1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
CCTGCCCTCTTGTACATTGTTCCTGGTGTGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgttaccactgaacatggttgttcccacttgtccattactctgaaccttgagagtagctcaatgaataccattgtcgagcgtgttgcgtgtac...
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g02530.2 |
intron # | 11 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88227056|gb|CI228536.1|CI228536
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: AATGGAGAAGTCATGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88246627|gb|CI246476.1|CI246476
genomic: AATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86524533|gb|CI164739.1|CI164739
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88268455|gb|CI378390.1|CI378390
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86536960|gb|CI177166.1|CI177166
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88509713|gb|CI437219.1|CI437219
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|3768652|gb|AU032679.1|AU032679
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGANTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|89190059|gb|CI013626.1|CI013626
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88967087|gb|CI392049.1|CI392049
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: GTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88260322|gb|CI362615.1|CI362615
genomic: GTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATT-GTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88414263|gb|CI533633.1|CI533633
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: GTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88263333|gb|CI367107.1|CI367107
genomic: GTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88269221|gb|CI380519.1|CI380519
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88831057|gb|CI080481.1|CI080481
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: GTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAAGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|3764135|gb|AU030635.1|AU030635
genomic: GTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88960867|gb|CI382548.1|CI382548
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: ATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86838884|gb|CI330313.1|CI330313
genomic: ATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGGAEST: gi|88305006|gb|CI545377.1|CI545377
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86505531|gb|CI148164.1|CI148164
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|29629872|gb|CB634881.1|CB634881
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|89180263|gb|CI044542.1|CI044542
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88841193|gb|CI080647.1|CI080647
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86431949|gb|CI085560.1|CI085560
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|11026295|gb|AU162896.1|AU162896
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|89191319|gb|CI393172.1|CI393172
genomic: TGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: GTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|13896899|gb|AU183235.1|AU183235
genomic: GTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88428292|gb|CI562558.1|CI562558
genomic: TTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|8858846|gb|AU096164.1|AU096164
genomic: TATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88974741|gb|CI023037.1|CI023037
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88268306|gb|CI378241.1|CI378241
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88485318|gb|CI422589.1|CI422589
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88227079|gb|CI228559.1|CI228559
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCATGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88201253|gb|CI201608.1|CI201608
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86603967|gb|CI114741.1|CI114741
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86251700|gb|CI018892.1|CI018892
genomic: TTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|87031167|gb|CI259747.1|CI259747
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88838406|gb|CI373766.1|CI373766
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88365207|gb|CI540519.1|CI540519
genomic: TTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: AAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88836000|gb|CI371105.1|CI371105
genomic: AAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGGCTGAAGAGGAAGATGCTCTTGAAGAEST: gi|88321242|gb|CI532992.1|CI532992
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAA-GGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGA
EST: GAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88480445|gb|CI417716.1|CI417716
genomic: GAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: GCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|89168583|gb|CI038937.1|CI038937
genomic: GCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86428283|gb|CI074964.1|CI074964
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88295845|gb|CI532806.1|CI532806
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|29660567|gb|CB656842.1|CB656842
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|88200485|gb|CI200335.1|CI200335
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|29631479|gb|CB636488.1|CB636488
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAAEST: gi|86838298|gb|CI327689.1|CI327689
genomic: TGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
EST: TTCACTGTTTAT-GAATGGAGAAGTCAAGCCA CTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
genomic: TTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgt ... acattgccagCTCCTGGAGTACAACGAGTCAAAGGCTGAAGAGGAAGATGCTGTTGAAGAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCTGCCCTCTTGTACATTGTTCCTGGTGTGATTGGTTTTGTTGCTGTTCACTGTTTATGGAATGGAGAAGTCAAGCCAgtaagtctgttaccactgaacatggttgttcccacttgtccattactctgaaccttgagagtagctcaatgaataccattgtcgagcgtgttgcgtgtac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT