Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatcgttctattctaccgtatttgtaatcttagtagcagctaatggatgtttgatttctcatttgcaccactcgttatgctatatgggtttcattatggactttgtgtctctcgcaacatgcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g05330.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88743061|gb|CI766569.1|CI766569
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88728620|gb|CI752130.1|CI752130
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29642250|gb|CB647257.1|CB647257
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88744367|gb|CI767727.1|CI767727
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29666181|gb|CB662456.1|CB662456
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88360157|gb|CI610271.1|CI610271
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88733584|gb|CI756761.1|CI756761
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|33685122|gb|CF313361.1|CF313361
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29642449|gb|CB647456.1|CB647456
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|86894710|gb|CI308357.1|CI308357
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58672128|gb|CK060814.1|CK060814
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|55410405|gb|CV722781.1|CV722781
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88402741|gb|CI613189.1|CI613189
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58607105|gb|CK035138.1|CK035138
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCGCCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|33655674|gb|CF278288.1|CF278288
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|570170|gb|D41019.1|D41019
EST:     GGNTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         T
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcag-
EST: gi|570170|gb|D41019.1|D41019
EST:     GGNTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         T
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcag-
EST: gi|58673254|gb|CK061940.1|CK061940
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29666180|gb|CB662455.1|CB662455
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58693161|gb|CK081848.1|CK081848
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88732327|gb|CI755504.1|CI755504
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58692381|gb|CK081068.1|CK081068
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88738783|gb|CI762291.1|CI762291
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58600294|gb|CK010822.1|CK010822
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58609408|gb|CK037441.1|CK037441
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAGGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58668040|gb|CK056726.1|CK056726
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58685951|gb|CK074638.1|CK074638
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58661671|gb|CK050351.1|CK050351
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|33685610|gb|CF313849.1|CF313849
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|86900744|gb|CI302161.1|CI302161
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88724974|gb|CI748233.1|CI748233
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58689524|gb|CK078211.1|CK078211
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|86884303|gb|CI311706.1|CI311706
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58685755|gb|CK074442.1|CK074442
EST:     GCTCCCAGTTTGATGCGTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GCTCCCAGTTTGATGC-TAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58696214|gb|CK084901.1|CK084901
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|29644972|gb|CB649979.1|CB649979
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58602353|gb|CK012881.1|CK012881
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|33653523|gb|CF276137.1|CF276137
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88395055|gb|CI609371.1|CI609371
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|86888514|gb|CI303796.1|CI303796
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTNAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|58660136|gb|CK048816.1|CK048816
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|86890857|gb|CI305795.1|CI305795
EST:     TTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: TTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
EST: gi|88761507|gb|CI771063.1|CI771063
EST:     GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACT                         GCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA
genomic: GGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGA

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 73 (upstream exon), 69 (downstream exon)
Score: 92

CCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatc ... caacatgcagGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGAGAGTTTTGATGACATGGGCCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTAT




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTgtaagccatcgttctattctaccgtatttgtaatcttagtagcagctaatggatgtttgatttctcatttgcaccactcgttatgctatatgggtttcattatggactttgtgtctctcgcaacatgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG