Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca...

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g21660.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G023748_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtattt-agca-
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |   || | |   ||  ||  |||||   | | || |     | |||         | |   | | |  |    || || | |||  
TCAAAAGGACAAGCGCTTCAGCGGTTCTGTTAAGCTGCCTCACATCCCTCGCCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCATGTTGAGGAGgtatgttatgcttccatc-atctcgtcctgtgttttttttggcgt-aaatttacttggtactcaggaattcaattatttgctcttgtagcgaatatgagctt

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT5G22440.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca
||||||||| ||| | || || |||||||| ||  |||| ||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |   || | |   ||||   ||||    ||| ||||  |   |  | ||   | |  |||  |    || | |||  ||||  |         
TCAAAAGGACAAGAGATTTAGCGGTTCTGTGAAATTGCCTCACGTTCCTAGGCCAAAGATGAAGATTTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTCGAAGAGgt---tcacttttttccgccttttcttttgaaaatgttatgattagtacttagtagtatagtactataacttgcggttggtt--tacttag---------

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT2G27530.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcat---tgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca
 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||  ||||| | || |||||||| ||||||||||| || || |||||   | |    ||||    |||||  |   |   |||||||  ||  | |||    | | |   |||   |   |||  | | ||                 
ACAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGATCTGTGAAGCTCCCACATATTCCTCGCCCAAAAATGAAGATCTGTATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGgtgattgaaatctctatactttttgtgtatcttgtttggtttgaattggtgattgacacaaagtgtttgatgt--ttgttttgatag----------------

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT1G08360.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaactt--ttatcgcaattgggtagttactactacgt--atttagca
||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| || |||||  ||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    |||  ||  |  ||  ||| ||    |||   |   | |    | |   |      |  | ||  || |||| | | | ||| ||  |  ||||    
TCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGTTACCACATATCCCCCGTCCTAAAATGAAGATCTGCATGCTCGGAGATGCCCAGCATGTTGAAGAGgtgatatatcttttcatggaaattg-atcattttgtgctctgtttcttgtataatggttttgtgctcatttcatttgg-tggct-ctattagtttcatttgat-

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S40_297V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgt-atgtt---atgcttctactgattttgcattgac-ttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca----
 || || || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   |   |   |    |||||| || |  || ||||   | | ||||         | |  | || || ||      | || |      || |  ||    
CCAGAAAGACAAACGTTTCAGCGGCTCTGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGTCCTAAGATGAGAGTGTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTCGAGGAGgtcatattcgcacattggaataatttttgccttcatatttgtttcatttttagatt--atcttgattaatgtctcatttct----taaccaacgttcatctgacaatag

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S427_1V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatg-ttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgg-gtagttactactacgtatttagca-------------------------------------------------------------------------------------------
 || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |||| |||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| |||| ||   | |    ||   |  | ||| |  || |   |||  | ||   ||   || | | | ||   |   |   |   |  |   | ||                                                                                            
CCAGAAAGACAAGCGTTTCAGTGGCTCCGTGAAGCTTCCCCACATTCCTCGTCCTAAGATGAGGATTTGTATGCTTGGAGATGCCCAACATATTGAAGAGgtatgcttattctcaaattttgattctttctatttgttgatggtgccagaaattgaataaaacattgtagaattttctgctctgggtctcatctcactggcctttgtatattaaaactagaaattatcaccctttacttgataatggataattgctgatgtcgtgagtttcttttggtcgtaactcgtcacag

upper sequence: LOC_Os02g21660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S18_121V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca----------------
 || || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||   || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| |    ||   ||| |  |        |   |||  ||       |||    |   |   |  ||||  | | |     ||  ||  ||||   |                 
CCAGAAAGACAAGCGTTTCAGTGGTTCCGTGAAGCTGCCACACATTCCTCGCCCTAAGATGCGCGTGTGCATGCTCGGAGATGCCCAGCACGTTGAGGAGgtatttc---ctctaactcaactaatgccacccatgttgagaagcattttgtcagcatgccacattacgcaggttgattac--ctcttatttattcgccccattattgcgtaacag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88362434|gb|CI623774.1|CI623774
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|5443701|gb|AU064378.2|AU064378
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGGAAAA
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAG-AAAA
EST: gi|88383845|gb|CI631735.1|CI631735
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88333144|gb|CI640987.1|CI640987
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88692249|gb|CI735824.1|CI735824
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88327185|gb|CI652225.1|CI652225
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88766064|gb|CI775154.1|CI775154
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88340060|gb|CI650507.1|CI650507
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88689122|gb|CI732698.1|CI732698
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88336001|gb|CI645602.1|CI645602
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|58587586|gb|CF985894.1|CF985894
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88572661|gb|CI664232.1|CI664232
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|9886123|gb|AU063055.2|AU063055
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|218490099|gb|FG946556.1|FG946556
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88305508|gb|CI630670.1|CI630670
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCANGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88576427|gb|CI670572.1|CI670572
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88368746|gb|CI646234.1|CI646234
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88692617|gb|CI736192.1|CI736192
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTCGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88425319|gb|CI564836.1|CI564836
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88356767|gb|CI619253.1|CI619253
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88719033|gb|CI742543.1|CI742543
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88692734|gb|CI736309.1|CI736309
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|25806934|gb|CA762895.1|CA762895
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88723286|gb|CI746796.1|CI746796
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAACAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|38482495|gb|CF966529.1|CF966529
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|218498145|gb|FG965353.1|FG965353
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88735618|gb|CI759126.1|CI759126
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88718306|gb|CI741395.1|CI741395
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88353931|gb|CI636129.1|CI636129
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88825647|gb|CI776212.1|CI776212
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|27554341|gb|CA998241.1|CA998241
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|33680145|gb|CF308384.1|CF308384
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88388738|gb|CI683525.1|CI683525
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|33686983|gb|CF315222.1|CF315222
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCCCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88721641|gb|CI744940.1|CI744940
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88571440|gb|CI662813.1|CI662813
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88335611|gb|CI642835.1|CI642835
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88463451|gb|CI695914.1|CI695914
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|2311619|gb|C27774.1|C27774
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAAAT
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAA-T
EST: gi|88395565|gb|CI613087.1|CI613087
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88393259|gb|CI616743.1|CI616743
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|218486730|gb|FG954848.1|FG954848
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|84117452|gb|CD151219.1|CD151219
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88511613|gb|CI439119.1|CI439119
EST:     GGCGTAAGTTGAAGGTTTGCATGGTTGTTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|8527829|gb|AU092644.1|AU092644
EST:     AAGGTTTGCATGCTTGGTNATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         CCAGAGAAAATGGGCNTAGACTATATGNATGTGNAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: AAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|33679805|gb|CF308044.1|CF308044
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAGGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|58598949|gb|CK009477.1|CK009477
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88330376|gb|CI633583.1|CI633583
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88321995|gb|CI673145.1|CI673145
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88744419|gb|CI767779.1|CI767779
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88390251|gb|CI605704.1|CI605704
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88353959|gb|CI636157.1|CI636157
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88306485|gb|CI638275.1|CI638275
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88305476|gb|CI630638.1|CI630638
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88732191|gb|CI757039.1|CI757039
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAG
EST: gi|88385240|gb|CI630341.1|CI630341
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88337662|gb|CI632164.1|CI632164
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|27334454|gb|CA882905.1|CA882905
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|58595647|gb|CK006175.1|CK006175
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88327563|gb|CI646756.1|CI646756
EST:     GCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAAT
genomic: GCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGT-CGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAAT
EST: gi|33681949|gb|CF310188.1|CF310188
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACT-TATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88736704|gb|CI760212.1|CI760212
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88347793|gb|CI655146.1|CI655146
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88328199|gb|CI650010.1|CI650010
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|8527787|gb|AU092602.1|AU092602
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88357511|gb|CI623565.1|CI623565
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88694638|gb|CI738676.1|CI738676
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAA
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAA
EST: gi|2275879|gb|C24856.1|C24856
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCC-TCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88725299|gb|CI748558.1|CI748558
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88338746|gb|CI660517.1|CI660517
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88721140|gb|CI744439.1|CI744439
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88395102|gb|CI609418.1|CI609418
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88742554|gb|CI766062.1|CI766062
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88581619|gb|CI698819.1|CI698819
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88416052|gb|CI594164.1|CI594164
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|218480694|gb|FG957034.1|FG957034
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88348830|gb|CI631917.1|CI631917
EST:     GGCCTACGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88347625|gb|CI634310.1|CI634310
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88724651|gb|CI747910.1|CI747910
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88307973|gb|CI646408.1|CI646408
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAAT
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCC-TAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAAT
EST: gi|88344584|gb|CI637193.1|CI637193
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88346861|gb|CI628531.1|CI628531
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88347133|gb|CI631213.1|CI631213
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCCCGTCCAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|88442788|gb|CI693794.1|CI693794
EST:     GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|8335305|gb|BE040289.1|BE040289
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
EST: gi|218478412|gb|FG955762.1|FG955762
EST:     GGCCTAAGATGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAG                         GCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG
genomic: GGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 70 (downstream exon)
Score: 146

TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatg ... gggtctgcagGCAGAGAAAATGGGCCTAGACTATATGGATGTGGAAGCCCTCAAGAAAATGAACAAAAACAAGAAGCTAGTTAAGAAGCTTGCAAAGAAATATCATGCTT




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TCAAAAGGATAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTTAAGCTGCCCCACATCCCTCGGCCTAAGTTGAAGGTTTGCATGCTTGGTGATGCTCAGCACGTCGAAGAGgtatgttatgcttctactgattttgcattgacttggttttgatatgagatgtggagagaacttttatcgcaattgggtagttactactacgtatttagca

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CGAAGA