAAGCAGAAGGCAATACTTCTAGCAGATATGGCACATATC-AG