Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGGgtacgtaaaattgataactttgtataagttgttttaatatcaatgtttattttataactgttgtacttcaagttcaacagtaacaccttatctacagtaa...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G34820.1
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|51338462|gb|CO982328.1|CO982328
EST:     GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGG                         GTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
genomic: GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGGgtacgtaaaa ... accaatgcagGTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
EST: gi|51344538|gb|CO985271.1|CO985271
EST:     GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGG                         GTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
genomic: GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGGgtacgtaaaa ... accaatgcagGTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
EST: gi|151406306|gb|EV276121.1|EV276121
EST:     GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGG                         GTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
genomic: GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGGgtacgtaaaa ... accaatgcagGTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
EST: gi|18726842|gb|BM523788.1|BM523788
EST:     GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGG                         GTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT
genomic: GCTTGGCTCTATGGATTAGCATGGGCACCTTGGgtacgtaaaa ... accaatgcagGTACCATACTTAAGTGCCTCTTTTGGTATCATCTATGTCCTTGTGAAACCT