Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCCGTCCGAAGGGTGTCACCCCCAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g07260.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g07260.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G382914_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
GGCCGTCCGAAGGGTGTCACCCCCAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatag
|| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |     ||| |   | | |   ||| |   || |||  || |  ||  | | ||  ||  |||               ||||||||||||||
GGTCGTCCAAAAGGTGTCACCCCAAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTCCTTGGAGTTGAAgtatgctaagatttgacattagcttatt-ttagtacctgctatctttcagttattcta-agtgctaatat---------------gtgtgcataaatag

upper sequence: LOC_Os02g07260.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv19s0085g00370.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
GGCCGTCCGAAGGGTGTCACCCCCAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgcc-attggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaa-tag
|| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| || |||||||| || || ||   |||   | |||  | |      ||  | ||      || |      | ||  |        | |    |||  | ||||| ||| |  | |||
GGGCGCCCAAAGGGTGTTACACCTAAGTACAGCTTGAAACCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTGAACTTCTTGGAGTTGAGgtttgtttattccctaatatttctgttgttttgttattcaaacctgatttggctggcatgaatgtactcacttggatgacttttttgtttgcctttactag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|55415451|gb|CV727827.1|CV727827
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|568023|gb|D38858.1|D38858
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTG-ATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58675077|gb|CK063764.1|CK063764
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33678660|gb|CF306899.1|CF306899
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|5607383|gb|AU076055.1|AU076055
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAAGGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33685914|gb|CF314153.1|CF314153
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GAANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA--GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|88404579|gb|CI581015.1|CI581015
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33794558|gb|CF323166.1|CF323166
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGNAGGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGG-AAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|2428603|gb|C73066.1|C73066
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATGGGTGATGAAGTNGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2312269|gb|C28424.1|C28424
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATT-CATTGGTGAGGAAGTTGAGAA-TTGGNTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58605824|gb|CK033857.1|CK033857
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|55828140|gb|AU062401.3|AU062401
EST:     ACAGCTTNAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTNGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTTGTGAGGAANTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88313299|gb|CI594929.1|CI594929
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
EST: gi|33683766|gb|CF312005.1|CF312005
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86847457|gb|CI287027.1|CI287027
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTG
EST: gi|33681699|gb|CF309938.1|CF309938
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33653529|gb|CF276143.1|CF276143
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88576813|gb|CI673339.1|CI673339
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33810824|gb|CF331303.1|CF331303
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|13806339|gb|AU181481.1|AU181481
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33794797|gb|CF323278.1|CF323278
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|4879073|gb|AU063372.1|AU063372
EST:     ACAGNTTGAAGCCTCTTGTTCCACGNTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTTGGTGAGG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATT-GGTGAGG
EST: gi|33807223|gb|CF329492.1|CF329492
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|29676664|gb|CB672939.1|CB672939
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691128|gb|CF319367.1|CF319367
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|300216018|gb|HO088644.1|HO088644
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|163918048|gb|EG713148.1|EG713148
EST:     GAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: GAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33688397|gb|CF316636.1|CF316636
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33797454|gb|CF324587.1|CF324587
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33685001|gb|CF313240.1|CF313240
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891986|gb|CI310119.1|CI310119
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86883915|gb|CI309172.1|CI309172
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891927|gb|CI310089.1|CI310089
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2310338|gb|C26493.1|C26493
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTNTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTNATGGCCAATNATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891797|gb|CI310024.1|CI310024
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88433298|gb|CI591738.1|CI591738
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGACAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
EST: gi|33691112|gb|CF319351.1|CF319351
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33793275|gb|CF322518.1|CF322518
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|33692725|gb|CF320964.1|CF320964
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88360362|gb|CI612081.1|CI612081
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88412240|gb|CI573516.1|CI573516
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33694068|gb|CF322307.1|CF322307
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG
EST: gi|88406489|gb|CI598982.1|CI598982
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGGCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2428357|gb|C72820.1|C72820
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-TGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|14713602|gb|AU197588.1|AU197588
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58667980|gb|CK056666.1|CK056666
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691537|gb|CF319776.1|CF319776
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGNANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-A-GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33688698|gb|CF316937.1|CF316937
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|29656155|gb|CB652430.1|CB652430
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33679657|gb|CF307896.1|CF307896
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGANGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA-GGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|29656603|gb|CB652878.1|CB652878
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|14574908|gb|AU197198.1|AU197198
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33692729|gb|CF320968.1|CF320968
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|13904803|gb|BF889441.1|BF889441
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33690563|gb|CF318802.1|CF318802
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691338|gb|CF319577.1|CF319577
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88390235|gb|CI605688.1|CI605688
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33679751|gb|CF307990.1|CF307990
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGGGAGGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGG-AAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|86821952|gb|CI309337.1|CI309337
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|163917828|gb|EG713114.1|EG713114
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88430272|gb|CI567291.1|CI567291
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGC-TTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG-TGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|32947941|gb|BP184513.1|BP184513
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33656001|gb|CF278615.1|CF278615
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33686118|gb|CF314357.1|CF314357
EST:     CAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTAGTAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GNAGGGAAGTTGAGAAATTGGCT
genomic: CAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGG-AGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGG-AAGTTGAGAAATTGGCT
EST: gi|33688855|gb|CF317094.1|CF317094
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88404607|gb|CI581043.1|CI581043
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33654156|gb|CF276770.1|CF276770
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTCGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GAANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA--GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|4879092|gb|AU063391.1|AU063391
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTNGAGTCGAT                         GTTGTGATGGC-AATGATT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATT
EST: gi|29614437|gb|CB619450.1|CB619450
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33804383|gb|CF328066.1|CF328066
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|27554028|gb|CA997928.1|CA997928
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88313311|gb|CI594941.1|CI594941
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG
EST: gi|88370659|gb|CI590237.1|CI590237
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGACAAATTGGCTGTT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33808854|gb|CF330312.1|CF330312
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|4878615|gb|AU062914.1|AU062914
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTNATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88357534|gb|CI623588.1|CI623588
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAG
EST: gi|117247218|gb|CT848558.1|CT848558
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|3090437|gb|C93426.1|C93426
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGNTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTTATGGCCAATGATTGCATTNGTGAGGAAGTTGAGAAATT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATT
EST: gi|33688760|gb|CF316999.1|CF316999
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 251

GGCCGTCCGAAGGGTGTCACCCCCAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GGCCGTCCGAAGGGTGTCACCCCCAAGTACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatag

- - - - - - - - - - - - - - - -  TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TTGGAG