1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
CGAGAAGTCAACTTCAAGTATATTCCCTCTCCAAAATGTGTTCATCCGCAAGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaaccttattctcatgcctagctagatgcctttagtgctcctggttattcttctgagaaatgtattagcatggttattggctttggaatcttatt...
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g18550.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|86835774|gb|CI348211.1|CI348211
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTTACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88526583|gb|CI454656.1|CI454656
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88478024|gb|CI415295.1|CI415295
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|66914069|gb|CX100917.1|CX100917
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|89178872|gb|CI391870.1|CI391870
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88479496|gb|CI416767.1|CI416767
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88436068|gb|CI516604.1|CI516604
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATTTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88287397|gb|CI505088.1|CI505088
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|33687683|gb|CF315922.1|CF315922
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88995348|gb|CI036923.1|CI036923
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88292105|gb|CI534899.1|CI534899
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88303985|gb|CI513059.1|CI513059
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88476106|gb|CI413377.1|CI413377
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88420022|gb|CI516471.1|CI516471
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88294113|gb|CI510421.1|CI510421
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88283746|gb|CI405192.1|CI405192
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|3768838|gb|AU032865.1|AU032865
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGNTGAAGATCTTGAAGGCNCCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88568760|gb|CI499477.1|CI499477
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|10794795|gb|AU108761.1|AU108761
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|7652224|gb|AU089776.1|AU089776
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88217506|gb|CI217355.1|CI217355
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88518816|gb|CI445662.1|CI445662
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|13806235|gb|AU181434.1|AU181434
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|89190380|gb|CI015345.1|CI015345
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88469052|gb|CI504772.1|CI504772
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88508849|gb|CI436355.1|CI436355
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88293866|gb|CI507975.1|CI507975
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88283951|gb|CI405397.1|CI405397
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88484939|gb|CI422210.1|CI422210
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88484377|gb|CI421648.1|CI421648
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|163917976|gb|EG713138.1|EG713138
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88468503|gb|CI514985.1|CI514985
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88285122|gb|CI502459.1|CI502459
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88534527|gb|CI463254.1|CI463254
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|89192542|gb|CI016551.1|CI016551
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88487393|gb|CI424664.1|CI424664
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88459375|gb|CI517053.1|CI517053
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|3763664|gb|AU030416.1|AU030416
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|33690862|gb|CF319101.1|CF319101
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88520802|gb|CI447562.1|CI447562
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88487024|gb|CI424295.1|CI424295
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88287913|gb|CI510193.1|CI510193
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAGGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88514557|gb|CI442063.1|CI442063
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|86528407|gb|CI168613.1|CI168613
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|33692844|gb|CF321083.1|CF321083
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88413585|gb|CI526147.1|CI526147
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88506687|gb|CI434193.1|CI434193
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88531693|gb|CI460104.1|CI460104
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88515547|gb|CI443201.1|CI443201
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|55434421|gb|CV730333.1|CV730333
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATTTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACCCGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88486346|gb|CI423617.1|CI423617
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|8324478|gb|AU091628.1|AU091628
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88505623|gb|CI433129.1|CI433129
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|58682236|gb|CK070923.1|CK070923
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|3768002|gb|AU032029.1|AU032029
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88502706|gb|CI430212.1|CI430212
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|89193315|gb|CI050613.1|CI050613
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAAATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88503050|gb|CI430556.1|CI430556
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|55437151|gb|CV731774.1|CV731774
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88554508|gb|CI484691.1|CI484691
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCNAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88490478|gb|CI427750.1|CI427750
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88466074|gb|CI519947.1|CI519947
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88303077|gb|CI505689.1|CI505689
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|117246664|gb|CT863247.1|CT863247
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTAACA-GGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCEST: gi|218484338|gb|FG944231.1|FG944231
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTA-CAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGC
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88467518|gb|CI537160.1|CI537160
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: TTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88476656|gb|CI413927.1|CI413927
genomic: TTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88975212|gb|CI023463.1|CI023463
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88484531|gb|CI421802.1|CI421802
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|58662864|gb|CK051550.1|CK051550
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88970063|gb|CI383565.1|CI383565
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|23513540|gb|BU673185.1|BU673185
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|86546183|gb|CI186389.1|CI186389
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|33693182|gb|CF321421.1|CF321421
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACTCGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|86528436|gb|CI168642.1|CI168642
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88547868|gb|CI478196.1|CI478196
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|33687810|gb|CF316049.1|CF316049
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88287393|gb|CI505084.1|CI505084
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|3766601|gb|AU030711.1|AU030711
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88292114|gb|CI534908.1|CI534908
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|55438801|gb|CV732699.1|CV732699
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|86523587|gb|CI163793.1|CI163793
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|55439672|gb|CV733146.1|CV733146
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|88520491|gb|CI448145.1|CI448145
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTEST: gi|55434419|gb|CV730332.1|CV730332
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CGAGAAGTCAACTTCAAGTATATTCCCTCTCCAAAATGTGTTCATCCGCAAGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaaccttattctcatgcctagctagatgcctttagtgctcctggttattcttctgagaaatgtattagcatggttattggctttggaatcttatt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA