Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattccttttgcttgctaattaatttaattgttagaacattaaaaggcttttgaggaatcaaggacttatggcccatttatatattttcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g52860.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G015401_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattccttttgcttgct----aattaatttaattgttag---aacattaaaaggcttttgaggaatcaaggacttatggcccattt-atatat-tttcag
| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |  || |    |||      | ||| | ||| |  |    |||||  |||  |||  |||   |||   ||| ||      |||  | | | ||||||
GTCTCTTCACTAGAGGACTTCCTCTTCGTATCGTCATGATTGGTACCCTTACTGGTGCTCAGTGGGGAATTTACGATGCATTCAAAGTGATGGTTGGACTgtgagtgtctctctctactgccttaggaataagtgaatagccaccgcaacatccaaatccttcagagagctcaccaactaattctttgtttcgtttctgtttcag

upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G152827_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattccttttgcttgctaattaatttaattgttagaacattaaaaggcttttgaggaatcaaggacttatggcccatttatatat---tttcag
| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  || |    |||   |     |||       |||||  |||  |||  |||   |||   ||| ||      |||   | |   ||||||
GTCTCTTCACTAGAGGACTTCCTCTTCGTATCGTCATGATTGGTACCCTTACTGGTGCTCAGTGGGGAATTTACGATGCATTCAAAGTGATGGTTGGACTgtgagtatctctctctactgcct-taggaataaccaccgcaacatccaaatccttcagagagctcaccaactaattctttgtttcgttttctgtttcag

upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G060630_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattccttttgcttgctaattaatttaattgttagaacattaaaaggctttt--gaggaatcaaggacttatggcccatttatatattttcag
| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||||  | |  |||  ||    |  |||||  |     ||||  |||  ||||   | | | |     ||| |    ||||||
GTCTTTTCACTAGAGGGCTGCCTCTTCGTATCGTCATGATTGGTACCCTTACTGGTGCTCAGTGGGGAATTTACGATGCTTTCAAAGTGATGGTTGGACTgtgagtatctctactgctt--ttaggaat--aaccactgcaacatccatttttttttccgagagatcaccaattaacgttttgtttct---ctttcag

upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA16G05460.1 (Glycine max), 5'ss of exon 5
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc-cttttgcttgc----taattaatttaattgttagaacattaaaaggctt--ttgaggaatcaaggacttatggcccat-ttatatattttcag
  || || ||  | || || | | | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||| |  | |  ||| ||||||| | | |  ||||| |     | ||    ||   |  |   | ||  |  |  ||  || || | | | |  || |||    |  ||     ||  |||
ATCTCTTTACCCGTGGTCTTCTCTTCCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGAGACCAATGGGTTATATATGATGCATTGAAATTGTTTGCCGGATTgtaagtttacacaattgctagtcttatgatagggttccatactttcatatatattgttttccttcagtattgacgttctaatgaaataaatttccccttcccag

upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA16G05450.1 (Glycine max), 5'ss of exon 6
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc-cttttgcttgctaattaatttaatt----gttagaacattaaaaggctt--ttgaggaatcaaggacttatggcccat-ttatatattttcag
| || || ||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||    || ||| ||||||| | | |  ||||| | |   | ||    ||      |   | ||  |  |  ||  || || | | | |  || |||    |  ||     ||  |||
GTCTCTTTACCCGTGGTCTTCCCCTCCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGAGCCCAATGGGGAATATATGATGCATTCAAAGTGTCTGTCGGATTgtaagtttacacaattgctagttttatgatagggttccatactttcatatatattgttttccttcagtattgacgttctaatgaaataaatttccccttcccag

upper sequence: LOC_Os02g52860.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA19G27380.1 (Glycine max), 5'ss of exon 5
GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattccttttgcttgctaattaatttaattgttagaacattaaaaggcttttgaggaatcaaggacttatg-gcccatttatatattttcag
| || || ||  | || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | || ||| ||||||| | |       |||||| | |||   |  |||  |   ||  |      || |  |   | |  || ||| |    |||     ||  |||
GTCTCTTTACGCGTGGTCTCCCCCTCCGAATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGAGCCCAATGGGGAATATATGATGCATTCAAAGTCTTCGTCGGATTgtaagtttac---acaattgctagtcaatgatagggttccattctttcat--tccttcatcatggacgtgctaatgagattttttcccccttcccag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86600350|gb|CI356107.1|CI356107
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCAGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|116875543|gb|EC366051.1|EC366051
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88246899|gb|CI244676.1|CI244676
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|38473055|gb|CF957187.1|CF957187
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTGAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89188422|gb|CI115671.1|CI115671
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGGCT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88846150|gb|CI372918.1|CI372918
EST:     TGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89176585|gb|CI111301.1|CI111301
EST:     TCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCATCAGAGAAAGCATT
genomic: TCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86833812|gb|CI338183.1|CI338183
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|87029077|gb|CI351380.1|CI351380
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88958658|gb|CI096173.1|CI096173
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88268378|gb|CI378313.1|CI378313
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88268065|gb|CI378837.1|CI378837
EST:     CTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: CTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|4716135|gb|AU057251.1|AU057251
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86600207|gb|CI355964.1|CI355964
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGTTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|4716136|gb|AU057252.1|AU057252
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|29628300|gb|CB633311.1|CB633311
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88264204|gb|CI367978.1|CI367978
EST:     CTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: CTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88517954|gb|CI445608.1|CI445608
EST:     TTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88844935|gb|CI022289.1|CI022289
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|4716219|gb|AU057335.1|AU057335
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88908416|gb|CI091009.1|CI091009
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88967387|gb|CI002529.1|CI002529
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88257816|gb|CI360402.1|CI360402
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88258821|gb|CI359211.1|CI359211
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|29677044|gb|CB673319.1|CB673319
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|58030361|gb|CX727904.1|CX727904
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89167548|gb|CI108949.1|CI108949
EST:     CTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCAT
genomic: CTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTT-GGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCAT
EST: gi|88295827|gb|CI532788.1|CI532788
EST:     CAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: CAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86836660|gb|CI347302.1|CI347302
EST:     GTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: GTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88260307|gb|CI362600.1|CI362600
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGGTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88249127|gb|CI248976.1|CI248976
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89193791|gb|CI018109.1|CI018109
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|24468918|gb|CA305867.1|CA305867
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|14192021|gb|AU184232.1|AU184232
EST:     TTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|58663733|gb|CK052419.1|CK052419
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88990479|gb|CI107876.1|CI107876
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88255073|gb|CI353897.1|CI353897
EST:     AAAGTCATGGTT-GAAT                         TCCAACAACCGGTGTTGTTACGCCCGCGCCCGGTTCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: AAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89194306|gb|CI116743.1|CI116743
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86494238|gb|CI136871.1|CI136871
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|27576228|gb|CA998922.1|CA998922
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88997654|gb|CI390276.1|CI390276
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGNTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89198437|gb|CI007497.1|CI007497
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88254559|gb|CI353383.1|CI353383
EST:     GGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: GGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|58680384|gb|CK069071.1|CK069071
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86538072|gb|CI178278.1|CI178278
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|14981582|gb|BI306260.1|BI306260
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|66913316|gb|CX100164.1|CX100164
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|29658502|gb|CB654777.1|CB654777
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88247582|gb|CI247431.1|CI247431
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|2427781|gb|C72244.1|C72244
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGNCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|116874996|gb|EC365504.1|EC365504
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89190143|gb|CI392193.1|CI392193
EST:     ATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|29626662|gb|CB631673.1|CB631673
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88205289|gb|CI204675.1|CI204675
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88967755|gb|CI097997.1|CI097997
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAACAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86414392|gb|CI068795.1|CI068795
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|11025863|gb|AU162464.1|AU162464
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88958798|gb|CI381601.1|CI381601
EST:     TGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|18386983|gb|BM420181.1|BM420181
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88271169|gb|CI387024.1|CI387024
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|29630080|gb|CB635089.1|CB635089
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|23512666|gb|BU672789.1|BU672789
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86825668|gb|CI361815.1|CI361815
EST:     TCAAT-GGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86871547|gb|CI342346.1|CI342346
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88486455|gb|CI423726.1|CI423726
EST:     TCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88269618|gb|CI380916.1|CI380916
EST:     CTGGTGCTCAATGGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCAA
genomic: CTGGTGCTCAAT-GGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCC-AACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGC-A
EST: gi|88834813|gb|CI370116.1|CI370116
EST:     TATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86899604|gb|CI327477.1|CI327477
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTT-GACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86593967|gb|CI260196.1|CI260196
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|218500946|gb|FG958841.1|FG958841
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86832581|gb|CI345015.1|CI345015
EST:     ACT-GTGCTCAAT-GGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGG-TGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTG-TACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86845163|gb|CI341083.1|CI341083
EST:     GGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: GGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88259098|gb|CI363391.1|CI363391
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89168106|gb|CI109310.1|CI109310
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88220353|gb|CI219913.1|CI219913
EST:     ATTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88254753|gb|CI353577.1|CI353577
EST:     TGCTGAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86867837|gb|CI342744.1|CI342744
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88491391|gb|CI428663.1|CI428663
EST:     GCTTTTAAAGTCATGGGTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGGAAGCATT
genomic: GCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88966666|gb|CI365889.1|CI365889
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGTTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTCCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89194390|gb|CI116827.1|CI116827
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCGACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCCTT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88971994|gb|CI390577.1|CI390577
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88268477|gb|CI378412.1|CI378412
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86599153|gb|CI355770.1|CI355770
EST:     TGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|58030362|gb|CX727905.1|CX727905
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|4716218|gb|AU057334.1|AU057334
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88258789|gb|CI361375.1|CI361375
EST:     CTCAAT-GGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCACCAGAGAAAGCATT
genomic: CTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88837857|gb|CI371435.1|CI371435
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88264782|gb|CI368556.1|CI368556
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86513485|gb|CI156118.1|CI156118
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|116875503|gb|EC366011.1|EC366011
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGATT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|89163089|gb|CI099979.1|CI099979
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|88447001|gb|CI529044.1|CI529044
EST:     TTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: TTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
EST: gi|86544738|gb|CI184944.1|CI184944
EST:     ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACT                         TCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT
genomic: ACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 118

GCCTTTTCACTAGAGGACTGCCCCTTCGTATTGTTATGATTGGAACTCTTACTGGTGCTCAATGGGGTATTTATGATGCTTTTAAAGTCATGGTTGGACTgtaagtattc ... atattttcagTCCAACAACCGGTGGTGTTACGCCCGCGCCCGGTGCAGCAGAGAAAGCATTGCAAGCCAGTGCTTGATTCTTATGCAGAGATAATGGCGATGTATTCCTG




<











<


<