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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTCACCATTGTAGTGGATTCCACTTCGGAACTGAACTTTTCTAGTTGTTTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacatttgtattcggctgagtcatcacagcattggttctgtttattaccattttctagtcctttgaacaaactgggtatttgctgagctgcagttctatgtattctaacattgtacgcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g02530.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88577301|gb|CI673872.1|CI673872
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88348832|gb|CI631919.1|CI631919
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|29629871|gb|CB634880.1|CB634880
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88726755|gb|CI750410.1|CI750410
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88337571|gb|CI630868.1|CI630868
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88348465|gb|CI629954.1|CI629954
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAA
EST: gi|88403791|gb|CI611446.1|CI611446
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|701074|gb|D47365.1|D47365
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88580575|gb|CI697511.1|CI697511
EST:     TCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAACTTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAA-TTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88727565|gb|CI751220.1|CI751220
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88735041|gb|CI758549.1|CI758549
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGT
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGT
EST: gi|88423516|gb|CI579228.1|CI579228
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88354459|gb|CI624849.1|CI624849
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCT-GCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCGAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88350597|gb|CI631320.1|CI631320
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88429086|gb|CI689966.1|CI689966
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88726787|gb|CI750442.1|CI750442
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCCTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCC
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88327413|gb|CI645199.1|CI645199
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|701106|gb|D47397.1|D47397
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|701499|gb|D47790.1|D47790
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88351626|gb|CI628846.1|CI628846
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGA
EST: gi|88352998|gb|CI630176.1|CI630176
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88337525|gb|CI630822.1|CI630822
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88302084|gb|CI667930.1|CI667930
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88354915|gb|CI615796.1|CI615796
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88742402|gb|CI765910.1|CI765910
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|87012215|gb|CI291670.1|CI291670
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88394586|gb|CI605927.1|CI605927
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|11565217|gb|AU165853.1|AU165853
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCC
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCC
EST: gi|88385325|gb|CI630426.1|CI630426
EST:     TCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCCTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCCAAATGTGAAC
genomic: TCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGC-TGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCC-AAATGTGAAC
EST: gi|88826272|gb|CI776837.1|CI776837
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88358491|gb|CI617577.1|CI617577
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88298801|gb|CI565998.1|CI565998
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCT-GCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCC-TTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88578945|gb|CI687910.1|CI687910
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88364823|gb|CI614441.1|CI614441
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|58660337|gb|CK049017.1|CK049017
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88570289|gb|CI661464.1|CI661464
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88392635|gb|CI625457.1|CI625457
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|58674882|gb|CK063569.1|CK063569
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|2443050|gb|C74821.1|C74821
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88362983|gb|CI614339.1|CI614339
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88358819|gb|CI649368.1|CI649368
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88730490|gb|CI754103.1|CI754103
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|700874|gb|D47165.1|D47165
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88739638|gb|CI763146.1|CI763146
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88577660|gb|CI674258.1|CI674258
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
EST: gi|88379001|gb|CI681829.1|CI681829
EST:     TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAG                         GTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA
genomic: TTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacattt ... ttgtacgcagGTTTGAGCTTGGCACCCCTTGTGGTTAAAGTAGAGCCAAATGTGAACGTCA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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GTTTCACCATTGTAGTGGATTCCACTTCGGAACTGAACTTTTCTAGTTGTTTCCGTGACAATGAAAACTCACGAGAGAGCTGCTAATTTGGCCCTTGCAGgtatacatttgtattcggctgagtcatcacagcattggttctgtttattaccattttctagtcctttgaacaaactgggtatttgctgagctgcagttctatgtattctaacattgtacgcag

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