Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os05g49200.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM2G065757_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 10
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| || | || |||   |               ||||||  ||   |||   |    |  ||||        ||  |   |  ||         ||||  || ||||| | |    ||  ||         ||||||   |  |  || |||  | || || |||| ||||||||
ACACAACCAGCGAAGATCTGTTCTCAGGTTGGTCTGTGCACTTTTGATGGCACCCATGGTGTCAGgtgagtattgtaaacaat--------------gtctgtagtgtgacatagcctgccatgaactc--------atgataacgataatcatctgggcaatcctgtcttatatta---tggtgtc--------cctgtacct-catttgttcctttgctatatgctatgcaaacacag

upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM2G035636_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 10
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| || | || |||   |               ||||||  ||   |||   |    |  ||||        ||  |   |  ||         ||||  || ||||| | |    ||  ||         ||||||   |  |  ||||||  | || || |||  ||||||||
ACACAACCAGCGAAGATCTGTTCTCAGGTTGGTCTGTGCACTTTTGATGGCACTCATGGTGTCAGgtgagtattgtaaacaat--------------gtctgtagtgtgacatagcctgccatgaactc--------atgataacgataaccatctgggcaatcctgtcttatatta---tggtgtc--------cctgtacct-catttgtttctttgctatatgctatacaaacacag

upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM2G370357_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 8
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| || | || |||   |               ||||||  ||   |||   |    |  ||||        ||  |   |  ||         ||||  || ||||| | |    ||  ||         ||||||   |  |  ||||||  | || || |||  ||||||||
ACACAACCAGCGAAGATCTGTTCTCAGGTTGGTCTGTGCACTTTTGATGGCACTCATGGTGTCAGgtgagtattgtaaacaat--------------gtctgtagtgtgacatagcctgccatgcactc--------atgataacgataaccatctgggcaatcctgtcttatatta---tggtgtc--------cctgtacct-catttgtttctttgctatatgctatacaaacacag

upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM5G899123_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| || | || |||   |               ||||||  ||   |||   |    |  ||||        ||  |   |  ||         ||||  || ||||| | |    ||  ||         ||||||   |  |  ||||||  | || || |||  ||| ||||
ACACAACCAGCGAAGATCTGTTCTCAGGTTGGTCTGTGCACTTTTGATGGCACTCATGGTGTCAGgtgagtattgtaaacaat--------------gtctgtagtgtgacatagcctgccatgaactc--------atgataacgataaccatctgggcaatcctgtcttatatta---tggtgtc--------cctgtacct-catttgtttctttgctatatgttatacaaaaacag

upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM2G057724_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 13
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttggtgtcaagtgctatatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| || | || |||   |               ||||||  ||   |||   |    |  ||||        ||  |   |  ||         ||||  || ||||| | |    ||  ||         ||||||   |  |  ||||||  | || || |||  ||||||||
ACACAACCAGCGAAGATCTGTTCTCAGGTTGGTCTGTGCACTTTTGATGGCACTCATGGTGTCAGgtgagtattgtaaacaat--------------gtctgtagtgtgacatagcctgccatgaactc--------atgataacgataaccatctgggcaatcttgtcttatatta---tggtgtc--------cctgtacct-catttgtttctttgctatatgctatacaaacacag

upper sequence: LOC_Os05g49200.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
lower sequence: AT1G11910.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 10
ACACAGCCATCAAAAATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactgcaaatgtttttcaagtgtctgaatctgtaaagtaggatattttcgttttgactcgattagcgattttg--gtgtcaagtgct-atatcaattatgacttatttgagatcggattcgtaggcaatctgtactcactctcatttcttctccatgtggtatgtaaacacag
|| || ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| |  |  ||     | |  |||   ||   |  |||  |||||  | ||| |||||    | ||     ||||   |||| |  |||| ||||  | ||||| ||  || | |    ||                                                       
ACCCAACCGAAGAAAATCTGCTCGCAGATTGGTCTGTGTACTTTTGATGGTACCCGTGGTGTCAGgtaa-agttataa-----tctgtagtcattg--ccattaagctagga--tcttcattttggaatgcttgtttgtttttccgtgtgatctgctcatatttagtatgattttgtttataaattatctag---------------------------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|29681832|gb|CB678107.1|CB678107
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|86478235|gb|CI120868.1|CI120868
EST:     TACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: TACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|33795396|gb|CF323568.1|CF323568
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29637769|gb|CB642778.1|CB642778
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29643319|gb|CB648326.1|CB648326
EST:     ATTTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29664333|gb|CB660608.1|CB660608
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29687282|gb|CB683557.1|CB683557
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58668482|gb|CK057168.1|CK057168
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|33683538|gb|CF311777.1|CF311777
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58596651|gb|CK007179.1|CK007179
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAAATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29667542|gb|CB663817.1|CB663817
EST:     CTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: CTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|125863426|gb|EL586708.1|EL586708
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58672644|gb|CK061330.1|CK061330
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|117249803|gb|CT863399.1|CT863399
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29660446|gb|CB656721.1|CB656721
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29637768|gb|CB642777.1|CB642777
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29686812|gb|CB683087.1|CB683087
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58668099|gb|CK056785.1|CK056785
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29660450|gb|CB656725.1|CB656725
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29674325|gb|CB670600.1|CB670600
EST:     ACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|218501795|gb|FG948052.1|FG948052
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58666355|gb|CK055041.1|CK055041
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|4714483|gb|AU058450.1|AU058450
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29627822|gb|CB632833.1|CB632833
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58587529|gb|CF985837.1|CF985837
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29639174|gb|CB644183.1|CB644183
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29643321|gb|CB648328.1|CB648328
EST:     ATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29675906|gb|CB672181.1|CB672181
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29677889|gb|CB674164.1|CB674164
EST:     CTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: CTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|218480608|gb|FG959514.1|FG959514
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTACTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAGTGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29660990|gb|CB657265.1|CB657265
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|87031014|gb|CI270162.1|CI270162
EST:     GGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGG-ATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: GGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|218495569|gb|FG950148.1|FG950148
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29657723|gb|CB653998.1|CB653998
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|88396547|gb|CI601030.1|CI601030
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAA
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAA
EST: gi|29639940|gb|CB644949.1|CB644949
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58592991|gb|CF991299.1|CF991299
EST:     TCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCGATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: TCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGC-ATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29669083|gb|CB665358.1|CB665358
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29642552|gb|CB647559.1|CB647559
EST:     AGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: AGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|33381232|gb|CF196575.1|CF196575
EST:     ATCTGCTCTCANNTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTANGAGTGTAGTNNATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|58599924|gb|CK010452.1|CK010452
EST:     ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGTGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: ATCTGCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|33680890|gb|CF309129.1|CF309129
EST:     TTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: TTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
EST: gi|29675129|gb|CB671404.1|CB671404
EST:     GCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAG                         TGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT
genomic: GCTCTCAGGTTGGTCTGTGTACTTTTGATGGGAAGCATGGTGTTAGgtaagaactg ... gtaaacacagTGCTGGAATTAAGAGCGTAGTAGATGATGAAGCTGGGGAATCGAATGGTCT