Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacattaaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatataccactgtttgcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os07g42300.2
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G031545_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacatt-----aaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggt-tagattgtgacatgaatatataccactgtttgcag
|| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | | || || | ||| | |||| ||| || | | ||||||| |||| || ||| | |||||||
GTTTTACTTGATGTGAAGCCATGGGACGATGAGACTGACATGGCCAAGCTCGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGGCTGCTCTGGGGCGCATgtatgttacctcagttttccgcgcattaatttagtcattcatgaacttgtttttttaaccatttagtatggtttgtgacgtgaacatctactgccctttgcag

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G153569_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacattaaatttcttcctac-gaatgtactgtcttttgcttttgctag----tttggtta-gattgtgacatgaatatataccactgtttgcag
|| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || | || | || |||| | || | | |||| | | ||| |||| | || ||| ||| || ||| | |||||||
GTTTTACTTGATGTGAAGCCATGGGACGATGAGACTGACATGGCCAAGCTCGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacctcagtt--ttcacacacacagaattttgtgaatcacacatttgtttgaccatttagttatgtttctgatgcgaacatttactgccctttgcag

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GLYMA04G37120.2 (Glycine max), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact---acattaaatttcttcctacgaatgtact---gtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatata-ccactgtttgcag
|| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||| | ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| | | | || ||||| | | | || || || |||| ||| | | |||| | || | ||| ||| | |
----TGTTGGATGTAAAACCATGGGATGATGAAACTGACATGAAGAAGCTTGAAGAATCAGTGAGATCTGTTCAGATGGAAGGGTTGCTTTGGGGTGCATGTATgttatttttatgtagaagttctttttttttttttgctatggttattgatatttgtacatttcttgactttgttaactgttttaataaccaaagcctttga

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GLYMA06G17930.1 (Glycine max), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact---acattaaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatataccactgtttgcag----
|| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| || | | || ||| ||||| | | | || | ||| | || || || || || | | || || | | | | |
GTTCTGTTGGATGTGAAACCATGGGACGATGAAACTGACATGAAGAAGCTCGAAGAAGCAGTGAGATCTGTTCAGATGGAAGGGTTGCTTTGGGGTGCATgtatgctatttttatataaaagttcttgttttg---gctttggttattgatatttttacatttctt-gacttcgttatccattttcattctgatctacttcata

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GLYMA04G37120.1 (Glycine max), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact---acattaaatttcttcctacgaatgtact---gtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatata-ccactgtttgcag
|| || | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||| | ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| | | | || ||||| | | | || || || |||| ||| | | |||| | || | ||| ||| | |
GTTCTGTTGGATGTAAAACCATGGGATGATGAAACTGACATGAAGAAGCTTGAAGAATCAGTGAGATCTGTTCAGATGGAAGGGTTGCTTTGGGGTGCATgtatgttatttttatgtagaagttctttttttttttttgctatggttattgatatttgtacatttcttgactttgttaactgttttaataaccaaagcct----

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: Vv17s0000g01540.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 6
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacattaaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatatac-cactgtttgcag--
|| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||| || | | |||| |||||||| | | ||||| ||||||| || | | |||| | || || | || || | | | | | | | || ||| || || ||||
GTTTTGTTGGATGTGAAACCATGGGATGATGAGACTGACATGAAAAAGCTTGAGGAAGCAGTACGTAGCATTAAAATGGAAGGGTTGTTATGGGGAGCATgtacgtcttttctcctctcatcttattgtagattacatgcagcactccatttcttgcaacgcaaattatttccttaaaaatacacgttttgattgccttg

upper sequence: LOC_Os07g42300.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: PP1S145_172V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacattaaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggt-tagattgtgacatgaatat--ataccactgtttgcag---------------------------------------
| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||| | ||||| || || |||||||| || |||| || | | ||| || | | || |||||| | | || | ||| || || | | | | | | ||||
ATTGTCATGGACGTCAAGCCATGGGACGATGAGACTGACATGGTGAAGTTGGAGGAGTGTGTTCGATCTGTCCAAATGGAGGGTCTGCTTTGGGGTGCCTgtaagtgattt--ttacggttacgggt-cacctgggctgtctgaagatatttccagtacagtgtatcgtacgcttttgactctaaaattgtagtttatgtcaatgagcatgcactcatgcatgattttgctcgatgcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88509073|gb|CI436579.1|CI436579
EST:     GGAAGAAGCTTTGAGGAATTTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218483403|gb|FG957310.1|FG957310
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218484393|gb|FG946270.1|FG946270
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATTCA-GAAATTGCAAATCATGATG
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTAT-CAAGAAATTGCAAATCATGATG
EST: gi|58672645|gb|CK061331.1|CK061331
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33680932|gb|CF309171.1|CF309171
EST:     GAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGAATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGA-TGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88908357|gb|CI090950.1|CI090950
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|5667590|gb|AU077850.1|AU077850
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88460941|gb|CI553077.1|CI553077
EST:     GATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33690960|gb|CF319199.1|CF319199
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|30229260|gb|CB967151.1|CB967151
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86527856|gb|CI168062.1|CI168062
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88219297|gb|CI218857.1|CI218857
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33655975|gb|CF278589.1|CF278589
EST:     GGAAGAAGCTGTGGGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88207126|gb|CI206975.1|CI206975
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86419751|gb|CI054552.1|CI054552
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86512252|gb|CI154885.1|CI154885
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCGAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|87013473|gb|CI267174.1|CI267174
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88275661|gb|CI396265.1|CI396265
EST:     TGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: TGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|3763608|gb|AU030360.1|AU030360
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88219868|gb|CI219428.1|CI219428
EST:     GAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33656938|gb|CF279552.1|CF279552
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88843274|gb|CI372174.1|CI372174
EST:     TGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: TGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55437309|gb|CV731870.1|CV731870
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|27577606|gb|CB000301.1|CB000301
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGCTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55438684|gb|CV732639.1|CV732639
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33803562|gb|CF327656.1|CF327656
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGGTGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33807866|gb|CF329825.1|CF329825
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|5667589|gb|AU077849.1|AU077849
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88485738|gb|CI423009.1|CI423009
EST:     AAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: AAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88444288|gb|CI555005.1|CI555005
EST:     AGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: AGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33803849|gb|CF327799.1|CF327799
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTCGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88979877|gb|CI026175.1|CI026175
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88268540|gb|CI378475.1|CI378475
EST:     GGAAGAAGCTTTGA-GAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88967360|gb|CI002517.1|CI002517
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33804908|gb|CF328331.1|CF328331
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|87013461|gb|CI267162.1|CI267162
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33681885|gb|CF310124.1|CF310124
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218480661|gb|FG956911.1|FG956911
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58610571|gb|CK038283.1|CK038283
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAA
EST: gi|88460329|gb|CI529404.1|CI529404
EST:     GGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTCCAAATCATGATGA
genomic: GGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88239069|gb|CI240231.1|CI240231
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGTTGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|14981428|gb|BI306106.1|BI306106
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88965469|gb|CI011680.1|CI011680
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88409021|gb|CI556729.1|CI556729
EST:     TCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: TCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86602012|gb|CI260482.1|CI260482
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33659471|gb|CF282084.1|CF282084
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|15850610|gb|BI798900.1|BI798900
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCCAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88906552|gb|CI375624.1|CI375624
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|89196943|gb|CI021783.1|CI021783
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86855692|gb|CI269019.1|CI269019
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCTTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|87020444|gb|CI263307.1|CI263307
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218492263|gb|FG946211.1|FG946211
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGGCAA-TCATGATG
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTG-CAAATCATGATG
EST: gi|218479613|gb|FG956760.1|FG956760
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTAGGGGCGCAT                         CCAAACTTGTCCCGGTAGGTTACGGTATCAAGAAAT-GCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218481300|gb|FG969692.1|FG969692
EST:     GGAACAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAACTTGTCCCGGTTGGTTAC
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTAC
EST: gi|58676446|gb|CK065133.1|CK065133
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGT
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGT
EST: gi|88275019|gb|CI395623.1|CI395623
EST:     AAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: AAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86834896|gb|CI345980.1|CI345980
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86602020|gb|CI260490.1|CI260490
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88214185|gb|CI214034.1|CI214034
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55439131|gb|CV732867.1|CV732867
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33692651|gb|CF320890.1|CF320890
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|287255|gb|D16057.1|D16057
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58680576|gb|CK069263.1|CK069263
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCAT
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCAT
EST: gi|15853392|gb|BI806188.1|BI806188
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTT-GGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|27576449|gb|CA999143.1|CA999143
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86422656|gb|CI060229.1|CI060229
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|218505296|gb|FG958824.1|FG958824
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|30229580|gb|CB967471.1|CB967471
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|29645214|gb|CB650221.1|CB650221
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACAGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|287047|gb|D15852.1|D15852
EST:     GGAAGAAGCTGTNAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58687056|gb|CK075743.1|CK075743
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTACGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86540260|gb|CI180466.1|CI180466
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCTCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|12405298|gb|AU166899.1|AU166899
EST:     AGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: AGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33808089|gb|CF329934.1|CF329934
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86490472|gb|CI133105.1|CI133105
EST:     CCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: CCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|15849012|gb|BI797288.1|BI797288
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|8857935|gb|AU095253.1|AU095253
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|15849253|gb|BI797529.1|BI797529
EST:     GGAAGAA-CTGTGAGGAATGTTAAGATGGAA-GCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55442287|gb|CV734463.1|CV734463
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88447397|gb|CI544271.1|CI544271
EST:     CCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: CCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33680933|gb|CF309172.1|CF309172
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33691883|gb|CF320122.1|CF320122
EST:     GGAATAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33655217|gb|CF277831.1|CF277831
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88518266|gb|CI445920.1|CI445920
EST:     GAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCGAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33679409|gb|CF307648.1|CF307648
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88901976|gb|CI374584.1|CI374584
EST:     GGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88504622|gb|CI432128.1|CI432128
EST:     AGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: AGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88216505|gb|CI216354.1|CI216354
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88225432|gb|CI225348.1|CI225348
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86419619|gb|CI054420.1|CI054420
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86868522|gb|CI343094.1|CI343094
EST:     CCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: CCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|42591762|gb|CK738248.1|CK738248
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|29645213|gb|CB650220.1|CB650220
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACAGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33655216|gb|CF277830.1|CF277830
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33806186|gb|CF328973.1|CF328973
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88834013|gb|CI077494.1|CI077494
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88480701|gb|CI417972.1|CI417972
EST:     ATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: ATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86840388|gb|CI342573.1|CI342573
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGCTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33654685|gb|CF277299.1|CF277299
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58696285|gb|CK084972.1|CK084972
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33816966|gb|CF334316.1|CF334316
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|87022364|gb|CI282316.1|CI282316
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33654054|gb|CF276668.1|CF276668
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55441829|gb|CV734241.1|CV734241
EST:     GATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|87009288|gb|CI313761.1|CI313761
EST:     AGAAGCTGTGAGGGATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTT-TCCCGGGTTGGTTACGGTATCAAAAAATTGCAAATCATGATG
genomic: AGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCC-GGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATG
EST: gi|88215306|gb|CI215155.1|CI215155
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58691095|gb|CK079782.1|CK079782
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|58680920|gb|CK069607.1|CK069607
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86429954|gb|CI082377.1|CI082377
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|55439439|gb|CV733028.1|CV733028
EST:     TGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: TGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88254399|gb|CI353223.1|CI353223
EST:     CTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: CTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|88216730|gb|CI216579.1|CI216579
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|86428563|gb|CI075244.1|CI075244
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
EST: gi|33690839|gb|CF319078.1|CF319078
EST:     GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCAT                         CCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA
genomic: GGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttact ... ctgtttgcagCCAAGCTTGTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAATTGCAAATCATGATGA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGACATGACCAAATTGGAAGAAGCTGTGAGGAATGTTAAGATGGAAGGCCTCCTTTGGGGCGCATgtatgttactacattaaatttcttcctacgaatgtactgtcttttgcttttgctagtttggttagattgtgacatgaatatataccactgtttgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG