Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttctttgccttagtttatcatggtgtcctatattatcttcttcagggttccctgatttttgttcttgctactgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G42180.1
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|15285661|gb|BI469552.1|BI469552
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACATTATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
EST: gi|10709284|gb|BF009008.1|BF009008
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
EST: gi|12690109|gb|BG156445.1|BG156445
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
EST: gi|151401292|gb|EV271106.1|EV271106
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
EST: gi|24205755|gb|BU965008.1|BU965008
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
EST: gi|15663984|gb|BI701355.1|BI701355
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCTATGCTACAAGAGCTTGGCAAACAAAATCCCCATCTAATGAGATTGATT