1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GATGACGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACTGAAGAGGAGAAGAAGGCAGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatcctgcattatactataccatttttatgcaatgaataatacaattattcattttattttattctcatctgtagctgtaaattaagaccaaatcatcactattcattataatgcaaagtgctacttctaacttgtcaacacctttttattcag
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os07g42300.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|109974322|gb|DT806845.1|DT806845
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218504669|gb|FG959569.1|FG959569
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218484393|gb|FG946270.1|FG946270
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33793828|gb|CF322802.1|CF322802
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58672645|gb|CK061331.1|CK061331
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33680932|gb|CF309171.1|CF309171
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|5667590|gb|AU077850.1|AU077850
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33690960|gb|CF319199.1|CF319199
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|30229260|gb|CB967151.1|CB967151
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58691236|gb|CK079923.1|CK079923
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATEST: gi|218486383|gb|FG949948.1|FG949948
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGAT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGEST: gi|218487740|gb|FG962547.1|FG962547
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33679175|gb|CF307414.1|CF307414
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218490120|gb|FG959263.1|FG959263
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGTTGCTGTAAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTGAAATCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86419751|gb|CI054552.1|CI054552
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218500832|gb|FG957607.1|FG957607
genomic: TCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCAEST: gi|87013473|gb|CI267174.1|CI267174
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCA
EST: CTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|3763608|gb|AU030360.1|AU030360
genomic: CTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58604129|gb|CK014657.1|CK014657
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33656938|gb|CF279552.1|CF279552
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58585628|gb|CF983936.1|CF983936
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33803562|gb|CF327656.1|CF327656
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218487487|gb|FG950696.1|FG950696
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAACAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|5667589|gb|AU077849.1|AU077849
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCNCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33803849|gb|CF327799.1|CF327799
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|88979877|gb|CI026175.1|CI026175
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33804908|gb|CF328331.1|CF328331
genomic: TGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218480661|gb|FG956911.1|FG956911
genomic: GAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAA-GCTTCTGGC-AGAAGAANGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTEST: gi|58610571|gb|CK038283.1|CK038283
genomic: GCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAA-GGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|88239069|gb|CI240231.1|CI240231
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|14981428|gb|BI306106.1|BI306106
genomic: TCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|88965469|gb|CI011680.1|CI011680
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218481608|gb|FG958672.1|FG958672
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86602012|gb|CI260482.1|CI260482
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33659471|gb|CF282084.1|CF282084
genomic: GCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|15850610|gb|BI798900.1|BI798900
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGAGGAGCGTGCT-CTGCTGTCAAGGCTTCT-GCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|89196943|gb|CI021783.1|CI021783
genomic: TGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86855692|gb|CI269019.1|CI269019
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|87020444|gb|CI263307.1|CI263307
genomic: TGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218492263|gb|FG946211.1|FG946211
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218479613|gb|FG956760.1|FG956760
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218481300|gb|FG969692.1|FG969692
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58596563|gb|CK007091.1|CK007091
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTEST: gi|58676446|gb|CK065133.1|CK065133
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86602020|gb|CI260490.1|CI260490
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: CTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|88214185|gb|CI214034.1|CI214034
genomic: CTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: CTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|287255|gb|D16057.1|D16057
genomic: CTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58680576|gb|CK069263.1|CK069263
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86422656|gb|CI060229.1|CI060229
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218505296|gb|FG958824.1|FG958824
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|30229580|gb|CB967471.1|CB967471
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: TGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|29645214|gb|CB650221.1|CB650221
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218494827|gb|FG945588.1|FG945588
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|287047|gb|D15852.1|D15852
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: CAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33793482|gb|CF322624.1|CF322624
genomic: CAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTEST: gi|218502427|gb|FG965006.1|FG965006
genomic: GCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGG-AATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACEST: gi|58687056|gb|CK075743.1|CK075743
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAAC
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33808089|gb|CF329934.1|CF329934
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|15849012|gb|BI797288.1|BI797288
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GGCTTCTGGC-AGAAGAAGGAAT CT-GGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATTGTC-AACCATGGGACGATGAGACTEST: gi|58598400|gb|CK008928.1|CK008928
genomic: GGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGA-TGTCAAACCATGGGACGATGAGACT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTEST: gi|55442287|gb|CV734463.1|CV734463
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTT
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|38478961|gb|CF963094.1|CF963094
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58603875|gb|CK014403.1|CK014403
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33655217|gb|CF277831.1|CF277831
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33806188|gb|CF328974.1|CF328974
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|42591762|gb|CK738248.1|CK738248
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|29645213|gb|CB650220.1|CB650220
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218485855|gb|FG956449.1|FG956449
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33655216|gb|CF277830.1|CF277830
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33806186|gb|CF328973.1|CF328973
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33654685|gb|CF277299.1|CF277299
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218501608|gb|FG970643.1|FG970643
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCCAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58696285|gb|CK084972.1|CK084972
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|218494225|gb|FG955538.1|FG955538
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAATGTTGCTTGATGTCAA-CCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|33654054|gb|CF276668.1|CF276668
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58691095|gb|CK079782.1|CK079782
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|86429954|gb|CI082377.1|CI082377
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: GCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTGEST: gi|58609286|gb|CK037319.1|CK037319
genomic: GCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
EST: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAAT CTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCCAACCATGGGACGATGAGACTG
genomic: AGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatc ... ttttattcagCTGGGAAGTCCTCAGTGTTGCTTGATGTCAAACCATGGGACGATGAGACTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GATGACGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACTGAAGAGGAGAAGAAGGCAGCTGAGGAGCGTGCTGCTGCTGTCAAGGCTTCTGGCAAGAAGAAGGAATgtatgccatcctgcattatactataccatttttatgcaatgaataatacaattattcattttattttattctcatctgtagctgtaaattaagaccaaatcatcactattcattataatgcaaagtgctacttctaacttgtcaacacctttttattcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA