1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
GGGAAAGTTACTGGGAAACAATGAAATCAGGAGTTGCTGACATGTGAACACTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcactaaatcatgatatagatcatgttattttctgaatgatatatactgctattttttcgctccatgtttcccctagtgattgtgtttcttccaaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G19350.1 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGACTAGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|193718663|gb|FK652619.1|FK652619
genomic: GGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGG-CT-GCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|21601604|gb|BQ611935.1|BQ611935
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|7030141|gb|AW459924.1|AW459924
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGGTGGTCCTATGEST: gi|193326372|gb|FK289369.1|FK289369
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|193631239|gb|FK583700.1|FK583700
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|208294766|gb|GE094753.1|GE094753
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|193446139|gb|FK412264.1|FK412264
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|208308069|gb|GE105045.1|GE105045
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|193450338|gb|FK413956.1|FK413956
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|208229724|gb|GE026075.1|GE026075
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGCTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|193710703|gb|FK644661.1|FK644661
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|208068449|gb|GD862295.1|GD862295
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|208106078|gb|GD905075.1|GD905075
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATGEST: gi|207816373|gb|GD786682.1|GD786682
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
EST: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAG TTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
genomic: CTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcacta ... tcccttacagTTTGTTGATGAAAAGGTTCAATGGATGCACATTGACATGGTTGGTCCTATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGGAAAGTTACTGGGAAACAATGAAATCAGGAGTTGCTGACATGTGAACACTGGTGGTCGACAAGGTGCTGCTATTGTGGCTGCTCTCTTCTTAAAACAGgtttgcactaaatcatgatatagatcatgttattttctgaatgatatatactgctattttttcgctccatgtttcccctagtgattgtgtttcttccaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tttcccc