Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcatagttttctattacttctaaatatgatctctctttcagtgtggttgataattaatattaatatatgttatgcag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os10g08550.3
intron # 12
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os10g08550.5 (Oryza sativa), 5'ss of exon 12
lower sequence: GRMZM2G048371_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 13
GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcatagttttctattacttctaaatatgatctctc---tttcagtgtggttgataattaatattaatatatg-----ttatgcag
 |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| | | ||||    || |||||||| ||||    |     | |||| ||||||  |     || | |||| |      || | |||
TTTTGACCAGGATGACTGGGTTCACTATGCTAAGATGACTGAAGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTTGGTGATGACCTTCTCGTCACCAACCCCACTgtcagtaccttgtttct--ttccttctaaagatgacaattaaaactccagtttggttgtcataagttacttatatcttaacattttttcag

upper sequence: LOC_Os10g08550.5 (Oryza sativa), 5'ss of exon 12
lower sequence: GLYMA09G28100.1 (Glycine max), 5'ss of exon 12
GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcatagttttctattacttctaaa-tatgatctctctttcagtgtggttgataat-taatattaatatatgttatgcag
 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||  |   ||| |    ||  |  | | |  |||| |||     |  || |  |||| ||| |  | |  || |||    |  ||
ATTTGATCAGGATGACTGGGAGCACTATGCAAAATTAACAGCTGAAGTTGGCCAGCAGGTGCAGATTGTTGGTGATGATCTCCTTGTCACCAACCCAAAGgtatgc-tatattaacttaaaatctgtgacctatgttctgcaaatatgtatcattgacaatgttctgtctat-tattaactctag

upper sequence: LOC_Os10g08550.5 (Oryza sativa), 5'ss of exon 12
lower sequence: GLYMA16G32960.1 (Glycine max), 5'ss of exon 12
GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcatagttttctattacttctaaatatgatctctctttcagtgtggttgataat-taatat-taatatatgttatgcag
 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||   |||    ||  || | | |   | ||||| |||     |  || |  |||| ||| |  | | || |||    | || ||
ATTTGATCAGGATGACTGGGAGCACTATGCGAAATTAACAGCTGAAGTTGGCCAGCAAGTGCAGATTGTTGGTGATGATCTCCTCGTCACCAACCCGAAGgta--tgctatattaactttaaatctgagatatgttctgcaaatatgtatcattgacaatgttctgtctattattaactctgtag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88993393|gb|CI257821.1|CI257821
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCTACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29639494|gb|CB644503.1|CB644503
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|58689303|gb|CK077990.1|CK077990
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29659076|gb|CB655351.1|CB655351
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACTTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88244697|gb|CI243819.1|CI243819
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGGAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88975303|gb|CI023554.1|CI023554
EST:     CAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: CAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|319908690|gb|HS977818.1|HS977818
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAGGGCAATTCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAAT-CCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
EST: gi|87029624|gb|CI257419.1|CI257419
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|33687081|gb|CF315320.1|CF315320
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29682710|gb|CB678985.1|CB678985
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|319908492|gb|HS977620.1|HS977620
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAGGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|428072|gb|D24220.1|D24220
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGNTCTTCTGNTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88245189|gb|CI245038.1|CI245038
EST:     AGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: AGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29688337|gb|CB684612.1|CB684612
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29682744|gb|CB679019.1|CB679019
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87024714|gb|CI259429.1|CI259429
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTGGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|218500949|gb|FG958836.1|FG958836
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89175437|gb|CI042458.1|CI042458
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86418806|gb|CI053607.1|CI053607
EST:     TCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87031683|gb|CI259867.1|CI259867
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87022025|gb|CI259097.1|CI259097
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGGTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29667980|gb|CB664255.1|CB664255
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88964233|gb|CI045426.1|CI045426
EST:     TGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88248419|gb|CI248268.1|CI248268
EST:     TCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|396941266|gb|HO188475.1|HO188475
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29656583|gb|CB652858.1|CB652858
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29678863|gb|CB675138.1|CB675138
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89197056|gb|CI021896.1|CI021896
EST:     TCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29657925|gb|CB654200.1|CB654200
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86854500|gb|CI256622.1|CI256622
EST:     AGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACCA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
genomic: AGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAA-CAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
EST: gi|5003991|gb|AU069140.1|AU069140
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88246429|gb|CI246278.1|CI246278
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|58586119|gb|CF984427.1|CF984427
EST:     TCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87026975|gb|CI259628.1|CI259628
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|8527461|gb|AU092276.1|AU092276
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTNTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89182631|gb|CI114000.1|CI114000
EST:     GTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCTACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29665471|gb|CB661746.1|CB661746
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87018836|gb|CI256721.1|CI256721
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29626887|gb|CB631898.1|CB631898
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88976975|gb|CI257671.1|CI257671
EST:     AGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: AGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|8527433|gb|AU092248.1|AU092248
EST:     CAGATTGTCGGTGATGA-CTCCTTTGTCACCACCCCAACA                         AGGTTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: CAGATTGTCGGTGATGACCTCC-TTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|319908681|gb|HS977809.1|HS977809
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86823708|gb|CI258759.1|CI258759
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCTACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29656517|gb|CB652792.1|CB652792
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|38476678|gb|CF960811.1|CF960811
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86854464|gb|CI256586.1|CI256586
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88990711|gb|CI108098.1|CI108098
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|2797642|gb|AA750936.1|AA750936
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29668593|gb|CB664868.1|CB664868
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87025979|gb|CI257137.1|CI257137
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29659231|gb|CB655506.1|CB655506
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|13919361|gb|AU183604.1|AU183604
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86594858|gb|CI258112.1|CI258112
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29664967|gb|CB661242.1|CB661242
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|33685910|gb|CF314149.1|CF314149
EST:     AGAGCAAGTGCAGATTGTCNGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: AGAGCAAGTGCAGATTGTC-GGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|8527772|gb|AU092587.1|AU092587
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|163929530|gb|EG713473.1|EG713473
EST:     GCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89198407|gb|CI007467.1|CI007467
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86594997|gb|CI258251.1|CI258251
EST:     CAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: CAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86434641|gb|CI105874.1|CI105874
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88832140|gb|CI017374.1|CI017374
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87024196|gb|CI256937.1|CI256937
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86420628|gb|CI056617.1|CI056617
EST:     ACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: ACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|8527343|gb|AU092158.1|AU092158
EST:     AGANCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: AGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCT-CCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88965930|gb|CI006720.1|CI006720
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87018887|gb|CI256772.1|CI256772
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86595026|gb|CI260265.1|CI260265
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29678679|gb|CB674954.1|CB674954
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29656516|gb|CB652791.1|CB652791
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88839366|gb|CI000838.1|CI000838
EST:     TCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: TCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|5003112|gb|AU068221.1|AU068221
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86854672|gb|CI258965.1|CI258965
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89173986|gb|CI041879.1|CI041879
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTAGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88832286|gb|CI017520.1|CI017520
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|88247000|gb|CI246849.1|CI246849
EST:     AGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: AGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87025981|gb|CI257139.1|CI257139
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCTACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|163926063|gb|EG715019.1|EG715019
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86500463|gb|CI143096.1|CI143096
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|38477733|gb|CF961866.1|CF961866
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|87029590|gb|CI257385.1|CI257385
EST:     GCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACCA                         GGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
genomic: GCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAA-CAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAA
EST: gi|86594976|gb|CI258230.1|CI258230
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGCCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86594023|gb|CI260252.1|CI260252
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29668023|gb|CB664298.1|CB664298
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29644082|gb|CB649089.1|CB649089
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|89186121|gb|CI047990.1|CI047990
EST:     GCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|29659075|gb|CB655350.1|CB655350
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCANAGGCAATCCA
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCA
EST: gi|87031154|gb|CI259734.1|CI259734
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|86593390|gb|CI258030.1|CI258030
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|58592547|gb|CF990855.1|CF990855
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
EST: gi|319908667|gb|HS977795.1|HS977795
EST:     GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACA                         AGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG
genomic: GAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 213

GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcat ... tgttatgcagAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAG




<











<


<









Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAgtgagtgcatagttttctattacttctaaatatgatctctctttcagtgtggttgataattaatattaatatatgttatgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT