Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta...

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os08g44380.2
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G369991_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagac-tttacaggtt--acattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta--
||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |  ||||  |      |    |||  |    ||||   |||  ||||  ||| |||| |   ||      |||||   || || | | || |||  
ACAAAAGGACAAGAGTTTCAGTGGCTCTGTTAAGTTGCCTCGCATCCCTCGTCCAAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtaa-acaggcagttgatgatgcacttgaaaatgtacttatttagttgttgaacatgcttgcagtagtaaatctgcaaaaacac---taatgcttc-gagttact

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G170561_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagac-tttacaggtt--acattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta---
||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |  ||||  |      |    |||  |    |||| | |||  ||||  ||| ||||     | ||| || | |     | || | | || |||   
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGCTCTATGAAGTTGCCTCACATCCCTCATCCAAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtaa-acaggcagttgatgatgcacttgaaaatgtacttatttatatgttgaacatgcttgcagtag----taaatctgcaaaacaccaatgcttc-gagttactc

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM5G862017_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 9
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccat-tttgtttaattcagac-tttacaggtt--acattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta-
||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||| | | |  ||||  |      |||   |||  |    |||| | |||  ||||  ||| |||| |   ||      |||||   || || | | || ||| 
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGCTCTATTAAGTTGCCTCACATCCCTCGTCCAAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAACACGTTGAGGAGgtaa-acaggcagttgatgatgcacttgaaaaatgtacttatttatatgttgaacatgcttgcagtagtaaatctgcaaaaacac---taatgcttc-gagttac

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G144387_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta---
||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  || |  | | |   ||    |        |||  | |||  |  ||  || |  ||  | || |  || |     ||||||  |||||||   
ACAGAAGGACAAGCGTTTCAGTGGCTCTGTTAAGTTGCCCCATATCCCTCGTCCCAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTTGAGGAGgtaagcaagcat-tgatggtctgcttcaacatgcacttttttgtatgttgaac-atgctaatggttgttgaactgaaaaaacaccagtgtt-ttgaattattc

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G074769_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagac-tttacaggtt--acattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta--
||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||  |      |    |||  |    ||||   |||  ||||  ||| |||| |   ||      |||||   || || | | || |||  
ACAAAAGGACAAGAGTTTCAGTGGCTCTGTTAAGTTGCCTCGCATCCCTCGTCCAAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtaa-ataggcagttgatgatgcacttgaaaatgtacttatttagttgttgaacatgcttgcagtagtaaatctgcaaaaacac---taatgcttc-gagttact

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G181194_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 3
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagac-tttacaggtt--acattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |  ||||  |      |    |||  |    |||| | |||  ||||  ||| |||| |   ||      |||||   |  |   | | | |  
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGCTCTGTTAAGTTGCCTCACATCCCTCGTCCAAAGATGAAGGTGTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtaa-acaggcagttgatgatgcacttgaaaatgtacttatttatatgttgaacatgcttgcagtagtaaatctgcaaaaacaccaatgcttcgagttact--

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S40_297V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg-atgttgtagccattttg--tttaattcagactttacaggttacattattgtagt-attttctcaatt-tgaacacatgtagtgttactgaatta
 || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  | |  ||| |   |||||    || ||      || |    ||| |||||  |  | | | ||||| || | |||  | ||    |     |||  
CCAGAAAGACAAACGTTTCAGCGGCTCTGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcgcacattggaataatttttgccttcatatttgtttcattt-ttagattatcttgattaatgtctcatttcttaaccaacgtt-catctgacaatag

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S427_1V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagata-----tgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacat----tattgtagtattttctcaatttgaacacatgt----agtgttactgaatta--------------------------------------------------------------------------------
 || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||| | | || |||||||| |||||||| ||| | || |||||| | |        |  ||  |  | || | |||  |   |     | |  ||  ||     ||||||| |||||||    | |  | ||| |     |  ||  |  ||||                                                                                
CCAGAAAGACAAGCGTTTCAGTGGCTCCGTGAAGCTTCCCCACATTCCTCGTCCTAAGATGAGGATTTGTATGCTTGGAGATGCCCAACATATTGAAGAGgtatgcttattctcaaattttgattctttctatttgttgatggtgccagaaattgaataaaacattgtagaattttctgctctgggtctcatctcactggcctttgtatattaaaactagaaattatcaccctttacttgataatggataattgctgatgtcgtgagtttcttttggtcgtaactcgtcacag

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S18_121V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgta--------agatatgatgttgt-agccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta---
 || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||        |  |    |  ||  | |||| |||   |        |   || |  ||||||  | ||  |  |  |   ||    |   |     ||| ||  | |   
CCAGAAAGACAAGCGTTTCAGTGGTTCCGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGCCCTAAGATGCGCGTGTGCATGCTCGGAGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtatttcctctaactcaactaatgccacccatgttgagaagcattttgtcagcatgccacattac-gcaggttgattacctcttatttattcgccccattattgcgtaacag

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: EFJ31249 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta
 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  | || ||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||         |   |    | | |  || ||  ||  | | ||  || | ||    |||   |   |||| |||                    
GCAGAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCGGTGAAGCTGCCTCACATTGCGCGGCCCAAGATGAGAGTGTGCATGCTCGGTGATGCGCAGCATGTAGGCGAGgtaagat---------tgagcgccctctctcctttag--ttgccggattgaatcactggtccattgcttt--tttgcacag-------------------

upper sequence: LOC_Os08g44380.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: EFJ34353 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 2
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta
 || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||     |   |  |   |||  ||    | |  || |     |      |||   | ||| | ||                             
GCAGAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCGGTGAAGCTGCCTCACATTGCCCGGCCCAAGATGAGAGTGTGCATGCTCGGTGATGCGCAGCATGTAGGGGAGgtaagattgagcgccctgtctccttttgttg---ccggattgaatcactggtccgttgctttttttgcacag----------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|33682767|gb|CF311006.1|CF311006
EST:     GCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88674638|gb|CI728751.1|CI728751
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33665236|gb|CF296203.1|CF296203
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88728373|gb|CI751883.1|CI751883
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88317436|gb|CI628085.1|CI628085
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88673267|gb|CI726042.1|CI726042
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88340789|gb|CI636949.1|CI636949
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33823164|gb|CF337382.1|CF337382
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33694097|gb|CF322336.1|CF322336
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88666143|gb|CI716299.1|CI716299
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88696082|gb|CI739657.1|CI739657
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|55439434|gb|CV733025.1|CV733025
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88317464|gb|CI628113.1|CI628113
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|87008403|gb|CI301161.1|CI301161
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|55433273|gb|CV729688.1|CV729688
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88689065|gb|CI732641.1|CI732641
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|55433210|gb|CV729649.1|CV729649
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88675717|gb|CI729830.1|CI729830
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88972348|gb|CI717089.1|CI717089
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGC
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGC
EST: gi|88665925|gb|CI716081.1|CI716081
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88905697|gb|CI712996.1|CI712996
EST:     CCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCCAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: CCCC-AAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88317423|gb|CI628072.1|CI628072
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88674146|gb|CI728259.1|CI728259
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88984008|gb|CI723572.1|CI723572
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAACAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33655758|gb|CF278372.1|CF278372
EST:     GCCCCAAGATGGAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33671594|gb|CF299833.1|CF299833
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACT-CATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33822843|gb|CF337227.1|CF337227
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88688101|gb|CI731677.1|CI731677
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|55828000|gb|AU065281.2|AU065281
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88744159|gb|CI767519.1|CI767519
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88905208|gb|CI712507.1|CI712507
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33659833|gb|CF282446.1|CF282446
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|24208887|gb|AU225914.1|AU225914
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33657180|gb|CF279794.1|CF279794
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88905412|gb|CI712711.1|CI712711
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|58675234|gb|CK063921.1|CK063921
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88665907|gb|CI716063.1|CI716063
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|87042110|gb|CI194734.1|CI194734
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88671176|gb|CI725292.1|CI725292
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88973547|gb|CI717975.1|CI717975
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAA
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAA
EST: gi|87017186|gb|CI301222.1|CI301222
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGA
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGA
EST: gi|89173151|gb|CI720981.1|CI720981
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|2442273|gb|C74044.1|C74044
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCC-TTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88665819|gb|CI715975.1|CI715975
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88671907|gb|CI725849.1|CI725849
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88665908|gb|CI716064.1|CI716064
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88728051|gb|CI751561.1|CI751561
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGACAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|218489369|gb|FG950492.1|FG950492
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88672772|gb|CI726888.1|CI726888
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAACATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88672355|gb|CI726471.1|CI726471
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88719546|gb|CI743056.1|CI743056
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|86859602|gb|CI288904.1|CI288904
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33655135|gb|CF277749.1|CF277749
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88677289|gb|CI729947.1|CI729947
EST:     GNCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88673419|gb|CI727532.1|CI727532
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88593873|gb|CI713827.1|CI713827
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTNGAGGCCCTTA
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTA
EST: gi|88674563|gb|CI728676.1|CI728676
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88905333|gb|CI712632.1|CI712632
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33662471|gb|CF293438.1|CF293438
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88675347|gb|CI727462.1|CI727462
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|89172409|gb|CI721468.1|CI721468
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88669467|gb|CI723385.1|CI723385
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88594804|gb|CI714762.1|CI714762
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAG
EST: gi|88675245|gb|CI727360.1|CI727360
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|55437784|gb|CV732184.1|CV732184
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88671066|gb|CI725182.1|CI725182
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88983956|gb|CI723524.1|CI723524
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88674720|gb|CI728833.1|CI728833
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|33664770|gb|CF295737.1|CF295737
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88688713|gb|CI732289.1|CI732289
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAG
EST: gi|86595674|gb|CI288367.1|CI288367
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGACAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGAT
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGAT
EST: gi|218488573|gb|FG946164.1|FG946164
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88676485|gb|CI730598.1|CI730598
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88688384|gb|CI731960.1|CI731960
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGT
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGT
EST: gi|38478543|gb|CF962676.1|CF962676
EST:     GCCCCAAGATTAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGTCTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88673331|gb|CI725956.1|CI725956
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88675243|gb|CI727358.1|CI727358
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88308934|gb|CI654217.1|CI654217
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88317397|gb|CI628046.1|CI628046
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88347630|gb|CI634315.1|CI634315
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATG
EST: gi|88691648|gb|CI733726.1|CI733726
EST:     GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAG                         GCTGAGAAGATTGGGCTCGAC
genomic: GCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGAC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 135

ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatg ... atttaaacagGCTGAGAAGATTGGGCTCGACTACATGGATGTTGAGGCCCTTAAGAAGATGAACAAGAACAAGAAGCTTGTGAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTT




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGCTCCGTTAAGCTGCCCCATATCCCCCGCCCCAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTCGAGGAGgtaagatatgatgttgtagccattttgtttaattcagactttacaggttacattattgtagtattttctcaatttgaacacatgtagtgttactgaatta

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG