Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttctgtttaccggtctctgcttcatgatatctcttgtgataatttctattcctgtcatgtttccactttccacacaactgtctgccttaatta...

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os06g06030.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os06g06030.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G102596_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 6
TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttctgtttaccggtctctgcttcatgatatctcttgtgataatttctattcctgtcatgtttccactttccacacaactgtctgccttaatta--
|||||||     ||| ||||||||||||| || || |||||  | |||||||||||    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |     | || ||  |  | | |  | | || || ||        | || |  | |||      | |  | |||   ||   ||  
TACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGCTATTTATGGGGCAACATTCCGTGATGCAGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGTGgtatg-tttcagtatgctttgttatgtttatttctgttttat-ttattatgtcaccatagttaatctcgctactggtattagatatatctaatttttctatt

upper sequence: LOC_Os06g06030.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: AT1G13060.2 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 8
TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttctgtttaccggtctctgcttca----tgatatctc-ttgtgataatttctattcctgtcatgtttccactttccacacaactgtctgccttaatta
|||   ||||  ||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||   || |||||||  |   ||||  | |   ||| || ||||    | |||| |   | | |  |||   |||    ||||   |    | ||  | ||  || |           
TACAAATATGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgttagtaatctgaatgc--atctgtggttcaaatgtaatatttaactttcaagattctgatttagctcataagtttgttctcttctcatatgaccag--------

upper sequence: LOC_Os06g06030.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
lower sequence: Vv01s0010g02900.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 7
TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttctgtttaccggtctctgcttcatgatatctcttgtg-ata-atttctattcctgtcat-gtttccactttccacacaactgtctgccttaatta
||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| || || || ||  ||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||   ||  |||||||     ||| | |  |  |||||   ||    | || | |||| ||| ||    ||   |||  | || |  ||  |  | |||  | | |    | |   
TACCGTTATGATATGTCTGTTGAGGAAGCTGCTGAATTGGCTAGACGATCTATTTATCATGCGACATTCCGTGATGGAGCTAGTGGTGGAGTTGCAAGCGgtacttactctctctctctctctctctctctctctctcccatgtggatacatacaaatgtatgtagttgtgtttacggtttaaacatgtattttttgttag--

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86834043|gb|CI340182.1|CI340182
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88220599|gb|CI220159.1|CI220159
EST:     TATTTACCGAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCCTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87013546|gb|CI267247.1|CI267247
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88440666|gb|CI552132.1|CI552132
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCNTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|8856468|gb|AU093786.1|AU093786
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88266958|gb|CI378893.1|CI378893
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89162787|gb|CI099677.1|CI099677
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87011551|gb|CI279460.1|CI279460
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88222659|gb|CI222615.1|CI222615
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|58663124|gb|CK051810.1|CK051810
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88274588|gb|CI394994.1|CI394994
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|9886191|gb|AU102084.1|AU102084
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86863036|gb|CI344817.1|CI344817
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88560672|gb|CI491358.1|CI491358
EST:     GCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGNTGGTTNTGTTAGCN                         TTTACCATNTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: GCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86538793|gb|CI178999.1|CI178999
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86256727|gb|CI061490.1|CI061490
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|3766709|gb|AU030819.1|AU030819
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|13896917|gb|AU183253.1|AU183253
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86508934|gb|CI151567.1|CI151567
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86546954|gb|CI187160.1|CI187160
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|15858319|gb|BI811131.1|BI811131
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88955901|gb|CI092189.1|CI092189
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86600016|gb|CI258356.1|CI258356
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|15853058|gb|BI805854.1|BI805854
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|29669743|gb|CB666018.1|CB666018
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|8858108|gb|AU095426.1|AU095426
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86596410|gb|CI284721.1|CI284721
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86885132|gb|CI315703.1|CI315703
EST:     AAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: AAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88906907|gb|CI375979.1|CI375979
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGTTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|5455491|gb|AU075627.1|AU075627
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|13806470|gb|AU181535.1|AU181535
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89163801|gb|CI100691.1|CI100691
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|1631791|gb|C19520.1|C19520
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCT
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCT
EST: gi|3762860|gb|AU029612.1|AU029612
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88243749|gb|CI242871.1|CI242871
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGACGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88376377|gb|CI535481.1|CI535481
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCNTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88528619|gb|CI456869.1|CI456869
EST:     ACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: ACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86538200|gb|CI178406.1|CI178406
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|10931156|gb|AU161430.1|AU161430
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88323492|gb|CI556123.1|CI556123
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|58695529|gb|CK084216.1|CK084216
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87028445|gb|CI263787.1|CI263787
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|16754141|gb|BM038520.1|BM038520
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86846388|gb|CI280758.1|CI280758
EST:     TTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88976012|gb|CI024261.1|CI024261
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86258925|gb|CI004469.1|CI004469
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86432198|gb|CI085809.1|CI085809
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|286718|gb|D15525.1|D15525
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTTTGGAGATGATGTTT
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTT-
EST: gi|86484873|gb|CI127506.1|CI127506
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89196524|gb|CI399110.1|CI399110
EST:     TACATTCCGTGATGGGGCAANTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATTTTGGCCCCAACGGCTGNACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88549115|gb|CI478973.1|CI478973
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATNTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86433348|gb|CI093691.1|CI093691
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|58592922|gb|CF991230.1|CF991230
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86538820|gb|CI179026.1|CI179026
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGCTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88223908|gb|CI223757.1|CI223757
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87030568|gb|CI254997.1|CI254997
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88958388|gb|CI095906.1|CI095906
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88202289|gb|CI201151.1|CI201151
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89166369|gb|CI103459.1|CI103459
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88439552|gb|CI551786.1|CI551786
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|8857457|gb|AU094775.1|AU094775
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88829945|gb|CI004983.1|CI004983
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86546949|gb|CI187155.1|CI187155
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87020073|gb|CI277805.1|CI277805
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88264166|gb|CI367940.1|CI367940
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88444482|gb|CI557783.1|CI557783
EST:     AGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: AGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|18385671|gb|BM418870.1|BM418870
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|22307308|gb|BQ908530.1|BQ908530
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88244321|gb|CI243443.1|CI243443
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89168512|gb|CI038866.1|CI038866
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88266482|gb|CI377384.1|CI377384
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88839518|gb|CI005306.1|CI005306
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|14192133|gb|AU184344.1|AU184344
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88560157|gb|CI490793.1|CI490793
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88265791|gb|CI376693.1|CI376693
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGAT-GGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88212830|gb|CI210681.1|CI210681
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86839516|gb|CI339430.1|CI339430
EST:     ATTTACACAAGCGACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: ATTTAC-CAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89162316|gb|CI104644.1|CI104644
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88536746|gb|CI464529.1|CI464529
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86534366|gb|CI174572.1|CI174572
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88274184|gb|CI394590.1|CI394590
EST:     ATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTTGAGATGATGTTG
genomic: ATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAA-GTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86485240|gb|CI127873.1|CI127873
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGCCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|8858755|gb|AU096073.1|AU096073
EST:     TATTTNCCAAGCTNCATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88252338|gb|CI350766.1|CI350766
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGTTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|89164725|gb|CI101813.1|CI101813
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88984991|gb|CI011849.1|CI011849
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88439854|gb|CI541411.1|CI541411
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87030611|gb|CI255040.1|CI255040
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88204694|gb|CI204543.1|CI204543
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|87024937|gb|CI261446.1|CI261446
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88847618|gb|CI018309.1|CI018309
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|15848964|gb|BI797240.1|BI797240
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|88211012|gb|CI212445.1|CI212445
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|3762012|gb|C99260.1|C99260
EST:     TTTACCAAGCTACATTCCCGTGATGGGGCCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TTTACCAAGCTACATT-CCGTGATGGGG-CAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86878418|gb|CI319636.1|CI319636
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
EST: gi|86873262|gb|CI341487.1|CI341487
EST:     TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCG                         TTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG
genomic: TATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 71 (upstream exon), 43 (downstream exon)
Score: 31

TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttc ... tgaatttcagTTTACCATGTTGGCCCGAACGGCTGGACGAAGCTTTCTGGAGATGATGTTGGGGAGCTGCACTACAAGTACTACCCGGTTGAGGCCACTCCTGTCGAGCA




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TACCGCTATGTGATGCCAGTTGAGGAAGCTGCTGAGTTAGCAAGGCGGGCTATTTACCAAGCTACATTCCGTGATGGGGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGCGgtatgctttctgtttaccggtctctgcttcatgatatctcttgtgataatttctattcctgtcatgtttccactttccacacaactgtctgccttaatta

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG