1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
GGGCCAAAATTTTGCTAAAATGTTTGAGATAAACTTTGAAAATGAAAAGGGAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagctttaatttcttgaatatacattcattggaggattcctctacatcatattgcatctatatttgttttttttaacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G40930.4 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCGATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCEST: gi|207831009|gb|GD805067.1|GD805067
genomic: TATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTC-ATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACC
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCTEST: gi|208199816|gb|GD998559.1|GD998559
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAAGGGATTGGTACTACCEST: gi|208174450|gb|GD968159.1|GD968159
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAA-GGGATTGGTACTACC
EST: GAGAGAAAGCGATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGEST: gi|207734424|gb|GD713312.1|GD713312
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGG
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGT-CTACCTEST: gi|58014455|gb|CX701197.1|CX701197
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCNTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCTEST: gi|208320376|gb|GE122097.1|GE122097
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCTEST: gi|207783076|gb|GD751077.1|GD751077
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
EST: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACT ATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
genomic: GAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagcttta ... tttttaacagATTGGGGTCATGGTGATGGTTCATGGTGATGACAAGGGATTGGTACTACCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGGCCAAAATTTTGCTAAAATGTTTGAGATAAACTTTGAAAATGAAAAGGGAGAGAAAGCAATGGTCTGGCAGAATTCATGGGCCTATAGTACTCGAACTgtaagctttaatttcttgaatatacattcattggaggattcctctacatcatattgcatctatatttgttttttttaacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA