1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
GAAGAGAGACTTGCAGATGTAAAGGGTATAACCATCACTGCTGATGGGACAGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctctctctctctctgatacatggtttcaatagttcatacagtacaacttgtataaattcactattgtgcttaacagctcaatatatgtaaaattatccatgctttccactctgtctgggattcatattcttatgctattagctcaattgtatttggtactcaaaacatatgtcgtggtgttccacag
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os09g34910.1 |
intron # | 13 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29679594|gb|CB675869.1|CB675869
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88989220|gb|CI042333.1|CI042333
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: TTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29622801|gb|CB627812.1|CB627812
genomic: TTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89167538|gb|CI108939.1|CI108939
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29637933|gb|CB642942.1|CB642942
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88837446|gb|CI078806.1|CI078806
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: ATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACAATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCAAGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88831285|gb|CI082095.1|CI082095
genomic: ATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88839408|gb|CI005196.1|CI005196
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88836454|gb|CI078351.1|CI078351
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88964179|gb|CI045372.1|CI045372
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86488199|gb|CI130832.1|CI130832
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88241370|gb|CI241219.1|CI241219
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATGTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88964243|gb|CI045436.1|CI045436
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|218486017|gb|FG967018.1|FG967018
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAACAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGEST: gi|86508845|gb|CI151478.1|CI151478
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGG
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88997545|gb|CI390211.1|CI390211
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: CTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTCCCAEST: gi|89182627|gb|CI113996.1|CI113996
genomic: CTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAA-Ggtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCA
EST: TATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88850102|gb|CI091397.1|CI091397
genomic: TATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86488526|gb|CI131159.1|CI131159
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29628389|gb|CB633400.1|CB633400
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86255235|gb|CI062140.1|CI062140
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88241363|gb|CI241212.1|CI241212
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89197228|gb|CI051958.1|CI051958
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89198678|gb|CI016763.1|CI016763
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89173510|gb|CI041403.1|CI041403
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88243642|gb|CI244039.1|CI244039
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88903983|gb|CI006216.1|CI006216
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89173819|gb|CI041712.1|CI041712
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88265228|gb|CI369002.1|CI369002
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: TGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAEST: gi|88845347|gb|CI084272.1|CI084272
genomic: TGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCT-GCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCA
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86420902|gb|CI056891.1|CI056891
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89197091|gb|CI021931.1|CI021931
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88989423|gb|CI043894.1|CI043894
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|87008347|gb|CI301105.1|CI301105
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGEST: gi|87019448|gb|CI281949.1|CI281949
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTG
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88264631|gb|CI368405.1|CI368405
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTTGAAGACTATATTCAA- GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89185742|gb|CI047611.1|CI047611
genomic: AGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACCATTGCCACEST: gi|218504157|gb|FG948763.1|FG948763
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86435691|gb|CI106924.1|CI106924
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88215121|gb|CI214970.1|CI214970
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATGTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89175488|gb|CI042509.1|CI042509
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86872244|gb|CI323694.1|CI323694
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: CTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTCCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTTCCACEST: gi|87035352|gb|CI189974.1|CI189974
genomic: CTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29636722|gb|CB641731.1|CB641731
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29687238|gb|CB683513.1|CB683513
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88903465|gb|CI089003.1|CI089003
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: TTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29662539|gb|CB658814.1|CB658814
genomic: TTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|426929|gb|D23005.1|D23005
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88234152|gb|CI234001.1|CI234001
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|89179856|gb|CI044135.1|CI044135
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86417619|gb|CI031828.1|CI031828
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|218495874|gb|FG947056.1|FG947056
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: CGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTEST: gi|89174981|gb|CI041059.1|CI041059
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGT-GCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGT
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|88840501|gb|CI079955.1|CI079955
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29662538|gb|CB658813.1|CB658813
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|29672113|gb|CB668388.1|CB668388
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCACEST: gi|86482307|gb|CI124940.1|CI124940
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
EST: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGTTTGAAGACTATATTCAAG GTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
genomic: AGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctct ... tgttccacagGTGCACAGAACGCTGCCATGGTGACTGTCGAGGAAGTGAAACAATTGCCAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAAGAGAGACTTGCAGATGTAAAGGGTATAACCATCACTGCTGATGGGACAGGTGCTGTATTTGATGTTCCTTCAGCAGAGGTTGAAGACTATATTCAAGgtatacctctctctctctctgatacatggtttcaatagttcatacagtacaacttgtataaattcactattgtgcttaacagctcaatatatgtaaaattatccatgctttccactctgtctgggattcatattcttatgctattagctcaattgtatttggtactcaaaacatatgtcgtggtgttccacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA