1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
TGCTTCTTTCCTCAGAATATGATCGAACATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaatcagcacattgtttatcctgtattatgttaatgattttagtacctgattatatgctaattacacggaacacatatcttcgtttgtccttt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G00930.1 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAATEST: gi|193424232|gb|FK386385.1|FK386385
genomic: ATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
EST: AACGCTGCTTATTGATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAATEST: gi|193551911|gb|FK506526.1|FK506526
genomic: AACGCTGCTTA-TGATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
EST: CTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAATEST: gi|22931797|gb|BU548936.1|BU548936
genomic: CTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
EST: ATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAATEST: gi|10847673|gb|BF070320.1|BF070320
genomic: ATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
EST: G-TGAAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGAATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCATTGGCTCTTGGAATEST: gi|193380557|gb|FK347339.1|FK347339
genomic: GTTG-AGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATG-ATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
EST: AACGCTGCTTATGATGTGTGGCAG GTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
genomic: AACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaa ... tttttatcagGTCCAAGCTAGTTTAGCCCCACCTTCAGCTGACCGCCTTGGCTCTTGGAAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCTTCTTTCCTCAGAATATGATCGAACATGTTGAGACCCCATTGTTTCTACTCAACGCTGCTTATGATGTGTGGCAGgtaacatgaatcagcacattgtttatcctgtattatgttaatgattttagtacctgattatatgctaattacacggaacacatatcttcgtttgtccttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT