1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
TGCGCAGAACCAGTGGACTAATTATGGAGTTCAACCTCAAACTTGGCCTCCAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagtatcctttcctttgtgttaattgggtttatatgtgtgacccactgatgttggagattttttttgagacatgtagtctgtcaaatggtttaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G35140.3 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGNGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAAEST: gi|16105366|gb|BI893106.1|BI893106
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAAEST: gi|14991640|gb|BI317313.1|BI317313
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAAEST: gi|4296151|gb|AI442434.1|AI442434
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAAEST: gi|8283952|gb|BE021511.1|BE021511
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATNCGCAAEST: gi|151410949|gb|EV280764.1|EV280764
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
EST: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAG GCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
genomic: CAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagt ... tttgatacagGCTTCCTACGGGGCTTATGCTGGATATGGGAGCAACTATGTAAATTCGCAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCGCAGAACCAGTGGACTAATTATGGAGTTCAACCTCAAACTTGGCCTCCAGTTACTCAAGCTCAAGGGCAACAATGGACTGCTGGCTACACCCAGCAGgtagagtagtatcctttcctttgtgttaattgggtttatatgtgtgacccactgatgttggagattttttttgagacatgtagtctgtcaaatggtttaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA