Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATCACTGACTGAACTTTCATTTAACTGGACGGGCTTCATCAATGCTATGATCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcctcttttgtgctaatctgttgattcatcacctttttttttttgcctcatgggattttgcgttgattcctgattctgtcctttctgacgttaaaaaaccattttcactgttgcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g13770.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g13770.3 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G070605_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 7
ATCACTGACTGAACTTTCATTTAACTGGACGGGCTTCATCAATGCTATGATCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcctcttttgtgctaatctgttgattcatcacctttttttttttgcctcatgggattttgcgttgattcctgattctgtcctttctgacgttaaaaaaccattttcactgttgcag
||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||     ||  |   |  ||| |||  || | ||| |  || |  |   |  ||| |||                                                           
ATCCCTTACTGAGCTCTCATTCAACTGGACTGGCTTCATCAATGCCATGATATCAAACATCTCATTCACCTACAGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCCATGgtctgt--tgtttacgatttgctctcttg--tcttaaccatccttctaatcgtttctggcattgcag-------------------------------------------------------

upper sequence: LOC_Os01g13770.3 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: AT5G46110.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 7
ATCACTGACTGAACTTTCATTTAACTGGACGGGCTTCATCAATGCTATGATCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcctcttttgtgctaatctgttgattcatcacctttttttttttgcctcatgggattttgcgttgattcctgattctgtcctttctgacgttaaaaaaccattttcactgttgcag
 ||||| ||||| || ||||| ||||||   || ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||  |   ||||     |||                | ||||||    | |   ||    ||  |  |||||| | ||  ||||   || ||   ||  |                     
TTCACTAACTGAGCTATCATTCAACTGGCTCGGTTTCATCAGTGCTATGATATCAAACATTTCTTTCACTTACCGAAGCATCTTCTCCAAGAAAGCCATGgttcttcattcttcccctcta----------------cattttttacgctactaaatcatgttaaggtttgatttcggaaactgt--attgtgtttttgcag--------------------
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|29661885|gb|CB658160.1|CB658160
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29687904|gb|CB684179.1|CB684179
EST:     CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|325493498|gb|JG458022.1|JG458022
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29679987|gb|CB676262.1|CB676262
EST:     TCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|55408699|gb|CV721075.1|CV721075
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29685328|gb|CB681603.1|CB681603
EST:     CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29666541|gb|CB662816.1|CB662816
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29671527|gb|CB667802.1|CB667802
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|84117005|gb|CD150772.1|CD150772
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGGCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29616354|gb|CB621366.1|CB621366
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29616223|gb|CB621235.1|CB621235
EST:     CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: CATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|58690439|gb|CK079126.1|CK079126
EST:     CAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: CAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29663112|gb|CB659387.1|CB659387
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|313084102|gb|HO213885.1|HO213885
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29618840|gb|CB623852.1|CB623852
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29613763|gb|CB618776.1|CB618776
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|56157641|gb|C24843.2|C24843
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29658696|gb|CB654971.1|CB654971
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29659419|gb|CB655694.1|CB655694
EST:     CAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: CAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|44677263|gb|CR290697.1|CR290697
EST:     TCTAACATCTCATTCACTTAACCGGAGCATTTATTCCAACGAAAGCTATG                         ACTGATATGGGTAGCGCCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATCGCCCTT
genomic: TCTAACATCTCATTCACTT-ACCGGAGCATTTATTCCAA-GAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29662714|gb|CB658989.1|CB658989
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29663111|gb|CB659386.1|CB659386
EST:     CCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCGTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: CCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29671609|gb|CB667884.1|CB667884
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29616222|gb|CB621234.1|CB621234
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATAT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATAT
EST: gi|29685820|gb|CB682095.1|CB682095
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29685985|gb|CB682260.1|CB682260
EST:     TCTTTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29660916|gb|CB657191.1|CB657191
EST:     TCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29657796|gb|CB654071.1|CB654071
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29643944|gb|CB648951.1|CB648951
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|25797136|gb|CA753097.1|CA753097
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29643945|gb|CB648952.1|CB648952
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29656095|gb|CB652370.1|CB652370
EST:     CAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: CAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29661884|gb|CB658159.1|CB658159
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29683569|gb|CB679844.1|CB679844
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29658105|gb|CB654380.1|CB654380
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29655875|gb|CB652150.1|CB652150
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29636760|gb|CB641769.1|CB641769
EST:     TCTCTAACATCTCATTCAC-TACCGGAGCA-TTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29642430|gb|CB647437.1|CB647437
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|29657881|gb|CB654156.1|CB654156
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
EST: gi|88342868|gb|CI640201.1|CI640201
EST:     TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATG                         ACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT
genomic: TCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 74 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 98

ATCACTGACTGAACTTTCATTTAACTGGACGGGCTTCATCAATGCTATGATCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcct ... actgttgcagACTGATATGGATAGCACCAATGTGTATGCTTATATCTCAATAATTGCCCTTATTGTGTGCATTCCACCAGCAGTGATC




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ATCACTGACTGAACTTTCATTTAACTGGACGGGCTTCATCAATGCTATGATCTCTAACATCTCATTCACTTACCGGAGCATTTATTCCAAGAAAGCTATGgtttgtgcctcttttgtgctaatctgttgattcatcacctttttttttttgcctcatgggattttgcgttgattcctgattctgtcctttctgacgttaaaaaaccattttcactgttgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA