1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AAGGCGGCCAACATCAAGGTCGAGGCCTACTGGCCCGGTCTCTTCGCCAAGCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTGgtaaaacctcccggccccttgtcccctgcctccttgctatgccactgcgtgattgtcgatgtagatttgattgaacctagtttatctcatgagggaaatt...
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g02340.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTG GTGGTGGTGCTGCTCEST: gi|87004734|gb|CI306818.1|CI306818
genomic: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTGgtaaaacctc ... atggttgtagGTGGTGGTGCTGCTC
EST: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTG GTGGTGGTGCTGCTCCAEST: gi|87012559|gb|CI307307.1|CI307307
genomic: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTGgtaaaacctc ... atggttgtagGTGGTGGTGCTGCTCCA
EST: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTG GTGGTGGTGCTGCTCCAGTT
genomic: GCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTGgtaaaacctc ... atggttgtagGTGGTGGTGCTGCTCCAGTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AAGGCGGCCAACATCAAGGTCGAGGCCTACTGGCCCGGTCTCTTCGCCAAGCTCCTCGAGCACCGCAGCGTCGATGACCTCATCCTCTCCGTCGGATCTGgtaaaacctcccggccccttgtcccctgcctccttgctatgccactgcgtgattgtcgatgtagatttgattgaacctagtttatctcatgagggaaatt
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