Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgttgttgagttttgattcatttgggaactataggttggatcactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g60190.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g60190.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM5G833389_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagct-gttgttgagttttgattcatttgggaactataggttggatcactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag-------------
||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| | | | |||| | ||||| || || |||| ||| || | |||| ||| | |||||| | | | | |
AGGCTCATGGAACAGCTGTGGGCCTCCCATCTGATGATGACATGGGCAACAGTGAAGTTGGTCACAATGCACTTGGTGCTGGTCGAATTTTCGCCCAAGGgtatgttagatgttta-ttttgttt---tttggaaatatgttttctgttgtaaca-atgtgatgtactgatgtggtttcaatattgcatttgaacatgatgccca

upper sequence: LOC_Os01g60190.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G003385_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 3
AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgttgttgagttttgattcatttgggaactataggttggatcactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag--------------
||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| | | || ||| || ||| |||| ||| || | ||| |||| | || |||| || |
AGGCTCATGGAACAGCTGTGGGTCTCCCATCTGATGATGACATGGGCAACAGTGAAGTTGGTCACAATGCACTTGGTGCTGGTCGGATTTTCGCCCAAGGgtatgtta-----gatatttagttatttttggaaatatgttttctgttgtaactaatgcgctgtggtttcaatattgcatttgaacatcaatgtcgaaagctata

upper sequence: LOC_Os01g60190.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA18G45120.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgttgttgag------ttttgattcatttgggaactataggttggatcactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag-----
||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| || |||||| | | | | ||| | || || | | ||| | |||
GGGCTCATGGTACTGCTGTAGGACTTCCAACAGAAGATGACATGGGCAATAGTGAAGTTGGTCACAATGCCCTTGGGGCTGGTCGCATATTTGCTCAGGGgtaaactaaaactagcctctctttttcatctatttggc--cccctgtgtatgttactacctaggtattaaattggggtcgcagggccgtcaatttagtgata

upper sequence: LOC_Os01g60190.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA09G40690.1 (Glycine max), 5'ss of exon 2
AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgttgttgag------ttttgattcatttgggaactataggttggatcactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag-----
||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| || |||||| | || | || | ||| | ||||| | | | | || | |||
GGGCTCATGGTACCGCTGTAGGCCTTCCAACAGAAGATGACATGGGTAATAGTGAAGTTGGTCACAATGCTCTTGGGGCTGGTCGCATATTTGCTCAGGGgtaaactaaaactagcctctctttttcatctatttggcc-ccat-gcttatgttactaccaaggttttaaattgtggtcgcatggctgtcgatttagggata

upper sequence: LOC_Os01g60190.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: Vv08s0056g00200.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 2
AGGCTCATGGAACAGCTGTTGGTCTTCCTAGCGAAGATGACATGGGCAACAGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgttgttg--agttttgattcatttgggaa-----------ctataggttggat-cactctgcatgttttgtgacaagcgtgtttcattctcactgtag
|||||||||| | || || || ||||| | || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| | | | || |||| ||| ||| ||| |||| | || ||| | | |||| | ||||| || ||| || |
AGGCTCATGGGAGTGCAGTAGGGCTTCCAACTGAGGATGACATGGGCAACAGTGAAGTTGGCCATAATGCTCTTGGTGCTGGACGCATATATGCTCAAGGgtgaatttctcttcctgattttatttcttttatgaaatttttacatattataacctttatacacccaggatgtcccttcacaagtttgattcctttttga-----

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|2312538|gb|C28693.1|C28693
EST:     GCGAAGTGGNGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAA
genomic: GCGAAGTGG-GTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGG-ACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAA
EST: gi|88372782|gb|CI612710.1|CI612710
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|84117573|gb|CD151340.1|CD151340
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88317421|gb|CI628070.1|CI628070
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCC
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCC
EST: gi|25800076|gb|CA756037.1|CA756037
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTNAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58670062|gb|CK058748.1|CK058748
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58694638|gb|CK083325.1|CK083325
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58687704|gb|CK076391.1|CK076391
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88427231|gb|CI586779.1|CI586779
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGGCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58610007|gb|CK038040.1|CK038040
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58672052|gb|CK060738.1|CK060738
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|29616024|gb|CB621036.1|CB621036
EST:     GGTCACAATGCTCCTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: GGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58691250|gb|CK079937.1|CK079937
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|29614142|gb|CB619155.1|CB619155
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88364256|gb|CI612205.1|CI612205
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58605105|gb|CK033138.1|CK033138
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88311902|gb|CI577508.1|CI577508
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATG
EST: gi|29633640|gb|CB638649.1|CB638649
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88722323|gb|CI745833.1|CI745833
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTG
EST: gi|88407542|gb|CI586383.1|CI586383
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88401995|gb|CI593707.1|CI593707
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTT
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTT
EST: gi|29687802|gb|CB684077.1|CB684077
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88407648|gb|CI607782.1|CI607782
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|33675454|gb|CF303693.1|CF303693
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|29636841|gb|CB641850.1|CB641850
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88395551|gb|CI613073.1|CI613073
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGC
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGC
EST: gi|88367105|gb|CI563869.1|CI563869
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCGTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88434349|gb|CI589414.1|CI589414
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTT
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTT
EST: gi|88427224|gb|CI586772.1|CI586772
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
EST: gi|29634606|gb|CB639615.1|CB639615
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58667889|gb|CK056575.1|CK056575
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88317395|gb|CI628044.1|CI628044
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCC
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCC
EST: gi|88407499|gb|CI586340.1|CI586340
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88362002|gb|CI607002.1|CI607002
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88720640|gb|CI743939.1|CI743939
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGG
EST: gi|88360007|gb|CI608521.1|CI608521
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGG
EST: gi|88299059|gb|CI568062.1|CI568062
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTA
EST: gi|88344838|gb|CI624489.1|CI624489
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         G
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtag-
EST: gi|88344838|gb|CI624489.1|CI624489
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         G
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtag-
EST: gi|87006706|gb|CI285740.1|CI285740
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58677212|gb|CK065899.1|CK065899
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88425592|gb|CI569316.1|CI569316
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGCGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58674042|gb|CK062728.1|CK062728
EST:     GGTCGCATTTTTGCTCAGTGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
genomic: GGTCGCATTTTTGCTCAG-GGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
EST: gi|88365099|gb|CI616518.1|CI616518
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTG
EST: gi|58668452|gb|CK057138.1|CK057138
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88444106|gb|CI594479.1|CI594479
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTT
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTT
EST: gi|88315777|gb|CI617250.1|CI617250
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAA
EST: gi|38473067|gb|CF957199.1|CF957199
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88337040|gb|CI628126.1|CI628126
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTT
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTT
EST: gi|58667774|gb|CK056460.1|CK056460
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88377639|gb|CI605474.1|CI605474
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88364834|gb|CI614452.1|CI614452
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGAT
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGAT
EST: gi|88414777|gb|CI604135.1|CI604135
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGG
EST: gi|58667892|gb|CK056578.1|CK056578
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88403734|gb|CI611389.1|CI611389
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGC-TTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAG
EST: gi|88727473|gb|CI751128.1|CI751128
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88360396|gb|CI612115.1|CI612115
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|3766736|gb|AU030846.1|AU030846
EST:     CGAAGTGGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: CGAAGTGGG-TCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTT-GCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88388221|gb|CI627760.1|CI627760
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGC
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGC
EST: gi|88370351|gb|CI587741.1|CI587741
EST:     AGCGAAGTGGGTAACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88346575|gb|CI623032.1|CI623032
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGG
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGG
EST: gi|58597783|gb|CK008311.1|CK008311
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88394654|gb|CI622528.1|CI622528
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGAC
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGAC
EST: gi|58593381|gb|CF991689.1|CF991689
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|88762402|gb|CI771958.1|CI771958
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
EST: gi|58690635|gb|CK079322.1|CK079322
EST:     AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGG                         TGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA
genomic: AGCGAAGTGGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTCGCATTTTTGCTCAGGGgtaagctgtt ... ctcactgtagTGCTAAGCTTGTGGACCTTGCTCTTGCCTCTGGGAAAATTTATGATGGAGA