1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
GGAAAGTTACTGGGAAACAATGAAATCAGGAGTTGCTGACATGTTGAACACTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcactaaatcatgatatagatcatgttattttctgaatgatatatactgctattttttcgctccatgtttcccctagtgattgtgtttcatccaaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G08150.1 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGAATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTGEST: gi|5606960|gb|AI901058.1|AI901058
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTGEST: gi|208283429|gb|GE087239.1|GE087239
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTGEST: gi|6848834|gb|AW351124.1|AW351124
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTGEST: gi|208260108|gb|GE058976.1|GE058976
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
EST: GCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTGEST: gi|151393193|gb|EV263068.1|EV263068
genomic: GCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcctttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGCTGGTCCTGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGAAAGTTACTGGGAAACAATGAAATCAGGAGTTGCTGACATGTTGAACACTGGTGGTCGACAAGGTGGTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcactaaatcatgatatagatcatgttattttctgaatgatatatactgctattttttcgctccatgtttcccctagtgattgtgtttcatccaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tttcccc