1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTACGTTCAAGCTGACACTTCAGTTTACTGAAGATTATCCTAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctctctccctgctgtttaatacttgcctgtggcatggttcctgtttcttacaagttataagtatttatgtggcatttcggaacaatagtctaac...
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g08960.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88844273|gb|CI005646.1|CI005646
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88560256|gb|CI490902.1|CI490902
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88988531|gb|CI037767.1|CI037767
genomic: CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|15850009|gb|BI798285.1|BI798285
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: AACAACCCACCCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTAC-AAACCAGTGGAGCEST: gi|11172348|gb|AU164240.1|AU164240
genomic: AACAAGCCA-CCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATG-CTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|66915271|gb|CX102119.1|CX102119
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|33677902|gb|CF306141.1|CF306141
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88241857|gb|CI241706.1|CI241706
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|25800383|gb|CA756344.1|CA756344
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88560096|gb|CI490726.1|CI490726
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGGTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88564684|gb|CI495401.1|CI495401
genomic: CTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|218505588|gb|FG952847.1|FG952847
genomic: TGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86828978|gb|CI282739.1|CI282739
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88470831|gb|CI408102.1|CI408102
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88485225|gb|CI422496.1|CI422496
genomic: TTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: ATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|218493155|gb|FG956466.1|FG956466
genomic: ATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|2311824|gb|C27979.1|C27979
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGEST: gi|33813641|gb|CF332707.1|CF332707
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAG
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|3767211|gb|AU031321.1|AU031321
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: AACAAGCCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|29619509|gb|CB624521.1|CB624521
genomic: AACAAG-CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88218009|gb|CI217858.1|CI217858
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACTAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86512221|gb|CI154854.1|CI154854
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: AGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|29619932|gb|CB624944.1|CB624944
genomic: AGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|33656466|gb|CF279080.1|CF279080
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88297132|gb|CI545222.1|CI545222
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|8857214|gb|AU094532.1|AU094532
genomic: CGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|38481076|gb|CF965165.1|CF965165
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTCGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAAGCAGTGGAGCCEST: gi|87033452|gb|CI188076.1|CI188076
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88531902|gb|CI458423.1|CI458423
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86846693|gb|CI282930.1|CI282930
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88530423|gb|CI458818.1|CI458818
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88254065|gb|CI352691.1|CI352691
genomic: TTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88996140|gb|CI037431.1|CI037431
genomic: TTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|218504730|gb|FG949645.1|FG949645
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88532568|gb|CI462062.1|CI462062
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|29619508|gb|CB624520.1|CB624520
genomic: CTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86509286|gb|CI151919.1|CI151919
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCTACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|33661335|gb|CF292302.1|CF292302
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATCTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTACATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|89170236|gb|CI039513.1|CI039513
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|87030298|gb|CI252575.1|CI252575
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86510211|gb|CI152844.1|CI152844
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGCGGAGCCEST: gi|88665600|gb|CI715756.1|CI715756
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGNCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGEST: gi|88349310|gb|CI678287.1|CI678287
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGG
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGEST: gi|89170677|gb|CI039954.1|CI039954
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATG
EST: TGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86509514|gb|CI152147.1|CI152147
genomic: TGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86859772|gb|CI345426.1|CI345426
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|218478507|gb|FG954789.1|FG954789
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86834911|gb|CI345995.1|CI345995
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|58588665|gb|CF986973.1|CF986973
genomic: CACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86833840|gb|CI338211.1|CI338211
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|1632399|gb|C20128.1|C20128
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: NACAAGGCACCTACAAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTTGATGGGAGCATATGEST: gi|88220335|gb|CI219895.1|CI219895
genomic: AACAAGCCACCTACA-GTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCT-GATGGGAGCATATG
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|33813642|gb|CF332708.1|CF332708
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86260384|gb|CI066257.1|CI066257
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|86415688|gb|CI029699.1|CI029699
genomic: CAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|8858097|gb|AU095415.1|AU095415
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|29619931|gb|CB624943.1|CB624943
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|3767210|gb|AU031320.1|AU031320
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|88254945|gb|CI353769.1|CI353769
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: CTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCEST: gi|8527972|gb|AU092787.1|AU092787
genomic: CTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTACGTTCAAGCTGACACTTCAGTTTACTGAAGATTATCCTAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctctctccctgctgtttaatacttgcctgtggcatggttcctgtttcttacaagttataagtatttatgtggcatttcggaacaatagtctaac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ctctccc