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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATATAGAGACAGCAGATAGGCCGGGATTGCTGGTTGAAATCATCAAAGTCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcctctttgtctctgtccgcctctgcttgattcatttaccctaagtaactttacccccctttctctcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G24450.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193442567|gb|FK409694.1|FK409694
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|192327126|gb|FK015518.1|FK015518
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCCAAGGATACATTTCATGT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGT
EST: gi|208305267|gb|GE105306.1|GE105306
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193500003|gb|FK465130.1|FK465130
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTCGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAG
EST: gi|193593454|gb|FK546630.1|FK546630
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208218072|gb|GE018736.1|GE018736
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGG
EST: gi|208103740|gb|GD908085.1|GD908085
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193628870|gb|FK577706.1|FK577706
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208255227|gb|GE053944.1|GE053944
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193615666|gb|FK561543.1|FK561543
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAA
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAA
EST: gi|208028783|gb|GD823223.1|GD823223
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193591472|gb|FK547357.1|FK547357
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCAT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCAT
EST: gi|193571530|gb|FK532761.1|FK532761
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTT
EST: gi|207693661|gb|GD676272.1|GD676272
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193541724|gb|FK497096.1|FK497096
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCT
EST: gi|208225220|gb|GE025387.1|GE025387
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTT
EST: gi|208250039|gb|GE050002.1|GE050002
EST:     ATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAAGTACGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTA
genomic: ATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGA-GT-CGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTA
EST: gi|193493230|gb|FK460036.1|FK460036
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCGTGCAT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGG-TTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGC-TGCAT
EST: gi|208268877|gb|GE068556.1|GE068556
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAG
EST: gi|208157472|gb|GD954646.1|GD954646
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208232234|gb|GE029019.1|GE029019
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208104123|gb|GD902252.1|GD902252
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208305327|gb|GE107452.1|GE107452
EST:     TCATCGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193515762|gb|FK474332.1|FK474332
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193360070|gb|FK327220.1|FK327220
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGC
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGC
EST: gi|208270251|gb|GE070867.1|GE070867
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208040252|gb|GD842060.1|GD842060
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GATTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208242719|gb|GE039267.1|GE039267
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGG
EST: gi|193450808|gb|FK415196.1|FK415196
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193425808|gb|FK387393.1|FK387393
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193496471|gb|FK462365.1|FK462365
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGG
EST: gi|193634085|gb|FK581151.1|FK581151
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193319188|gb|FK286360.1|FK286360
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGT
EST: gi|193398778|gb|FK365190.1|FK365190
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|207709109|gb|GD692205.1|GD692205
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACGGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208127450|gb|GD921682.1|GD921682
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATA
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATA
EST: gi|208085729|gb|GD880611.1|GD880611
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193328882|gb|FK297016.1|FK297016
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGG-CTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208286991|gb|GE082177.1|GE082177
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGG
EST: gi|193385975|gb|FK351141.1|FK351141
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193387567|gb|FK350912.1|FK350912
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATT
EST: gi|208054046|gb|GD854883.1|GD854883
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTACATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193547822|gb|FK505103.1|FK505103
EST:     ATTGCAGATGTAAAACAATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: ATTGCAGATGT-AAAC-ATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|208304633|gb|GE106072.1|GE106072
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193704387|gb|FK646559.1|FK646559
EST:     TCATTGCAGATGTGAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193576648|gb|FK533731.1|FK533731
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGT
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGT
EST: gi|193572823|gb|FK528678.1|FK528678
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATG
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATG
EST: gi|193629312|gb|FK572856.1|FK572856
EST:     TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTC
genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTC
EST: gi|298177815|gb|HO027368.1|HO027368
EST:     CATTGCAGATGTAAACATTGATGTTG-GATCGGCTGAGATTGATACAGAG                         GGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
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genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTA
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genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG
EST: gi|193361532|gb|FK325238.1|FK325238
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genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTAC
EST: gi|207692226|gb|GD675389.1|GD675389
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genomic: TCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcct ... tttctctcagGGTTTGGTTGCTAAGGATACATTTCATGTTAGTTACGGCGGGGCTGCATTG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTATATAGAGACAGCAGATAGGCCGGGATTGCTGGTTGAAATCATCAAAGTCATTGCAGATGTAAACATTGATGTTGAGTCGGCTGAGATTGATACAGAGgtatcttcctctttgtctctgtccgcctctgcttgattcatttaccctaagtaactttacccccctttctctcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGATG