Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttctttgccttagtttatcatggtatcctatattatcttcttcagggttccctgatttttgttcctgctactgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G24850.3
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|10254784|gb|BE822550.1|BE822550
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|192320974|gb|FK013490.1|FK013490
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|192320975|gb|FK013491.1|FK013491
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAG-CTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCA
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCA
EST: gi|4395777|gb|AI494774.1|AI494774
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCC-ATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGA-GCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|254324070|gb|GR840495.1|GR840495
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|19453172|gb|BM954582.1|BM954582
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|4396121|gb|AI495118.1|AI495118
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|254331167|gb|GR843286.1|GR843286
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|254324071|gb|GR840496.1|GR840496
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|254346641|gb|GR856363.1|GR856363
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|22525766|gb|BU084577.1|BU084577
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|21256745|gb|BQ453633.1|BQ453633
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
EST: gi|16995756|gb|BM085128.1|BM085128
EST:     TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAG                         CCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT
genomic: TTCCAAGCCTTGCGAGCTATGGTGCAGGCTAATCCACAAATATTGCAGgttttcttct ... gctactgcagCCAATGCTACAAGAGCTTGGCAAGCAAAATCCCCATCTTATGAGATTGATT