Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g01560.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S39_422V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 1
----------------------GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattac-cttttaccatag-----
                      ||  ||||| | ||||||||| ||||| | || ||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||  |||| |       ||  | ||   | | ||||  | ||  |  |||| |  ||||||    |  |  |  ||    ||   | |    |  || |     
TGATGTCACACTTCTTTGGCAGGCTCGGGGTCTAAAGAAGCATTTGAAGCGACTGAATGCCCCTAGGCATTGGATGCTCGACAAGTTGGGTGGTGCATTCgtaagttttgcattatg------accaatctcttcgt-cttgttgtttcccacttttctgactgtta---aaatgggtgcatcagaaacctcaccagaattatggttttc

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S39_422V6.3 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttt---tctgt-tacctgatagcttatatttctaattacctt--ttaccatag------------------------------------------------------------------------------------------
||  ||||| | ||||||||| ||||| | || ||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||  |||| |     |    |   |     || ||    ||| |||   | ||    |  ||  | | || | || |      | ||    ||  ||  ||| |                                                                                          
GCTCGGGGTCTAAAGAAGCATTTGAAGCGACTGAATGCCCCTAGGCATTGGATGCTCGACAAGTTGGGTGGTGCATTCgtaagttttgcattatgaccaatctcttcgtcttgttgtttcccacttttctgactgttaaaatgggtgcatcagaaacctcaccagaattatggttttcattggcatgggaattagatgatgtattggtttgaatgtgacacccttcaaagggagaataccgtcaccacattgatccaggaattatatcatgattctag

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S2_16V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattct-tgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag
||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||  |||  |   |||| ||| |||    ||  | | | |||  |     ||| |     || || |  | ||  | |   | |  |     |      
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAGGCACTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTTgtaagttttacatcttgcttttatactcaac-gttcaatcgtcatgctagtacgcatttctctgactatctcagggattcgaatgtcagtctcagcgaatt----

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S39_422V6.2 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattac-cttttaccatag-----
||  ||||| | ||||||||| ||||| | || ||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||  |||| |       ||  | ||   | | ||||  | ||  |  |||| |  ||||||    |  |  |  ||    ||   | |    |  || |     
GCTCGGGGTCTAAAGAAGCATTTGAAGCGACTGAATGCCCCTAGGCATTGGATGCTCGACAAGTTGGGTGGTGCATTCgtaagttttgcattatg------accaatctcttcgt-cttgttgtttcccacttttctgactgtta---aaatgggtgcatcagaaacctcaccagaattatggttttc

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S81_172V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatt-tctaattaccttttaccatag
||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  |     |||     | ||       |  ||||   | | |||| |  |      |  ||  | |  ||     |  |   |||  |||     |  
GCTCGTGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAATTGGGTGGCGCCTTTgtgagttcttttactttgacctgaattggtgtttctggctt--cgttgatctgtaataggaacgc-acagggttcctggagctgcccccttagttttcgaagt--

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S282_25V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttac-ctgatagcttatatttctaatt--accttttaccatag
||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||  |  |||| |    |  | | |     |  |   |||     |  |   || | |||  | | ||| ||| |    ||  ||| |  | ||||| |     
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCGCCTAAGCATTGGATGCTTGACAAGCTGGGTGGCGCCTTCgtgag--taccattttgaactgaattcatacctatgtttgtgagcggaaggtggcttgtatctagtgcactgttagataggcttcttaaatgaaacttttgc-----

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S461_1V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttg--tttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgt--tacctgatagcttatatt-tctaattaccttttaccatag
||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || || ||||  |    ||||  ||  ||| || ||   ||| ||      |||   |  |||| |  ||   |     | |  |  ||   | |  ||||||         
GCTCGTGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtgagttcctagcccttgacttcccacctatctctgcatcctcattttttaaaatccttttataggtggcattctgtggaatgaatcgcccacctacctt---------

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: PP1S38_194V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaa--gcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag
||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||  |||   |    || | ||  ||    ||||| | |    || | |     |  |  ||||  |  | | |||||||| ||      || |     | 
GCTCGCGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttc-tcacgttgaccta-atttcgctg---atgctagtactatttgtgtcgacgtcgtgagttaggttgtgg-ttatatttttacccgaattctcttcgac

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: EFJ26570 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattc------ttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag
|   | ||   ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || || || || |||||| | || | |      || ||  ||  ||  | |    |||    ||    | ||  |||| | |                                        
GTGCGCGGGCCGAAGAAGCATCTGAAGGTGCTCAATGCCCCCAAGCATTGGATGCTGAGCAAGCTCGGCGGTGCCTTCgtaagtctctcttcccctttgtttttcccaggtagatccgtgcgctcacggc--ggccttgcttttccag----------------------------------------

upper sequence: LOC_Os02g01560.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
lower sequence: EFJ14824 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 2
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagt--ttgtcattcttgtttacact---taactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag
|   | ||   |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || || || |||||||||   |||    |||  ||   |    ||  | |    |||    ||    | ||  |||| | |                                        
GTGCGCGGGCCGAAGAAGCATCTCAAGGTGCTCAATGCCCCCAAGCATTGGATGCTGAGCAAGCTCGGCGGTGCCTTTgtaagtatctgttcccctttgttgtcccaggtagatccgtgcgctcacggc--ggccttgcttttccag----------------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|33678801|gb|CF307040.1|CF307040
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58598713|gb|CK009241.1|CK009241
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|29657966|gb|CB654241.1|CB654241
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58675592|gb|CK064279.1|CK064279
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58658121|gb|CK046801.1|CK046801
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|38482204|gb|CF966256.1|CF966256
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAANGTCCA-GGAGTGCCTGCCTCT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAA-GTCCAGGGAGTGCCTGCCTCT
EST: gi|58681135|gb|CK069822.1|CK069822
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218483585|gb|FG966690.1|FG966690
EST:     TCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: TCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|55411008|gb|CV723384.1|CV723384
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218495459|gb|FG950146.1|FG950146
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218490691|gb|FG945219.1|FG945219
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58696229|gb|CK084916.1|CK084916
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58683951|gb|CK072638.1|CK072638
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218491795|gb|FG966978.1|FG966978
EST:     CGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: CGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58678695|gb|CK067382.1|CK067382
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGGCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218497795|gb|FG950008.1|FG950008
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218479608|gb|FG966063.1|FG966063
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAAGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58677186|gb|CK065873.1|CK065873
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|88315773|gb|CI617246.1|CI617246
EST:     GCTCAATGCGCCCAAGCATTTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCT
genomic: GCTCAATGCGCCCAAGCA-TTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTC-TGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCT
EST: gi|218492913|gb|FG948475.1|FG948475
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|2312066|gb|C28221.1|C28221
EST:     GGCTCAATGCGCCCANGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTN
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218482952|gb|FG948114.1|FG948114
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGAGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58679961|gb|CK068648.1|CK068648
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58657856|gb|CK046536.1|CK046536
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAANGTCCAGG-AGTGCCTGCCTCT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAA-GTCCAGGGAGTGCCTGCCTCT
EST: gi|58604163|gb|CK014691.1|CK014691
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58599482|gb|CK010010.1|CK010010
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33795164|gb|CF323455.1|CF323455
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|4968768|gb|AU065672.1|AU065672
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTNCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58603020|gb|CK013548.1|CK013548
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58600199|gb|CK010727.1|CK010727
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|10109160|gb|AU065212.2|AU065212
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58675481|gb|CK064168.1|CK064168
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218483029|gb|FG953126.1|FG953126
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218489228|gb|FG963522.1|FG963522
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218486385|gb|FG949950.1|FG949950
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58694556|gb|CK083243.1|CK083243
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218487571|gb|FG950380.1|FG950380
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAAGTGCCTGCCTCT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGG-AGTGCCTGCCTCT
EST: gi|58684768|gb|CK073455.1|CK073455
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33794358|gb|CF323065.1|CF323065
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58606021|gb|CK034054.1|CK034054
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCGGGG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|38568526|gb|CD670741.1|CD670741
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|4880159|gb|AU064458.1|AU064458
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58602882|gb|CK013410.1|CK013410
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58686311|gb|CK074998.1|CK074998
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|25801389|gb|CA757350.1|CA757350
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218479965|gb|FG945836.1|FG945836
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218486826|gb|FG963757.1|FG963757
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58601472|gb|CK012000.1|CK012000
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33381471|gb|CF196814.1|CF196814
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|55411270|gb|CV723646.1|CV723646
EST:     GGCTCAATGCGCCCAATCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58598744|gb|CK009272.1|CK009272
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58598952|gb|CK009480.1|CK009480
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|27577325|gb|CB000020.1|CB000020
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58684079|gb|CK072766.1|CK072766
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218487544|gb|FG968058.1|FG968058
EST:     -GCTCAATGCGCCCAA-CATTGGATGCTCGACAAGCTT-GTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCA-GGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218486783|gb|FG948675.1|FG948675
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218504242|gb|FG948960.1|FG948960
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCANGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218496697|gb|FG970617.1|FG970617
EST:     AGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: AGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58602001|gb|CK012529.1|CK012529
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58596442|gb|CK006970.1|CK006970
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58587724|gb|CF986032.1|CF986032
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58683341|gb|CK072028.1|CK072028
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGNAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58678411|gb|CK067098.1|CK067098
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58676236|gb|CK064923.1|CK064923
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218498953|gb|FG948074.1|FG948074
EST:     CTTGGTGGAGCTTTT                         G-CCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: CTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58598991|gb|CK009519.1|CK009519
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|13896943|gb|AU183279.1|AU183279
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58595491|gb|CK006019.1|CK006019
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58665146|gb|CK053832.1|CK053832
EST:     GCTCAATGCTGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GCTCAATGC-GCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218486731|gb|FG954849.1|FG954849
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58603838|gb|CK014366.1|CK014366
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCATGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58590692|gb|CF989000.1|CF989000
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218489438|gb|FG968542.1|FG968542
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58668210|gb|CK056896.1|CK056896
EST:     GCTCGACAAGCTTGGTGGAGC-TTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCA-GGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|10930923|gb|AU161197.1|AU161197
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58604536|gb|CK015064.1|CK015064
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|396941190|gb|HO188399.1|HO188399
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58590141|gb|CF988449.1|CF988449
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58670414|gb|CK059100.1|CK059100
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|38472791|gb|CF956923.1|CF956923
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|569313|gb|D40162.1|D40162
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33794997|gb|CF323378.1|CF323378
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|10109158|gb|AU065166.2|AU065166
EST:     GCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|38469781|gb|CF953912.1|CF953912
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33677989|gb|CF306228.1|CF306228
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218494879|gb|FG967110.1|FG967110
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58664091|gb|CK052777.1|CK052777
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGACTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58666929|gb|CK055615.1|CK055615
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGNAGTGCCTGCCTCT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGG-AGTGCCTGCCTCT
EST: gi|3766562|gb|AU030672.1|AU030672
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58692978|gb|CK081665.1|CK081665
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGNAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218492767|gb|FG946020.1|FG946020
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGAGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218483014|gb|FG962976.1|FG962976
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58677672|gb|CK066359.1|CK066359
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58601836|gb|CK012364.1|CK012364
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58603155|gb|CK013683.1|CK013683
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAG
EST: gi|58682638|gb|CK071325.1|CK071325
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGACTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|218498283|gb|FG961056.1|FG961056
EST:     GCTCAATGCGCGGCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGTGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GCTCAATGCGC-CCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58600652|gb|CK011180.1|CK011180
EST:     GGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCANGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|33795648|gb|CF323694.1|CF323694
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58588896|gb|CF987204.1|CF987204
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58603988|gb|CK014516.1|CK014516
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58685184|gb|CK073871.1|CK073871
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|427475|gb|D23541.1|D23541
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGT
EST: gi|218494001|gb|FG947410.1|FG947410
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGAC-AGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCA-GGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|38476535|gb|CF960668.1|CF960668
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58601990|gb|CK012518.1|CK012518
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
EST: gi|58682499|gb|CK071186.1|CK071186
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGGAGTGCCTGCCTCT
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCA-GGGAGTGCCTGCCTCT
EST: gi|33675017|gb|CF303256.1|CF303256
EST:     GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTT                         GCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG
genomic: GGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 70 (upstream exon), 73 (downstream exon)
Score: 181

GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgt ... tttaccatagGCCCCCAAGCCATCTTCTGGTCCTCACAAGTCCAGGGAGTGCCTGCCTCTGATCCTCATTATCAGGAACAGGCTCAAGTATGCTCTGACATACCGTGAGG




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GCAAGGGGTTTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCGCCCAAGCATTGGATGCTCGACAAGCTTGGTGGAGCTTTTgtaagtttgtcattcttgtttacacttaactacacatgcttgaagcttatcttttttttttctgttacctgatagcttatatttctaattaccttttaccatag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT